1-(3-hydroxy-2-(hydroxymethyl)-2-methylpropyl)-6,7-dihydro-1H-cyclopenta[d]pyrimidine-2,4(3H,5H)-dione | 1414929-87-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-(3-hydroxy-2-(hydroxymethyl)-2-methylpropyl)-6,7-dihydro-1H-cyclopenta[d]pyrimidine-2,4(3H,5H)-dione
• 英文别名: 1-[3-hydroxy-2-(hydroxymethyl)-2-methylpropyl]-6,7-dihydro-5H-cyclopenta[d]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1414929-87-5
• 化学式: C₁₂H₁₈N₂O₄
• 分子量: 254.286
• InChiKey: ODZLBXUGYPRVRO-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.8
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  89.9
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(3-hydroxy-2-(hydroxymethyl)-2-methylpropyl)-6,7-dihydro-1H-cyclopenta[d]pyrimidine-2,4(3H,5H)-dione 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 1.5h， 以44%的产率得到1-[2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-hydroxy-2-methylpropyl]-6,7-dihydro-5H-cyclopenta[d]pyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  研究T 7和T 12残基对凝血酶结合适体的生物学特性的作用：通过单个核碱基修饰增强抗凝活性。

  摘要：

  合成了一个无环嘧啶类似物，它包含一个在嘧啶环上稠合的五元环，并被引入到15-聚寡脱氧核苷酸GGTTGGTGTGGGGGG的7位或12位，称为凝血酶结合适体（TBA）。表征1个所得适体的1 H NMR和CD光谱，TBA-T 7 b和TBA-T 12 b，显示了他们的折叠成由TBA形成的典型反平行chairlike G-四链体结构的能力。明显的CD熔融温度表明，主要在位置7处引入无环残基相对于TBA提高了所得G-四链体的热稳定性。然后在PT分析中评估了新分子的抗凝活性，结果表明TBA-T7 b是在延长凝血时间比TBA更有效。另一方面，在纯化的纤维蛋白原测定中，两种修饰序列的凝血酶抑制活性均低于使用人酶的TBA，而使用牛酶则再次逆转了效价趋势。通过结构和计算研究对获得的结构-活性关系进行了研究。综上所述，这些结果揭示了TBA残基T 7和T 12的活跃作用以及位于蛋白质的阴离子结合异位点I中的某些

  DOI：

  10.1021/jm301414f
• 作为产物：
  描述：

  3-benzoyl-1-[(2,2,5-trimethyl-1,3-dioxan-5-yl)methyl]-6,7-dihydro-1H-cyclopenta[d]pyrimidine-2,4(3H,5H)-dione 在 水 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 8.0h， 以98%的产率得到1-(3-hydroxy-2-(hydroxymethyl)-2-methylpropyl)-6,7-dihydro-1H-cyclopenta[d]pyrimidine-2,4(3H,5H)-dione
  参考文献：
  名称：

  研究T 7和T 12残基对凝血酶结合适体的生物学特性的作用：通过单个核碱基修饰增强抗凝活性。

  摘要：

  合成了一个无环嘧啶类似物，它包含一个在嘧啶环上稠合的五元环，并被引入到15-聚寡脱氧核苷酸GGTTGGTGTGGGGGG的7位或12位，称为凝血酶结合适体（TBA）。表征1个所得适体的1 H NMR和CD光谱，TBA-T 7 b和TBA-T 12 b，显示了他们的折叠成由TBA形成的典型反平行chairlike G-四链体结构的能力。明显的CD熔融温度表明，主要在位置7处引入无环残基相对于TBA提高了所得G-四链体的热稳定性。然后在PT分析中评估了新分子的抗凝活性，结果表明TBA-T7 b是在延长凝血时间比TBA更有效。另一方面，在纯化的纤维蛋白原测定中，两种修饰序列的凝血酶抑制活性均低于使用人酶的TBA，而使用牛酶则再次逆转了效价趋势。通过结构和计算研究对获得的结构-活性关系进行了研究。综上所述，这些结果揭示了TBA残基T 7和T 12的活跃作用以及位于蛋白质的阴离子结合异位点I中的某些

  DOI：

  10.1021/jm301414f