DNA编码文库(DEL)技术正在成为小分子发现工具箱的关键要素。常规的DEL筛选(即DNA上筛选)通过亲和选择DNA标记的文库成员来查询大型组合文库,这些成员是纯化并固定的蛋白质靶标的
配体。在这些选择中,DNA标签会实质性和不希望地影响靶标结合,因此影响实验结果。在这里,我们使用固相DEL和基于液滴的微流体筛选将DEL成员与其DNA标签分离(即脱DNA筛选),用于随后的液滴内激光诱导的荧光偏振(FP)检测靶标结合,避免了DNA标签的干扰。使用受体
酪氨酸激酶(RTK)盘状结构域受体1(DDR1)作为液滴规模竞争结合测定中的概念证明目标,我们筛选了67 100个成员的药物样小分子固相DEL用于DDR1的竞争性
配体,并鉴定了几种已知的RTK
抑制剂药效基团,包括含氮
吲哚和
喹唑啉酮的单体。带有FP检测的DNA外DEL亲和力筛选可能适用于各种各样的目标类别,包括核酸结合蛋白,难以过表达和纯化的蛋白质或没有已知活性测定的目标。