1-(2-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-4-hydroxylamino-2(1H)-pyrimidinone | 1867-16-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-(2-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-4-hydroxylamino-2(1H)-pyrimidinone
• 英文别名: N⁴-hydroxy-2'-deoxycytidine；N⁴-OH-dCyd；N⁴-hydroxy-2'-deoxy-cytidine；4-N-Hydroxy-2'-desoxycytidin；Uridine, 2'-dehydroxy-, 4-oxime；4-(hydroxyamino)-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 1867-16-9
• 化学式: C₉H₁₃N₃O₅
• 分子量: 243.219
• InChiKey: GBQJWVYHPHFGFH-SHYZEUOFSA-N

物化性质

• 密度：
  1.78±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.9
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  115
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(2-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-4-hydroxylamino-2(1H)-pyrimidinone 在 三(4-硝基苯基)磷酸酯 、 wheat shoot nucleoside phosphotransferase 作用下， 以 acetate buffer 为溶剂， 反应 40.0h， 以70%的产率得到1-(β-D-2-deoxyribofuranosyl)-4-hydroxyaminopyrimidin-2(1H)-one 5'-monophosphate
  参考文献：
  名称：

  5位取代的N（4）-羟基-2'-脱氧胞苷及其5'-单磷酸酯：合成，构象，与肿瘤胸苷酸合酶的相互作用以及体外抗肿瘤活性。

  摘要：

  描述了通过转化各自的5-取代的3'，5'-二-O-乙酰基-2'-来合成5-取代的N（4）-羟基-2'-脱氧胞苷5a，b，dh的简便方法。脱氧尿苷1a-c，eh。这些程序包括在位置C（4）上进行位点特异性三唑基化或N-甲基咪唑基化，然后进行羟胺化并用MeOH-NH（3）进行解封。借助于麦芽磷酸转移酶系统，将核苷5a，b，dh选择性地转化为相应的5′-单磷酸酯6a，b，dh。由（1）H NMR光谱推导并通过分子力学计算证实的D（2）O溶液中每个核苷的构象表明，戊糖环主要存在于构象S（C-2'-endo）和N（ 4）-OH基为顺式旋转异构体。研究了两种L5178Y鼠白血病细胞系对亲本和5-氟-2'-脱氧尿苷（FdUrd）的耐药性对细胞生长的抑制作用，后者对FdUrd的敏感性比前者低70倍。对于耐FdUrd的L5178Y细胞，5-氟-N（4）-羟基-2'-脱氧胞苷（5e）引起的生长抑制作用几乎是F

  DOI：

  10.1021/jm000975u
• 作为产物：
  描述：

  二乙酰基-2'脱氧尿苷 在 吡啶 、 盐酸羟胺 、 氨 、 三氯氧磷 作用下， 以 甲醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 24.5h， 生成 1-(2-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-4-hydroxylamino-2(1H)-pyrimidinone
  参考文献：
  名称：

  5位取代的N（4）-羟基-2'-脱氧胞苷及其5'-单磷酸酯：合成，构象，与肿瘤胸苷酸合酶的相互作用以及体外抗肿瘤活性。

  摘要：

  描述了通过转化各自的5-取代的3'，5'-二-O-乙酰基-2'-来合成5-取代的N（4）-羟基-2'-脱氧胞苷5a，b，dh的简便方法。脱氧尿苷1a-c，eh。这些程序包括在位置C（4）上进行位点特异性三唑基化或N-甲基咪唑基化，然后进行羟胺化并用MeOH-NH（3）进行解封。借助于麦芽磷酸转移酶系统，将核苷5a，b，dh选择性地转化为相应的5′-单磷酸酯6a，b，dh。由（1）H NMR光谱推导并通过分子力学计算证实的D（2）O溶液中每个核苷的构象表明，戊糖环主要存在于构象S（C-2'-endo）和N（ 4）-OH基为顺式旋转异构体。研究了两种L5178Y鼠白血病细胞系对亲本和5-氟-2'-脱氧尿苷（FdUrd）的耐药性对细胞生长的抑制作用，后者对FdUrd的敏感性比前者低70倍。对于耐FdUrd的L5178Y细胞，5-氟-N（4）-羟基-2'-脱氧胞苷（5e）引起的生长抑制作用几乎是F

  DOI：

  10.1021/jm000975u

文献信息

• [EN] N4-HYDROXYCYTIDINE AND DERIVATIVES AND ANTI-VIRAL USES RELATED THERETO<br/>[FR] N4-HYDROXYCYTIDINE ET SES DÉRIVÉS ET UTILISATIONS ANTIVIRALES ASSOCIÉES
  申请人：UNIV EMORY

  公开号：WO2021159044A1

  公开（公告）日：2021-08-12

  This disclosure relates to certain N4-hydroxycytidine derivatives, pharmaceutical compositions, and methods related thereto. In certain embodiments, the disclosure relates to the treatment or prophylaxis of human coronavirus 2019-nCoV.

  这项披露涉及某些N4-羟基胞苷衍生物、药物组合物以及相关方法。在某些实施方式中，该披露涉及治疗或预防人类冠状病毒2019-nCoV。
• Beta-L-N4-Hydroxycytosine Deoxynucleosides and their use as Pharmaceutical Agents in the Prophylaxis or Therapy of Viral Diseases
  申请人：Matthes Eckart

  公开号：US20090105186A1

  公开（公告）日：2009-04-23

  The invention relates to β-L-N4-hydroxycytosine nucleo-sides, pharmaceutical agents comprising same, and to the use of said β-L-N4-hydroxycytosine nucleosides and pharmaceutical agents in the prophylaxis or therapy of an infection caused by hepatitis B virus (HBV) or human immunodeficiency virus (HIV). The invention also relates to a method for the preparation of said β-L-nucleoside analogs.

  该发明涉及β-L-N4-羟基胞嘧啶核苷，包含相同核苷的药物，以及利用该β-L-N4-羟基胞嘧啶核苷和药物在预防或治疗由乙型肝炎病毒（HBV）或人类免疫缺陷病毒（HIV）引起的感染中的用途。该发明还涉及一种制备该β-L-核苷类似物的方法。
• Uric Acid as a Photosensitizer in the Reaction of Deoxyribonucleosides with UV Light of Wavelength Longer than 300 nm: Identification of Products from 2′-Deoxycytidine
  作者：Toshinori Suzuki、Atsuko Ozawa-Tamura、Miyu Takeuchi、Yuriko Sasabe

  DOI：10.1248/cpb.c21-00501

  日期：2021.11.1

  formed by cycloaddition of an amide group from uric acid. A 15N-labeled uric acid, uric acid-1,3-15N2, having two 14N and two 15N atoms per molecule, produced N4,5-cyclic amide-2′-deoxycytidine containing both 14N and 15N atoms from uric acid-1,3-15N2. Singlet oxygen, hydroxyl radical, peroxynitrous acid, hypochlorous acid, and hypobromous acid generated neither N4-hydroxy-2′-deoxycytidine nor N4

  DNA 直接与波长短于 300 nm 的紫外线发生反应。尽管地表阳光几乎完全被大气吸收，因此几乎不包含这种短波长紫外线，但阳光是导致皮肤癌的主要原因。因此，内源性物质的光敏性必须参与皮肤癌的发展机制。尿酸是人体嘌呤的最终代谢产物，在细胞和体液中的浓度相对较高。2'-脱氧胞苷、2'-脱氧鸟苷、胸苷和2'-脱氧腺苷的中性混合溶液在尿酸存在下用波长大于300 nm的紫外光照射时，所有的核苷都被消耗掉。酸剂量依赖性方式。这些反应被自由基清除剂的添加所抑制，乙醇和叠氮化钠。2'-脱氧胞苷的两种产物被分离并鉴定为N 4 -羟基-2'-脱氧胞苷和N 4 ,5-环状酰胺-2'-脱氧胞苷，由来自尿酸的酰胺基团环加成形成。甲15 N-标记的尿酸，尿酸-1,3- 15 Ñ 2，具有两个14 N和2个15每分子N原子，产生Ñ 4，5-环含有酰胺-2'-脱氧胞苷14 N和15从尿酸-1,3- N原子15 ñ 2。单
• Beta-L-N4 Hydroxycytosine Deoxynucleosides and their use as Pharmaceutical Agents in the Prophylaxis or Therapy of Viral Diseases
  申请人：MOLEKULARE MEDIZIN MAX-DELBRUECK-CENTRUM FUER

  公开号：US20140031309A1

  公开（公告）日：2014-01-30

  The invention relates to ss-L-N4-hydroxycytosine nucleo-sides, pharmaceutical agents comprising same, and to the use of said ss-f31 L-N4-hydroxycytosine nucleosides and pharmaceutical agents in the prophylaxis or therapy of an infection caused by hepatitis B virus (HBV) or human immunodeficiency virus (HIV). The invention also relates to a method for the preparation of said ss-L-nucleoside and analogs.

  本发明涉及ss-L-N4-羟基胞嘧啶核苷、包含其的药物制剂，以及使用所述ss-L-N4-羟基胞嘧啶核苷和药物制剂在预防或治疗乙型肝炎病毒（HBV）或人免疫缺陷病毒（HIV）感染中的应用。本发明还涉及一种制备所述ss-L-核苷和类似物的方法。
• An Engineered Cytidine Deaminase for Biocatalytic Production of a Key Intermediate of the Covid-19 Antiviral Molnupiravir
  作者：Ashleigh J. Burke、William R. Birmingham、Ying Zhuo、Thomas W. Thorpe、Bruna Zucoloto da Costa、Rebecca Crawshaw、Ian Rowles、James D. Finnigan、Carl Young、Gregory M. Holgate、Mark P. Muldowney、Simon J. Charnock、Sarah L. Lovelock、Nicholas J. Turner、Anthony P. Green

  DOI：10.1021/jacs.1c11048

  日期：2022.3.9

  The Covid-19 pandemic highlights the urgent need for cost-effective processes to rapidly manufacture antiviral drugs at scale. Here we report a concise biocatalytic process for Molnupiravir, a nucleoside analogue recently approved as an orally available treatment for SARS-CoV-2. Key to the success of this process was the development of an efficient biocatalyst for the production of N-hydroxy-cytidine

  Covid-19 大流行凸显了迫切需要具有成本效益的工艺来快速大规模生产抗病毒药物。在这里，我们报告了 Molnupiravir 的简明生物催化过程，Molnupiravir 是一种核苷类似物，最近被批准作为 SARS-CoV-2 的口服治疗药物。这一过程成功的关键是通过水解酶胞苷脱氨酶的进化适应，开发出一种有效的生物催化剂，用于生产N-羟基胞苷。这种工程生物催化剂在不到 3 小时内完成 >85 000 次周转，在 180 g/L 底物负载下运行，并受益于N-羟基胞苷产物的原位结晶（85% 产率），该产物可通过以下方式转化为 Molnupiravir使用 Novozym 435 进行选择性 5'-酰化。