通过形成与羟
吲哚羰基的七元氢键形成苯甲酰胺的构象限制,设计了一系列PARP
抑制剂以使其与PARP表面结合时具有适当的取向。这一系列具有3-氧代
异吲哚啉-4-羧酰胺核心结构的化合物在固有和
细胞分析中均显示出对PARP-1的适度至良好活性。在药效基团的内酰胺氮上进行的
SAR研究表明,仲胺或叔胺对于细胞效能很重要。化合物1e的X射线结构结合到蛋白质上证实了七元分子内氢键的形成。尽管以前在肽中发现过,但这种类型的七元分子内氢键很少在小分子中观察到。在很大程度上,由于分子内氢键的形成,3-氧代
异吲哚啉-4-羧酰胺核心结构在X射线结构中似乎是平面的。
哌啶氮与Gly-888的其他氢键相互作用也有助于1e与PARP-1的结合亲和力。