(3R)-1-[5-chloro-6-ethyl-2-(1-oxidoquinolin-1-ium-7-yl)sulfanyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]pyrrolidin-3-amine | 1275606-44-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机硫化合物 - 硫醚类
• 英文名称: (3R)-1-[5-chloro-6-ethyl-2-(1-oxidoquinolin-1-ium-7-yl)sulfanyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]pyrrolidin-3-amine
• CAS: 1275606-44-4
• 化学式: C₂₁H₂₁ClN₆OS
• 分子量: 440.956
• InChiKey: GJQZONNPSGJUQF-CYBMUJFWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.5
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  122
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (R)-7-((4-(3-((tert-butoxycarbonyl)amino)pyrrolidin-1-yl)-6-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-yl)thio)quinoline 1-oxide 在 N-甲基吡咯烷酮 、 N-氯代丁二酰亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 (3R)-1-[5-chloro-6-ethyl-2-(1-oxidoquinolin-1-ium-7-yl)sulfanyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]pyrrolidin-3-amine
  参考文献：
  名称：

  DNA促旋酶B（GyrB）和拓扑异构酶IV（ParE）的吡咯并嘧啶抑制剂。第一部分：结构指导的具有强大的广谱酶活性的双重靶向剂的发现和优化

  摘要：

  细菌拓扑异构酶DNA回旋酶（GyrB）和拓扑异构酶IV（ParE）是在复制过程中控制DNA拓扑状态的必需酶。这些酶在ATP结合袋中的高度保守性使其成为广谱抑制剂开发的诱人靶标。从基于药效基团的片段筛选中鉴定出具有最佳潜力的吡咯并嘧啶骨架。使用选定的GyrB / ParE直系同源物进行的抑制剂复合物的结构表征有助于鉴定靶标ATP结合口袋中的重要空间，动态和组成差异，从而可以设计具有宽酶谱和双重靶向活性的高效吡咯并嘧啶抑制剂。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2012.11.032

文献信息

• GYRASE INHIBITORS
  申请人：Creighton Christopher J.

  公开号：US20130079323A1

  公开（公告）日：2013-03-28

  Novel gyrase inhibitors and related compositions and methods are useful for impeding bacterial growth. Compounds of Formula (I), are disclosed: Formula (I), wherein Y is N or CH; Z is N or CR 5 ; R 5 is H, a substituted or unsubstituted hydrocarbyl residue (1-3C) containing 0-2 heteroatoms selected from O, S and N, or is an inorganic residue; L is O, S, NR 7 , or CR 8 R 9 ; R 7 is H or C 1-3 alkyl; R 8 and R 9 are each independently H or C 1-3 alkyl; R 2 is H, a hydrocarbyl residue (1-40C) containing 0-10 heteroatoms selected from O, S and N optionally substituted with an inorganic residue; R 4 is H, an inorganic residue, or a hydrocarbyl residue (1-30C) containing 0-12 heteroatoms selected from O, S and N and containing 0-10 inorganic residues, wherein R 5 and R 4 together may join to form a fused ring; and R 6 is selected from the group consisting of H, C 1-5 alkyl, C 2-5 alkenyl, C 2-5 alkynyl, halo C 1-5 alkyl, halo C 2-5 alkenyl, halo C 2-5 alkynyl, C 1-5 hydroxyalkyl, C 1-5 alkyl chloride, C 2-5 alkenyl chloride, and C 2-5 alkynyl chloride; or a pharmaceutically-acceptable salt, ester, or prodrug thereof.

  新型螺旋酶抑制剂及相关组合物和方法，适用于阻碍细菌生长。其中公开了式（I）的化合物：式（I），其中Y为N或CH；Z为N或CR5；R5为H，含有0-2个来自O、S和N的杂原子的取代或未取代的碳氢基残基（1-3C），或为无机残基；L为O、S、NR7或CR8R9；R7为H或C1-3烷基；R8和R9各自独立地为H或C1-3烷基；R2为H，含有0-10个来自O、S和N的杂原子的碳氢基残基（1-40C），可选地取代为无机残基；R4为H、无机残基或含有0-12个来自O、S和N的杂原子和含有0-10个无机残基的碳氢基残基（1-30C），其中R5和R4可以共同形成融合环；R6选自H、C1-5烷基、C2-5烯基、C2-5炔基、卤代C1-5烷基、卤代C2-5烯基、卤代C2-5炔基、C1-5羟基烷基、C1-5氯代烷基、C2-5氯代烯基和C2-5氯代炔基的群；或其药学上可接受的盐、酯或前药。
• US9481675B2
  申请人：——

  公开号：US9481675B2

  公开（公告）日：2016-11-01
• Pyrrolopyrimidine inhibitors of DNA gyrase B (GyrB) and topoisomerase IV (ParE). Part I: Structure guided discovery and optimization of dual targeting agents with potent, broad-spectrum enzymatic activity
  作者：Leslie W. Tari、Michael Trzoss、Daniel C. Bensen、Xiaoming Li、Zhiyong Chen、Thanh Lam、Junhu Zhang、Christopher J. Creighton、Mark L. Cunningham、Bryan Kwan、Mark Stidham、Karen J. Shaw、Felice C. Lightstone、Sergio E. Wong、Toan B. Nguyen、Jay Nix、John Finn

  DOI：10.1016/j.bmcl.2012.11.032

  日期：2013.3

  The bacterial topoisomerases DNA gyrase (GyrB) and topoisomerase IV (ParE) are essential enzymes that control the topological state of DNA during replication. The high degree of conservation in the ATP-binding pockets of these enzymes make them appealing targets for broad-spectrum inhibitor development. A pyrrolopyrimidine scaffold was identified from a pharmacophore-based fragment screen with optimization

  细菌拓扑异构酶DNA回旋酶（GyrB）和拓扑异构酶IV（ParE）是在复制过程中控制DNA拓扑状态的必需酶。这些酶在ATP结合袋中的高度保守性使其成为广谱抑制剂开发的诱人靶标。从基于药效基团的片段筛选中鉴定出具有最佳潜力的吡咯并嘧啶骨架。使用选定的GyrB / ParE直系同源物进行的抑制剂复合物的结构表征有助于鉴定靶标ATP结合口袋中的重要空间，动态和组成差异，从而可以设计具有宽酶谱和双重靶向活性的高效吡咯并嘧啶抑制剂。