摘要:
通过化学交联质谱 (XL-MS) 分析蛋白质复合物受到可用交联剂的侧链反应性和大小、反应速率慢以及交联富集困难的限制,特别是对于稀有、瞬态或动态复合物。在这里,我们描述了两种新的 XL 试剂,它们结合了甲硫代磺酸盐 (MTS) 基团来标记引入诱饵蛋白的反应性半胱氨酸,以及基于残基无偏二氮丙啶的光活化 XL 基团来捕获其相互作用的伴侣。诱饵的还原去除将交联剂的含硫醇片段转移到靶标上,该靶标可以被烷基化并通过 MS 测序定位并用于富集,从而能够检测低丰度交联。使用这些试剂和定制的 UV LED 照射平台,我们证明可在 10 秒内实现最大交联产量。这种“标签和转移”方法的实用性通过明确的肽/蛋白质调节相互作用 (BID80-102 /MCL-1) 和伴侣/底物复合物 (Skp/OmpA) 的动态相互作用界面来证明。