(S)-8-(benzyloxy)-2-(tert-butoxycarbonylamino)-suberic acid | 174784-95-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (S)-8-(benzyloxy)-2-(tert-butoxycarbonylamino)-suberic acid
• 英文别名: Boc-L-Asu(OBzl)-OH；(Boc-L-Asu(OBn))；Boc-L-Asu(OBzl)；(2S)-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-8-oxo-8-phenylmethoxyoctanoic acid
• CAS: 174784-95-3
• 化学式: C₂₀H₂₉NO₆
• 分子量: 379.453
• InChiKey: LVNJGIUGSLTSMR-INIZCTEOSA-N

物化性质

• 沸点：
  527.2±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.145±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.5
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.55
• 拓扑面积：
  102
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-8-(benzyloxy)-2-(tert-butoxycarbonylamino)-suberic acid 在 palladium on activated charcoal 4-二甲氨基吡啶 、 氢气 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 (S)-7-(tert-butoxycarbonylamino)-8-methoxy-8-oxooctanoic acid
  参考文献：
  名称：

  串联酶解产生L-α-氨基链烷二酸ω-酯。

  摘要：

  丝氨酸蛋白酶（α-胰凝乳蛋白酶或枯草杆菌蛋白酶BPN'）和曲霉属氨酰酶对外消旋N-乙酰基-α-氨基链烷二酸α，ω-二酯的串联作用，收率高，光学旋光性好。纯度。通过肟树脂的固相合成和环化裂解方法，将由此获得的L-α-氨基异丁二酸ω-酯方便地引入催产素类似物[Asu1,6]催产素中。

  DOI：

  10.1248/cpb.44.212
• 作为产物：
  描述：

  二碳酸二叔丁酯 、 8-苄基-(S)-2-氨基辛二酸酯 在 sodium hydroxide 、 盐酸 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 反应 13.0h， 生成 (S)-8-(benzyloxy)-2-(tert-butoxycarbonylamino)-suberic acid
  参考文献：
  名称：

  [EN] INDOLES, BENZIMIDAZOLES OR NAPHHIMIDAZOLES AS HISZONE DEACETYLASE (HDAC) INHIBITOR
  [FR] INDOLES, BENZIMIDAZOLES OU NAPHHIMIDAZOLES EN TANT QU'INHIBITEURS DE L'HISTONE DESACETYLASE (HDAC)

  摘要：

  式(I)的化合物：其中R1是酰基，R2是氢，或R1和R2连接在一起形成杂环环，R5是羟基，羟胺基，低烷基，低烷氧基，卤代(低)烷基或羟基(低)烷基，Q是低烷基烯基或低烯基，G是从以下公式选择的取代基，其中R3和R4各自独立地是氢，卤素，卤代(低)烷基，氰基，芳基或芳基(低)烷基，可选择地取代一个或多个适当的取代基，或R3和R4连接在一起形成芳香环，X是NH，O或S，或其盐。该化合物可用作组蛋白去乙酰化酶的抑制剂。

  公开号：

  WO2004072047A1

文献信息

• Chlamydocin–hydroxamic acid analogues as histone deacetylase inhibitors
  作者：Norikazu Nishino、Binoy Jose、Ryuzo Shinta、Tamaki Kato、Yasuhiko Komatsu、Minoru Yoshida

  DOI：10.1016/j.bmc.2004.08.041

  日期：2004.11

  Chlamydocin-hydroxamic acid analogues were designed and synthesized as histone deacetylase (HDAC) inhibitors based on the structure and HDAC inhibitory activity of chlamydocin and trichostatin A. Chlamydocin is a cyclic tetrapeptide containing an epoxyketone moiety in the side chain that makes it an irreversible inhibitor of HDAC. We replaced the epoxyketone moiety of chlamydocin with hydroxamic acid to

  根据衣原霉素和曲古抑菌素A的结构和HDAC抑制活性，设计并合成了衣原霉素-异羟肟酸类似物作为组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）抑制剂。衣原霉素是环状四肽，在侧链中含有环氧酮部分，使其成为不可逆抑制剂。 HDAC。我们用异羟肟酸代替了衣原体的环氧酮部分，以设计有效且可逆的HDAC抑制剂。另外，对于一系列衣藻多菌素类似物系列，引入了许多氨基-环烷羧酸（Acc）而不是简单的氨基-异丁酸（Aib）。测试了所合成的化合物的HDAC抑制活性，结果表明其中许多是HDAC的有效抑制剂。用芳香族氨基酸代替衣原体的Aib残基增强了体内和体外的抑制活性。我们已经对衣原霉素-异羟肟酸类似物进行了圆二色性和分子模拟研究，并将其与衣原霉素的溶液结构进行了比较。
• Discovery of Potent HDAC Inhibitors Based on Chlamydocin with Inhibitory Effects on Cell Migration
  作者：Shimiao Wang、Xiaohui Li、Yingdong Wei、Zhilong Xiu、Norikazu Nishino

  DOI：10.1002/cmdc.201300372

  日期：2014.3

  aliphatic ring, exhibited better antiproliferative effects than trichostatin A (TSA) against MCF‐7 and K562 cell lines. In addition to cell‐cycle arrest and apoptosis, cell migration inhibition was observed in cells treated with compound 1 b. Subsequent western blot analysis revealed that the balance between matrix metalloproteinase 2 (MMP2) and tissue inhibitors of metalloproteinase 1 (TIMP1) determines the

  由于这些酶在各种细胞过程中的重要性，因此组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）家族是有前途的药物靶标类别。进行了对接研究以鉴定新型HDAC抑制剂。将识别域中的细微修饰引入一系列衣藻多菌素类似物，并将所得支架与各种锌结合域结合。值得注意的是，环（大号-Asu（NHOH） -大号-A3mc6c-大号-Phe- d -Pro，化合物1b的），在脂肪族环的3或5位上具有甲基，比曲古抑菌素A（TSA）对MCF-7和K562细胞系表现出更好的抗增殖作用。除细胞周期停滞和凋亡外，在用化合物1b处理的细胞中还观察到了细胞迁移抑制作用。随后的蛋白质印迹分析表明，基质金属蛋白酶2（MMP2）和组织金属蛋白酶1（TIMP1）抑制剂之间的平衡决定了MCF-7细胞中金属蛋白酶活性的程度，从而调节细胞迁移。通过改变大的帽基团上的疏水取代模式赋予的改善的抑制活性是开发新型HDAC抑制剂的有价值的方法。
• Synthetic strategy for bicyclic tetrapeptides HDAC inhibitors using ring closing metathesis
  作者：MD NURUL ISLAM、MD SHAHIDUL ISLAM、MD ASHRAFUL HOQUE、TAMAKI KATO、NORIKAZU NISHINO

  DOI：10.1007/s12039-015-0922-y

  日期：2015.9

  and biochemical stability. We have developed bicyclic tetrapeptide HDAC inhibitors based on different cyclic tetrapeptide scaffolds. For the synthesis of these bicyclic tetrapeptides, two cyclization steps, namely, peptide cyclization and fusion of aliphatic side chains by ring closing metathesis (RCM) were involved. In the course of these syntheses, we have established two facts: a lower limit of aliphatic

  环肽具有多种生物活性，由于结构刚性，受体选择性和生化稳定性而被认为是良好的治疗剂。我们已经基于不同的环四肽支架开发了双环四肽HDAC抑制剂。为了合成这些双环四肽，涉及两个环化步骤，即肽环化和通过闭环复分解（RCM）融合脂族侧链。在这些合成过程中，我们已经建立了两个事实：脂族环长度的下限和双环四肽合成的较好合成路线。发现九个亚甲基环长度是脂族环的下限，并且合成路线的选择取决于环状四肽支架中氨基酸的构型。 九个亚甲基单元是脂肪族环长度的下限，合成途径的选择取决于环状四肽支架中氨基酸的构型。RCM和随后的肽环化是LDLD配置的正确途径，而LLLD配置的反向途径是正确的途径。
• Evaluation of functional groups on amino acids in cyclic tetrapeptides in histone deacetylase inhibition
  作者：Md. Shahidul Islam、Mohammed P. I. Bhuiyan、Md. Nurul Islam、Tienabe Kipassa Nsiama、Naoto Oishi、Tamaki Kato、Norikazu Nishino、Akihiro Ito、Minoru Yoshida

  DOI：10.1007/s00726-011-0947-6

  日期：2012.6

  The naturally occurring cyclic tetrapeptide, chlamydocin, originally isolated from fungus , consists of alpha-aminoisobutyric acid, -phenylalanine, -proline and an unusual amino acid ()-2-amino-8-(()-oxiran-2-yl)-8-oxooctanoic acid (Aoe) and inhibits the histone deacetylases (HDACs), a class of regulatory enzymes. The epoxyketone moiety of Aoe is the key functional group for inhibition. The cyclic tetrapeptide scaffold is supposed to play important role for effective binding to the surface of enzymes. In place of the epoxyketone group, hydroxamic acid and sulfhydryl group have been applied to design inhibitor ligands to zinc atom in catalytic site of HDACs. In the research for more potent HDAC inhibitors, we replaced the epoxyketone moiety of Aoe with different functional groups and synthesized a series of chlamydocin analogs as HDAC inhibitors. Among the functional groups, methoxymethylketone moiety showed as potent inhibition as the hydroxamic acid. On the contrary, we confirmed that borate, trifruoromethylketone, and 2-aminoanilide are almost inactive in HDAC inhibition.
• Bicyclic tetrapeptides as potent HDAC inhibitors: Effect of aliphatic loop position and hydrophobicity on inhibitory activity
  作者：Md. Nurul Islam、Md. Shahidul Islam、Md. Ashraful Hoque、Tamaki Kato、Norikazu Nishino、Akihiro Ito、Minoru Yoshida

  DOI：10.1016/j.bmc.2014.06.031

  日期：2014.8

  Several histone deacetylase (HDAC) inhibiting bicyclic tetrapeptides have been designed and synthesized through intramolecular ring-closing metathesis (RCM) reaction and peptide cyclization. We designed bicyclic tetrapeptides based on CHAP31, trapoxin B and HC-toxin I. The HDAC inhibitory and p21 promoter assay results showed that the aliphatic loop position as well as the hydrophobicity plays an important role toward the activity of the bicyclic tetrapeptide HDAC inhibitors.