Structure-Based Development of Isoform-Selective Inhibitors of Casein Kinase 1ε vs Casein Kinase 1δ
作者:Jun Yong Choi、Yoshihiko Noguchi、James M. Alburger、Simon Bayle、Eugene Chung、Wayne Grant、Apirat Chaikuad、Stefan Knapp、Derek R. Duckett、William R. Roush
DOI:10.1021/acs.jmedchem.2c01180
日期:2023.6.8
Specific inhibition of a single kinase isoform is a challenging task due to the highly conserved nature of ATP-binding sites. Casein kinase 1 (CK1) δ and ε share 97% sequence identity in their catalytic domains. From a comparison of the X-ray crystal structures of CK1δ and CK1ε, we developed a potent and highly CK1ε-isoform-selective inhibitor (SR-4133). The X-ray co-crystal structure of the CK1δ−SR-4133
由于 ATP 结合位点的高度保守性,对单一激酶亚型的特异性抑制是一项具有挑战性的任务。酪蛋白激酶 1 (CK1) δ 和 ε 在其催化结构域中具有 97% 的序列同一性。通过比较 CK1δ 和 CK1ε 的 X 射线晶体结构,我们开发了一种有效且高度 CK1ε 亚型选择性抑制剂 (SR-4133)。CK1δ−SR-4133 复合物的 X 射线共晶结构表明 SR-4133 的萘基单元和 CK1δ 之间的静电表面不匹配,从而破坏了 SR-4133 与 CK1δ 的相互作用。相反,CK1ε 的 Asp−Phe−Gly 基序 (DFG)-out 构象产生的疏水表面积稳定了 SR-4133 在 CK1ε ATP 结合袋中的结合,从而导致 CK1ε 的选择性抑制。