tert-butyl N-[(Z)-1-[[2-[[(E)-1-[[(2R)-1-[[(2R,3S)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[(Z)-1-[[(2R)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[1-[[(2S)-1-(dimethylamino)-3-methylbutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobut-2-en-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-2-oxoethyl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]-N-[(2S,3R)-3-hydroxy-3-methyl-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoyl]carbamate | 1428850-34-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机聚合物 - 多肽
• 英文名称: tert-butyl N-[(Z)-1-[[2-[[(E)-1-[[(2R)-1-[[(2R,3S)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[(Z)-1-[[(2R)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[1-[[(2S)-1-(dimethylamino)-3-methylbutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobut-2-en-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-2-oxoethyl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]-N-[(2S,3R)-3-hydroxy-3-methyl-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoyl]carbamate
• CAS: 1428850-34-3
• 化学式: C₈₂H₁₄₃N₁₅O₂₀
• 分子量: 1659.13
• InChiKey: IPQMOXXPRKGTMT-VVAPBIAJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.1
• 重原子数：
  117
• 可旋转键数：
  46
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.72
• 拓扑面积：
  498
• 氢给体数：
  16
• 氢受体数：
  21

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl N-[(Z)-1-[[2-[[(E)-1-[[(2R)-1-[[(2R,3S)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[(Z)-1-[[(2R)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[1-[[(2S)-1-(dimethylamino)-3-methylbutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobut-2-en-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-2-oxoethyl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]-N-[(2S,3R)-3-hydroxy-3-methyl-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoyl]carbamate 在 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.5h， 生成 (2S,3R)-2-amino-N-[(Z)-1-[[2-[[(E)-1-[[(2R)-1-[[(2R,3S)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[(Z)-1-[[(2R)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[1-[[(2S)-1-(dimethylamino)-3-methylbutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobut-2-en-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-2-oxoethyl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]-3-hydroxy-3-methylpentanamide
  参考文献：
  名称：

  Yaku'amide A的全合成和完整结构分配

  摘要：

  在这里，我们报告了 yaku'amide A 的第一次全合成和完整的立体化学分配。 Yaku'amide A (1) 是从海绵 Ceratopsion sp. 中分离出来的。作为一种非常有效的细胞毒素。除了 N 端酰基 (NTA) 中的 C4 立体化学外，确定了其结构。这种十三肽由 2 个蛋白原氨基酸残基和 11 个非蛋白原氨基酸残基组成，并用 NTA 和一个 C 端胺 (CTA) 封端。α,β-脱氢缬氨酸、E- 和 Z-α,β-脱氢异亮氨酸是 1 中最不寻常的非蛋白质残基，因此需要开发新的组装方法。因此，Cu 介导的交叉偶联反应有效地用于 E/Z 选择性合成三种二肽与脱氢异亮氨酸以及构建四肽与脱氢缬氨酸。然后以逐步方式从四肽延长肽以提供 1 的两种可能的 C4-差向异构体。广泛的 NMR 研究表明，天然 1 具有 C4S-立体化学，使用 P388 小鼠白血病细胞的生物学分析表明，C4-差向异构体具有相当的毒性。用于构建

  DOI：

  10.1021/ja401457h
• 作为产物：
  描述：

  (2R,3S)-2-[[(2R)-2-[[(E)-2-[(2-aminoacetyl)amino]-3-methylpent-2-enoyl]amino]-3-methylbutanoyl]amino]-N-[(2S)-1-[[(2R)-1-[[(Z)-1-[[(2R)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[1-[[(2S)-1-(dimethylamino)-3-methylbutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobut-2-en-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-3-methylpentanamide 、 (Z)-2-[[(2S,3R)-3-hydroxy-3-methyl-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoyl]-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]amino]-3-methylpent-2-enoic acid 在 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 17.0h， 以78.8 mg的产率得到tert-butyl N-[(Z)-1-[[2-[[(E)-1-[[(2R)-1-[[(2R,3S)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[(Z)-1-[[(2R)-1-[[(2S)-1-[[(2R)-1-[[1-[[(2S)-1-(dimethylamino)-3-methylbutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobut-2-en-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-hydroxy-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]amino]-2-oxoethyl]amino]-3-methyl-1-oxopent-2-en-2-yl]-N-[(2S,3R)-3-hydroxy-3-methyl-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoyl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  Yaku'amide A的全合成和完整结构分配

  摘要：

  在这里，我们报告了 yaku'amide A 的第一次全合成和完整的立体化学分配。 Yaku'amide A (1) 是从海绵 Ceratopsion sp. 中分离出来的。作为一种非常有效的细胞毒素。除了 N 端酰基 (NTA) 中的 C4 立体化学外，确定了其结构。这种十三肽由 2 个蛋白原氨基酸残基和 11 个非蛋白原氨基酸残基组成，并用 NTA 和一个 C 端胺 (CTA) 封端。α,β-脱氢缬氨酸、E- 和 Z-α,β-脱氢异亮氨酸是 1 中最不寻常的非蛋白质残基，因此需要开发新的组装方法。因此，Cu 介导的交叉偶联反应有效地用于 E/Z 选择性合成三种二肽与脱氢异亮氨酸以及构建四肽与脱氢缬氨酸。然后以逐步方式从四肽延长肽以提供 1 的两种可能的 C4-差向异构体。广泛的 NMR 研究表明，天然 1 具有 C4S-立体化学，使用 P388 小鼠白血病细胞的生物学分析表明，C4-差向异构体具有相当的毒性。用于构建

  DOI：

  10.1021/ja401457h