methyl 8-((4-(((tert-butoxycarbonyl)amino)methyl)phenyl)amino)-8-oxooctanoate | 1160823-15-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: methyl 8-((4-(((tert-butoxycarbonyl)amino)methyl)phenyl)amino)-8-oxooctanoate
• 英文别名: Methyl 8-(4-((tert-butoxycarbonylamino)methyl)phenylamino)-8-oxooctanoate；methyl 8-[4-[[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]methyl]anilino]-8-oxooctanoate
• CAS: 1160823-15-3
• 化学式: C₂₁H₃₂N₂O₅
• 分子量: 392.495
• InChiKey: FVAIEILFRVMBIX-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.2
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.57
• 拓扑面积：
  93.7
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 8-((4-(((tert-butoxycarbonyl)amino)methyl)phenyl)amino)-8-oxooctanoate 在 N,N-二异丙基乙胺 、 乙酰氯 作用下， 以 甲醇 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  具有DNA程序亲和标记的组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）相关蛋白的鉴定。

  摘要：

  组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）是一类主要的脱乙酰基酶。许多HDAC存在于细胞中的大型蛋白质复合物中，其功能在很大程度上取决于复合物的组成。HDAC相关蛋白的鉴定对于理解其分子机制非常重要。尽管已开发出亲和探针来研究HDAC，但它们主要针对直接结合物HDAC，而复合物中的其他蛋白质仍未得到充分开发。我们报告了一种基于DNA的亲和标记方法，该方法能够呈现不同的探针配置而无需需要准备多个探针。使用一种结合探针，创建了9种探针配置以分析HDAC复合物。值得注意的是，这种方法鉴定了传统亲和探针可能无法获得的间接HDAC结合物，并且还揭示了与HDAC相关蛋白的新生物学意义。这项研究为表征蛋白质间相互作用提供了一种简单而广泛适用的方法。

  DOI：

  10.1002/anie.202001205
• 作为产物：
  描述：

  辛二酸单甲酯 、 4-(N-BOC-氨甲基)苯胺 在 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.0h， 以82%的产率得到methyl 8-((4-(((tert-butoxycarbonyl)amino)methyl)phenyl)amino)-8-oxooctanoate
  参考文献：
  名称：

  具有DNA程序亲和标记的组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）相关蛋白的鉴定。

  摘要：

  组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）是一类主要的脱乙酰基酶。许多HDAC存在于细胞中的大型蛋白质复合物中，其功能在很大程度上取决于复合物的组成。HDAC相关蛋白的鉴定对于理解其分子机制非常重要。尽管已开发出亲和探针来研究HDAC，但它们主要针对直接结合物HDAC，而复合物中的其他蛋白质仍未得到充分开发。我们报告了一种基于DNA的亲和标记方法，该方法能够呈现不同的探针配置而无需需要准备多个探针。使用一种结合探针，创建了9种探针配置以分析HDAC复合物。值得注意的是，这种方法鉴定了传统亲和探针可能无法获得的间接HDAC结合物，并且还揭示了与HDAC相关蛋白的新生物学意义。这项研究为表征蛋白质间相互作用提供了一种简单而广泛适用的方法。

  DOI：

  10.1002/anie.202001205

文献信息

• Fluorescent compounds that bind to histone deacetylase
  申请人：Heidebrecht, JR. Richard W.

  公开号：US20090156825A1

  公开（公告）日：2009-06-18

  The present invention relates to a novel class of fluorescent compounds that bind to histone deacetylases. The fluorescent compounds can be used to determine binding association and dissociation rates of histone deacetylase inhibitors via fluorescence polarization.

  本发明涉及一种新型荧光化合物类，其与组蛋白去乙酰化酶结合。这些荧光化合物可用于通过荧光偏振确定组蛋白去乙酰化酶抑制剂的结合关联和解离速率。
• METHODS FOR THE IDENTIFICATION AND CHARACTERIZATION OF HDAC INTERACTING COMPOUNDS
  申请人：Drewes Gerard

  公开号：US20130071854A1

  公开（公告）日：2013-03-21

  The present invention relates to methods for the identification and characterization (e.g. selectivity profiling) of HDAC interacting compounds using protein preparations derived from cells endogenously expressing HDACs or cell preparations containing said HDACs.

  本发明涉及使用从内源表达HDAC的细胞中得到的蛋白质制备或含有该HDAC的细胞制备，对HDAC相互作用化合物进行鉴定和表征（例如选择性分析）的方法。
• [EN] METHODS FOR THE IDENTIFICATION AND CHARACTERIZATION OF HDAC INTERACTING COMPOUNDS<br/>[FR] PROCÉDÉS D'IDENTIFICATION ET DE CARACTÉRISATION DE COMPOSÉS INTERAGISSANT AVEC L'HDAC
  申请人：CELLZOME AG

  公开号：WO2011018241A1

  公开（公告）日：2011-02-17

  The present invention relates to methods for the identification and characterization (e.g. selectivity profiling) of HDAC interacting compounds using protein preparations derived from cells endogenously expressing HDACs or cell preparations containing said HDACs.
• Identification of Histone deacetylase (HDAC)‐Associated Proteins with DNA‐Programmed Affinity Labeling
  作者：Jianfu Zhang、Jianzhao Peng、Yiran Huang、Ling Meng、Qingrong Li、Feng Xiong、Xiaoyu Li

  DOI：10.1002/anie.202001205

  日期：2020.9.28

  proteins in the complex remain underexplored. We report a DNA‐based affinity labeling method capable of presenting different probe configurations without the need for preparing multiple probes. Using one binding probe, 9 probe configurations were created to profile HDAC complexes. Notably, this method identified indirect HDAC binders that may be inaccessible to traditional affinity probes, and it also

  组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）是一类主要的脱乙酰基酶。许多HDAC存在于细胞中的大型蛋白质复合物中，其功能在很大程度上取决于复合物的组成。HDAC相关蛋白的鉴定对于理解其分子机制非常重要。尽管已开发出亲和探针来研究HDAC，但它们主要针对直接结合物HDAC，而复合物中的其他蛋白质仍未得到充分开发。我们报告了一种基于DNA的亲和标记方法，该方法能够呈现不同的探针配置而无需需要准备多个探针。使用一种结合探针，创建了9种探针配置以分析HDAC复合物。值得注意的是，这种方法鉴定了传统亲和探针可能无法获得的间接HDAC结合物，并且还揭示了与HDAC相关蛋白的新生物学意义。这项研究为表征蛋白质间相互作用提供了一种简单而广泛适用的方法。