作者:Alex H. F. Lee、Eric T. Kool
DOI:10.1021/jo0483973
日期:2005.1.1
stacking, and pairing properties of a new structural class of size-expanded pyrimidine nucleosides, abbreviated dyT and dyC. Their bases are benzo-homologated variants of thymine and cytosine and have a design that is distinct from a previously described class of size-expanded (xDNA) pyrimidines, with a different vector of expansion relative to the sugar. We term this new base geometry “yDNA” (a mnemonic
我们报告的合成,堆叠和配对的大小扩展的嘧啶核苷,缩写为dyT和dyC的一个新的结构类的属性。它们的碱基是胸腺嘧啶和胞嘧啶的苯并同源变体,其设计不同于先前描述的一类尺寸扩大的(xDNA)嘧啶,相对于糖而言,其扩张载体不同。我们将这种新的基本几何形状称为“ yDNA”(“宽DNA”的助记符)。两种C-糖苷均使用Pd介导的碘化碱衍生物与脱氧核糖前体的偶联制备。作为游离的脱氧核苷,dyT和dyC均显示出强大的荧光,最大发射分别在375和390 nm处。两种加宽的嘧啶都可以作为保护的亚磷酰胺衍生物容易地掺入合成寡核苷酸中。在“悬空的末端” DNA环境中进行的实验表明,yT和yC的堆叠比它们的天然对应物更有利。当在沃森-克里克(Watson-Crick)DNA的情况下配对相对的天然碱基时,尽管与相邻的天然对大小不匹配,但yT核苷酸与A形成的对与T-A对一样稳定。在相同情况下,yC核苷酸(与G配对)不稳