N-(3-((6,7-dimethoxy-2-(pyrrolidin-1-yl)quinazolin-4-yl)amino)-propyl)acrylamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二氮杂萘
• 英文名称: N-(3-((6,7-dimethoxy-2-(pyrrolidin-1-yl)quinazolin-4-yl)amino)-propyl)acrylamide
• 英文别名: N-[3-[(6,7-dimethoxy-2-pyrrolidin-1-ylquinazolin-4-yl)amino]propyl]prop-2-enamide
• 化学式: C₂₀H₂₇N₅O₃
• 分子量: 385.466
• InChiKey: QTHRXIUTSUVNPH-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.6
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  88.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2,4-二氯-6,7-二甲氧基喹唑啉 在 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 N-(3-((6,7-dimethoxy-2-(pyrrolidin-1-yl)quinazolin-4-yl)amino)-propyl)acrylamide
  参考文献：
  名称：

  SET结构域蛋白8（SETD8）赖氨酸甲基转移酶的共价抑制剂的基于结构的设计。

  摘要：

  非常需要蛋白质赖氨酸甲基转移酶的选择性抑制剂，包括含SET结构域的蛋白质8（SETD8），因为这些酶中只有一小部分与高质量抑制剂相关。从我们先前发现的SETD8抑制剂中，我们开发了一种更有效的类似物并解决了共晶体结构，这是SETD8与小分子抑制剂复合后的第一个晶体结构。这种共晶体结构允许设计SETD8（MS453）的共价抑制剂，该抑制剂可特异性修饰抑制剂结合位点附近的半胱氨酸残基，具有IC 50值804nM，与SETD8反应，具有接近定量的产率，并且对SETD8对28种其他甲基转移酶具有选择性。我们还解决了与SETD8配合使用的共价抑制剂的晶体结构。这项工作为小分子抑制SETD8提供了原子级的观点，并将有助于鉴定高质量的SETD8化学探针。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.6b01244

文献信息

• Structure-Based Design of a Covalent Inhibitor of the SET Domain-Containing Protein 8 (SETD8) Lysine Methyltransferase
  作者：Kyle V. Butler、Anqi Ma、Wenyu Yu、Fengling Li、Wolfram Tempel、Nicolas Babault、Fabio Pittella-Silva、Jason Shao、Junyi Wang、Minkui Luo、Masoud Vedadi、Peter J. Brown、Cheryl H. Arrowsmith、Jian Jin

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.6b01244

  日期：2016.11.10

  small-molecule inhibitor. This cocrystal structure allowed the design of a covalent inhibitor of SETD8 (MS453), which specifically modifies a cysteine residue near the inhibitor binding site, has an IC50 value of 804 nM, reacts with SETD8 with near-quantitative yield, and is selective for SETD8 against 28 other methyltransferases. We also solved the crystal structure of the covalent inhibitor in complex with

  非常需要蛋白质赖氨酸甲基转移酶的选择性抑制剂，包括含SET结构域的蛋白质8（SETD8），因为这些酶中只有一小部分与高质量抑制剂相关。从我们先前发现的SETD8抑制剂中，我们开发了一种更有效的类似物并解决了共晶体结构，这是SETD8与小分子抑制剂复合后的第一个晶体结构。这种共晶体结构允许设计SETD8（MS453）的共价抑制剂，该抑制剂可特异性修饰抑制剂结合位点附近的半胱氨酸残基，具有IC 50值804nM，与SETD8反应，具有接近定量的产率，并且对SETD8对28种其他甲基转移酶具有选择性。我们还解决了与SETD8配合使用的共价抑制剂的晶体结构。这项工作为小分子抑制SETD8提供了原子级的观点，并将有助于鉴定高质量的SETD8化学探针。