Effect of Chemical Modifications on Peptide Fragmentation Behavior upon Electron Transfer Induced Dissociation
作者:Marco L. Hennrich、Paul J. Boersema、Henk van den Toorn、Nikolai Mischerikow、Albert J. R. Heck、Shabaz Mohammed
DOI:10.1021/ac901108g
日期:2009.9.15
investigated the effect of several commonly used modification reactions, namely, guanidination, dimethylation, imidazolinylation, and nicotinylation (ICPL). Of these guanidination and imidazolinylation specifically target the ε-amino groups of lysine residues in the peptides, whereas dimethylation and nicotinylation modify both N-termini and ε-amino groups of lysine residues. Dimethylation, guanidination, and
在蛋白质组学中,经常对蛋白水解肽进行化学修饰,以改善MS分析,肽鉴定和/或实现蛋白质/肽定量。已知这种化学修饰可以改变碰撞诱导的解离MS / MS中的肽片段化。在这里,我们使用相对较新的激活方法电子转移解离(ETD)研究了这种化学修饰的肽在MS / MS中的断裂行为。我们使用蛋白酶Lys-N和胰蛋白酶生成了蛋白水解肽,并将未标记肽的片段化行为与其化学修饰的同源物进行了比较。我们研究了几种常用的修饰反应的作用,即胍基化,二甲基化,咪唑啉化和烟酰化(ICPL)。在这些胍基化和咪唑啉化中,特异性地靶向肽中赖氨酸残基的ε-氨基,而二甲基化和烟酰胺基化修饰赖氨酸残基的N-末端和ε-氨基。双电荷的Lys-N肽的二甲基化,胍基化,尤其是咪唑啉化导致肽序列覆盖率显着增加,从而导致使用ETD进行更可靠的肽鉴定。这可以通过增加碱性和在这些肽的N末端产生正电荷来合理化。另一方面,肽的烟酰化作用严重抑制了骨架断裂