tert-butyl (3R)-3-(pyridine-2-amido)piperidine-1-carboxylate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡啶及其衍生物
• 英文名称: tert-butyl (3R)-3-(pyridine-2-amido)piperidine-1-carboxylate
• 英文别名: tert-butyl (3R)-3-(pyridine-2-carbonylamino)piperidine-1-carboxylate；(R)-tert-Butyl 3-(pyridine-2-carbonylamino)piperidine-1-carboxylate
• 化学式: C₁₆H₂₃N₃O₃
• 分子量: 305.377
• InChiKey: DBAXEMVCZVGTHL-GFCCVEGCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.9
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  71.5
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl (3R)-3-(pyridine-2-amido)piperidine-1-carboxylate 在 2,6-二甲基苯甲酸 、 palladium diacetate 、 silver carbonate 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 40.0h， 生成 N-(3R,5R)-5-(4-methoxyphenyl)piperidin-3-ylpicolinamide
  参考文献：
  名称：

  SETDB1 Tudor 域的强效选择性细胞活性抑制剂的结构引导发现

  摘要：

  SET 域分叉蛋白 1 (SETDB1) 是一种组蛋白赖氨酸甲基转移酶，可促进某些肿瘤抑制基因的沉默，并在许多癌症中过度表达。SETDB1 包含一个独特的串联 tudor 域 (TTD)，可识别包含甲基化和乙酰化赖氨酸的组蛋白 H3 序列。从鉴定命中化合物 ( Cpd1 ) 开始，我们通过逐步结构引导优化发现了第一个有效且选择性的小分子 SETDB1-TTD 抑制剂( R , R )-59。( R , R )-59在 ITC 测定中显示 K D值为 0.088±0.045 μM。的高效力（[R ，R )-59可以通过( R , R )-59 -TTD 复合物的共晶结构得到很好的解释。( R , R )-59是一种内源性结合剂竞争性抑制剂。证据也证明了它的细胞目标参与。有趣的是，对映异构体( S , S )-59在所有分析中均未显示活性，突出了( R , R )-59作为探索 SETDB1-TTD

  DOI：

  10.1002/anie.202017200
• 作为产物：
  描述：

  (R)-(-)-1-Boc-3-氨基哌啶 、 2-吡啶甲酸 在 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以85%的产率得到tert-butyl (3R)-3-(pyridine-2-amido)piperidine-1-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  发现Pyrrolo [3,2-d]嘧啶-4-酮衍生物是一类新的P300 / CBP相关因子Bromodomain的强力和细胞活性抑制剂。

  摘要：

  本文中，我们报告了一系列新的P300 / CBP相关因子（PCAF）溴结构域（BRD）抑制剂的发现，这些抑制剂是通过命中发现过程以及随后针对检索到的命中的基于结构的优化和构效关系分析而获得的化合物（12）。在这些抑制剂中，（R，R）-36n是最有效的抑制剂，在均相时间分辨荧光测定中的IC50为7 nM，在等温滴定量热测定中的KD为78 nM。该化合物还显示出对GCN5和FALZ的活性，但对其他29种BRD蛋白和422个激酶的活性较弱或没有活性，表明具有相当大的选择性。X射线共晶结构分析揭示了分子相互作用模式和生物活性所需的精确立体化学。细胞活性，初步RNA-seq分析，并且还研究了该化合物的药代动力学性质。总的来说，这项研究为探索PCAF BRD调控的分子机制提供了一种通用的工具分子，还为靶向PCAF的药物发现提供了一种新的先导化合物。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.9b00096

文献信息

• Pd(<scp>ii</scp>)-Catalyzed gamma-C(sp³)–H alkynylation of amides: selective functionalization of R chains of amides R¹C(O)NHR
  作者：Vinod G. Landge、Ayisha Parveen、Avanashiappan Nandakumar、Ekambaram Balaraman

  DOI：10.1039/c8cc03445a

  日期：——

  of R chains of amides R1C(O)NHR, a fundamental class of synthetic substrates, has not been accomplished to date. Here, the first example of palladium(II)-catalyzed alkynylation of an unactivated gamma C(sp3)–H bond of alkyl amides (cyclic, linear, and amino acids) is reported. The kinetic experiment shows that the rate of the reaction depends on the coupling partners and the amides. Late-stage diversification

  到目前为止，尚未完成酰胺R 1 C（O）NHR的R链的C链C（sp 3）-H键的炔基化反应。在此，报道了钯（II）催化烷基酰胺（环状，线性和氨基酸）的未活化γC（sp 3）-H键的炔基化反应的第一个例子。动力学实验表明，反应速率取决于偶联伙伴和酰胺。通过利用胺和炔烃官能团开发了烷基化酰胺的后期多样化产品。
• Discovery of Pyrrolo[3,2-<i>d</i>]pyrimidin-4-one Derivatives as a New Class of Potent and Cell-Active Inhibitors of P300/CBP-Associated Factor Bromodomain
  作者：Luyi Huang、Hui Li、Linli Li、Lu Niu、Raina Seupel、Chengyong Wu、Wei Cheng、Chong Chen、Bisen Ding、Paul E. Brennan、Shengyong Yang

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b00096

  日期：2019.5.9

  Herein, we report the discovery of a series of new P300/CBP-associated factor (PCAF) bromodomain (BRD) inhibitors, which were obtained through a hit discovery process and subsequent structure-based optimization and structure-activity relationship analyses toward a retrieved hit compound (12). Among these inhibitors, ( R, R)-36n is the most potent one with an IC50 of 7 nM in homogeneous time-resolved

  本文中，我们报告了一系列新的P300 / CBP相关因子（PCAF）溴结构域（BRD）抑制剂的发现，这些抑制剂是通过命中发现过程以及随后针对检索到的命中的基于结构的优化和构效关系分析而获得的化合物（12）。在这些抑制剂中，（R，R）-36n是最有效的抑制剂，在均相时间分辨荧光测定中的IC50为7 nM，在等温滴定量热测定中的KD为78 nM。该化合物还显示出对GCN5和FALZ的活性，但对其他29种BRD蛋白和422个激酶的活性较弱或没有活性，表明具有相当大的选择性。X射线共晶结构分析揭示了分子相互作用模式和生物活性所需的精确立体化学。细胞活性，初步RNA-seq分析，并且还研究了该化合物的药代动力学性质。总的来说，这项研究为探索PCAF BRD调控的分子机制提供了一种通用的工具分子，还为靶向PCAF的药物发现提供了一种新的先导化合物。
• 嘧啶酮衍生物及其在制药中的应用
  申请人：四川大学华西医院

  公开号：CN111499639B

  公开（公告）日：2022-03-04

  本发明公开了一种嘧啶酮衍生物及其在制药中的应用，一种式(A)所示的化合物或其药学上可接受的盐、晶型、溶剂合物：其中，W、Y、R1、R2、R3、R4的定义与权利要求1中的定义相同。所述化合物与PCAF溴结构域的亲和力较高，其能够很强地结合PCAF溴结构域，并作为PCAF溴结构域抑制剂，抑制PCAF溴结构域与乙酰化赖氨酸相互作用，可以进一步作为潜在的治疗PCAF相关疾病或症状的药物，如癌症、HIV感染和神经炎症。
• 一种靶向SETDB1-TTD的小分子抑制剂及其制药用途
  申请人：四川大学

  公开号：CN114805357A

  公开（公告）日：2022-07-29

  本发明提供了一种靶向SETDB1‑TTD的小分子抑制剂及其制药用途。实验结果表明，本发明提供的化合物对SETDB1‑TTD结构域具有良好的亲和活性，能够竞争性的靶向抑制SETDB1‑TTD结构域对底物蛋白的识别，有效抑制SETDB1‑TTD结构域在细胞内与组蛋白的结合。本发明提供的化合物可以制备SETDB1‑TTD抑制剂，可以制备预防和治疗与SETDB1表达异常相关疾病(例如肝细胞癌、非小细胞肺癌、前列腺癌、肾癌、脑胶质瘤、乳腺癌、黑色素瘤等)的药物，应用前景广阔。
• PYRIDAZINON DERIVATIVES AS KAT2 DEGRADERS FOR THE TREATMENT OF PROLIFERATIVE DISORDERS
  申请人：[en]AURON THERAPEUTICS, INC.

  公开号：WO2024050078A1

  公开（公告）日：2024-03-07

  Provided herein are heterocyclic phenyl compounds useful as degraders of KAT2, as well as compositions and methods of use thereof.