2-(4-nitrophenyl)ethyl tetraisopropylphosphorodiamidite | 108787-34-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 2-(4-nitrophenyl)ethyl tetraisopropylphosphorodiamidite
• 英文别名: bis(N,N-diisopropylamino)-2-(4-nitrophenyl)ethoxyphosphane；bis-(N,N-diisopropylamino)-2-(4-nitrophenyl)ethoxy-phosphane；N-[[di(propan-2-yl)amino]-[2-(4-nitrophenyl)ethoxy]phosphanyl]-N-propan-2-ylpropan-2-amine
• CAS: 108787-34-4
• 化学式: C₂₀H₃₆N₃O₃P
• 分子量: 397.498
• InChiKey: GALWCMOWYUPKMY-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  471.0±47.0 °C(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.4
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  61.5
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(4-nitrophenyl)ethyl tetraisopropylphosphorodiamidite 在 四氮唑 、 phenacetyl sulfide 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 乙腈 为溶剂， 反应 1.58h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Roelen, H. C. P. F.; Kamer, P. C. J.; Elst, H. van den, Recueil des Travaux Chimiques des Pays-Bas, 1991, vol. 110, # 7-8, p. 325 - 331

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  对硝基苯乙醇 在 三氯化磷 作用下， 以 乙醚 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 2-(4-nitrophenyl)ethyl tetraisopropylphosphorodiamidite
  参考文献：
  名称：

  核苷酸部分XL。修饰的2'–5'腺苷酸三聚体-潜在的抗病毒药的合成和表征†

  摘要：

  通过亚磷酰胺法合成了在各种糖部分的3'-OH位置带有（叔丁基）二甲基甲硅烷基（tbds）的2'-5'腺苷酸三聚体41-44。比较了（叔丁氧基）羰基（boc）和2-（4-硝基苯基）乙基磺酰基（npes）基团在3'- O- tbds残基附近用于2'-OH保护的用途。目标三聚体。对于其他功能位置，赞成使用2-（4-硝基苯基）乙基（npe）和2-（4-硝基苯基）乙氧基羰基（npeoc）保护基。

  DOI：

  10.1002/hlca.19940770104

文献信息

• Cholesterol conjugates of 2'5'-oligoadenylate derivatives and antiviral
  申请人：Temple University-of the Commonwealth System of Pennsylvania

  公开号：US05643889A1

  公开（公告）日：1997-07-01

  A cholesterol-cordycepin conjugate having the formula ##STR1## wherein: n is an integer from 1 to 8; R.sub.1 is selected from the group of consisting of T, T' and Y; T is ##STR2## T' is ##STR3## where x is an integer from 1 to 18; Y is ##STR4## where m is zero, 1, 2, or 3; each R.sub.2 is independently selected from the group consisting of oxygen and sulfur; each R.sub.3 is independently selected from the group consisting of hydrogen and hydroxyl; R.sub.4 is selected from the group consisting of hydrogen, hydroxyl and T or T'; R.sub.5 is selected from the group consisting of hydrogen, hydroxyl and T or T'; provided that all R.sub.1, R.sub.4 and R.sub.5 may not be T or T'; at least one R.sub.3 is hydrogen or R.sub.4 is hydrogen; and at least one of R.sub.1, R.sub.4 and R.sub.5 must be T or T'; or a water soluble salt thereof. The compounds possess increased antiviral activity and/or metabolic stability.

  一种具有以下结构的胆固醇-腺苷酸共轭物：其中：n为1至8的整数；R.sub.1从T、T'和Y组成的群体中选择；T为T'为其中x为1至18的整数；Y为其中m为零、1、2或3；每个R.sub.2独立地从氧和硫组成的群体中选择；每个R.sub.3独立地从氢和羟基组成的群体中选择；R.sub.4从氢、羟基和T或T'组成的群体中选择；R.sub.5从氢、羟基和T或T'组成的群体中选择；前提是所有R.sub.1、R.sub.4和R.sub.5均不得为T或T'；至少一个R.sub.3为氢或R.sub.4为氢；并且至少一个R.sub.1、R.sub.4和R.sub.5必须为T或T'；或其水溶性盐。这些化合物具有增强的抗病毒活性和/或代谢稳定性。
• Nucleotides. Part LXXVIII
  作者：Thomas Maier、Wolfgang Pfleiderer

  DOI：10.1002/hlca.201000253

  日期：2010.12

  2′‐deoxyguanosine derivative 53 was transformed into 3′,5′‐di‐O‐acetyl‐2‐fluoro‐1‐2‐[(2,4‐dinitrophenyl)methylamino]ethyl}inosine (54; Scheme 5) which reacted with 2,2′‐[ethane‐1,2‐diylbis(oxy)]bis[ethanamine] to modify the 2‐position with an amino spacer resulting in 56 (Scheme 6). Attachment of the fluorescein moiety 55 at 56 via a urea linkage led to the doubly labeled 2′‐deoxyguanosine derivative 57 (Scheme 6)

  几个Ñ（羟基烷基）-2,4-二硝基苯胺转化成它们的亚磷酰胺（参见5和6在方案1）鉴于它们作为荧光猝灭剂的使用，和改性的2-氨基苯甲酰胺（参见图9，10，18，和19在方案1中）在模型反应施加为荧光团，以确定3'-ABA的相对荧光量子产率和5'-DNP-3'-ABA共轭物（ABA =氨基苯甲酰胺，DNP =二硝基苯胺）。胸苷用N-（2-氯乙基）-2-，4-二硝基苯胺（24）烷基化，得到25，然后将其进一步修饰为结构单元27和28（方案3）。29中的2-氨基通过重氮化转化为2-氟肌苷衍生物30，用作在嘧啶核上进行数个反应的起始原料（→ 31、33和35；方案4）。3'，5'-二-O-乙酰基-2'-脱氧-N 2 -[（（二甲基氨基）亚甲基]鸟苷（37）被甲基和乙基碘化物优先在N（1）分别烷基化至43和44，并且类似地反应ñ - （2-氯乙基）-2,4-二硝基苯胺（24），以38和N-（2-碘乙基
• Nucleotides. Part LXXIII
  作者：Ursula Münch、Wolfgang Pfleiderer

  DOI：10.1002/hlca.200390206

  日期：2003.7

  (2-cyano-1-phenylethoxy)carbonyl (2c1peoc) group was developed as a new base-labile protecting group for the 5′-OH function in solid-phase synthesis of oligoribonucleotides via the phosphoramidite approach. The half-lives of its β-elimination process by 0.1M DBU (1,8-diazabicyclo[5.4.0]undec-7-ene) were determined to be 7–14 s by HPLC investigations. The 2′-OH function was protected with the acid-labile

  （2-氰基-1-苯基乙氧基）羰基（2c1peoc）基团被开发为通过亚磷酰胺固相合成寡核糖核苷酸的5'-OH功能的新的碱不稳定保护基。通过HPLC研究确定其通过0.1M DBU（1,8-二氮杂双环[5.4.0] undec-7-ene）进行的β消除过程的半衰期为7-14 s。酸不稳定的四氢-4-甲氧基-2 H可保护2'-OH功能-吡喃-4-基（thmp）基团，而2-（4-硝基苯基）乙基（npe）和2-（4-硝基苯基）乙氧羰基（npeoc）基团用于保护碱基和磷酸盐部分。描述了单体构件的合成，亚磷酰胺和核苷官能化的载体，以及通过这种方法的寡核糖核苷酸的积累。
• 2′-Deoxyriboguanylurea, the primary breakdown product of 5-aza-2′-deoxyribocytidine, is a mutagen, an epimutagen, an inhibitor of DNA methyltransferases and an inducer of 5-azacytidine-type fragile sites
  作者：Katarzyna Lamparska、Jarrod Clark、Gail Babilonia、Victoria Bedell、Wesley Yip、Steven S. Smith

  DOI：10.1093/nar/gks706

  日期：2012.10

  5-Aza-2′-deoxycytidine (5azaC-dR) has been employed as an inhibitor of DNA methylation, a chemotherapeutic agent, a clastogen, a mutagen, an inducer of fragile sites and a carcinogen. However, its effects are difficult to quantify because it rapidly breaks down in aqueous solution to the stable compound 2′-deoxyriboguanylurea (GuaUre-dR). Here, we used a phosphoramidite that permits the introduction of GuaUre-dR at defined positions in synthetic oligodeoxynucleotides to demonstrate that it is a potent inhibitor of human DNA methyltransferase 1 (hDNMT1) and the bacterial DNA methyltransferase (M. Eco RII) and that it is a mutagen that can form productive base pairs with either Guanine or Cytosine. Pure GuaUre-dR was found to be an effective demethylating agent and was able to induce 5azaC-dR type fragile sites FRA1J and FRA9E in human cells. Moreover, we report that demethylation associated with C:G → G:C transversion and C:G → T:A transition mutations was observed in human cells exposed to pure GuaUre-dR. The data suggest that most of the effects attributed to 5azaC-dR are exhibited by its stable primary breakdown product.

  5-阿扎-2′-脱氧胞苷（5azaC-dR）被用作DNA甲基化的抑制剂、化疗药物、致裂剂、诱变剂、脆弱位点的诱导剂和致癌物。然而，由于其在水溶液中迅速分解为稳定的化合物2′-脱氧核糖鸟苷脲（GuaUre-dR），因此其效应难以量化。在这里，我们使用了一种磷酰胺，使得可以在合成寡脱氧核苷酸中特定位置引入GuaUre-dR，以证明其是人类DNA甲基转移酶1（hDNMT1）和细菌DNA甲基转移酶（M. Eco RII）的强效抑制剂，并且它是一种诱变剂，可以与鸟嘌呤或胞嘧啶形成有效的碱基对。纯GuaUre-dR被发现是一种有效的去甲基化剂，能够在人体细胞中诱导5azaC-dR类型的脆弱位点FRA1J和FRA9E。此外，我们报告在暴露于纯GuaUre-dR的人类细胞中观察到与C:G → G:C反转和C:G → T:A转移突变相关的去甲基化。数据表明，归因于5azaC-dR的大部分效应实际上是其稳定的主要分解产物所体现的。
• Nucleotides. Part LXXI
  作者：Harald Sigmund、Wolfgang Pfleiderer

  DOI：10.1002/hlca.200390186

  日期：2003.7

  A new labelling technique attaching fluorescein via a carbamoyl linker directly to the amino groups of the nucleobases was developed. The amino groups were first converted to the phenoxycarbonyl derivatives (10, 15, 19, 58), which reacted under mild conditions with 5-aminofluorescein to give the corresponding N-[(fluorescein-5-ylamino)carbonyl] derivatives (11–14, 16, 17, 20, 59, 60). The introduction

  开发了一种新的标记技术，该技术通过氨基甲酰基接头将荧光素直接连接到核碱基的氨基上。氨基首先转化为苯氧基羰基衍生物（10，15，19，58），它在温和条件下反应，用5-氨基荧光素，得到相应的Ñ - [（荧光素-5-基氨基）羰基]衍生物（11 - 14 ，16，17，20，59，60）。将5-氨基荧光素残基引入适当保护的腺苷-腺苷二聚体（39，40）和三聚体（50）工作良好，并且这些均一地封闭的前体的最终脱保护导致用DBU（1,8-二氮杂双环[5.4.0] undec-7-ene）处理，一步到二聚体41和三聚体51。适当保护的单体亚磷酰胺结构单元（75）的合成更加困难，因为将2-（4-硝基苯基）乙基残基引入59中的荧光素部分主要导致三取代，从而得到包括尿素官能团的61。腺苷二聚体66和三聚体67的形成通过亚磷酰胺化学反应以通常的方式进行；参见表1。然而，脱保护67与DBU是不完整的，因为Ø发现