5'-O-phosphoryl-2'-deoxycytidylyl-(3'->5')-2'-deoxyadenosine | 4251-24-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - （3'->5'）-二核苷酸和类似物
• 英文名称: 5'-O-phosphoryl-2'-deoxycytidylyl-(3'->5')-2'-deoxyadenosine
• 英文别名: dpC-A；pdCpdA；2'-deoxy-adenylyl-(5'->3')-2'-deoxy-[5']cytidylic acid；5'-O-Phosphoryl-desoxycytidyl-(3'->5')-desoxyadenosin；[(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] [(2R,3S,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate
• CAS: 4251-24-5
• 化学式: C₁₉H₂₆N₈O₁₂P₂
• 分子量: 620.409
• InChiKey: QVVLSVHZGVMJEK-IDMWBNCISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.9
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  290
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  16

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N4-苯甲酰基-5′-O-(4,4′-二甲氧基三苯基)-2′-脱氧胞苷 在 吡啶 、 四氮唑 、 ammonium hydroxide 、 水 、 碘 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 8.92h， 生成 5'-O-phosphoryl-2'-deoxycytidylyl-(3'->5')-2'-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  二核苷酸pdCpA和pdCpdA的改进的合成。

  摘要：

  为制备二核苷酸杂合体5'-O-磷酰基-2'-脱氧胞嘧啶-（3'-> 5'）腺苷（pdCpA）7开发了一条改进的途径。这种简单而简明的合成方法涉及2的连续偶联-氰基乙基N，N，N'，N'-四异丙基亚磷酰胺基与4-N-苯甲酰基-5'-O-（4，4'-二甲氧基三苯甲基）-2'-脱氧胞苷1和6-N，6- N，2'-O，3'-O-四苯甲酰腺苷2是关键步骤。还合成了一些带有不同保护基的二核苷酸衍生物，并详细研究了选择性脱保护条件。该方法在合成总DNA二核苷酸pdCpdA 17和总RNA二核苷酸21中的应用进一步证明了该方法的实用性和效率。

  DOI：

  10.1081/ncn-100002081

文献信息

• AN IMPROVED SYNTHESIS OF THE DINUCLEOTIDES pdCpA AND pdCpdA
  作者：Xue-Feng Zhu、A. Ian Scott

  DOI：10.1081/ncn-100002081

  日期：2001.2.28

  preparation of the dinucleotide hybrid 5'-O-phosphoryl-2'-deoxycytidylyl-(3'--> 5')adenosine (pdCpA) 7. This simple and concise synthesis involves the successive coupling of 2-cyanoethyl N, N, N', N'-tetra- isopropylphosphorodiamidite with 4-N-benzoyl-5'-O-(4, 4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxy-cytidine 1 and 6-N,6-N,2'-O,3'-O-tetrabenzoyladenosine 2 as the key step. Some dinucleotide derivatives bearing

  为制备二核苷酸杂合体5'-O-磷酰基-2'-脱氧胞嘧啶-（3'-> 5'）腺苷（pdCpA）7开发了一条改进的途径。这种简单而简明的合成方法涉及2的连续偶联-氰基乙基N，N，N'，N'-四异丙基亚磷酰胺基与4-N-苯甲酰基-5'-O-（4，4'-二甲氧基三苯甲基）-2'-脱氧胞苷1和6-N，6- N，2'-O，3'-O-四苯甲酰腺苷2是关键步骤。还合成了一些带有不同保护基的二核苷酸衍生物，并详细研究了选择性脱保护条件。该方法在合成总DNA二核苷酸pdCpdA 17和总RNA二核苷酸21中的应用进一步证明了该方法的实用性和效率。