Design, Synthesis, and Proof-of-Concept of Triple-Site Inhibitors against Aminoacyl-tRNA Synthetases
作者:Zhengjun Cai、Bingyi Chen、Ying Yu、Junsong Guo、Zhiteng Luo、Bao Cheng、Jun Xu、Qiong Gu、Huihao Zhou
DOI:10.1021/acs.jmedchem.2c00134
日期:2022.4.14
Aminoacyl-tRNA synthetases (aaRSs) are promising drug targets due to their essential roles in protein translation. Although current inhibitors primarily occupy one or two of the three substrate binding sites on aaRSs, we report here the structure-based design of the first class of triple-site aaRS inhibitors by targeting Salmonella enterica threonyl-tRNA synthetase (SeThrRS). Competition of our compounds
氨基酰基-tRNA 合成酶 (aaRS) 因其在蛋白质翻译中的重要作用而成为有前途的药物靶点。尽管目前的抑制剂主要占据 aaRS 上三个底物结合位点中的一个或两个,但我们在此报告了基于结构的第一类三重位点 aaRS 抑制剂的设计,它以肠沙门氏菌苏氨酰-tRNA 合成酶 ( Se ThrRS) 为靶点。我们的化合物与所有三种底物对Se ThrRS 结合的竞争通过等温滴定量热测定得到证实。与Se ThrRS结合的三种化合物的共晶结构明确证实了它们的底物模拟三点结合模式。化合物36j对Se ThrRS表现出最好的酶活性,IC 50 = 19 nM 和K d = 35.4 nM。化合物36b、36k和36l表现出抗菌活性,对受试细菌的最小抑制浓度值为 2-8 μg/mL,优于已报道的双位点 ThrRS 抑制剂。我们的研究为开发针对 aaRS 的三位点抑制剂提供了第一个概念验证,从而激发了未来基于 aaRS