6-((Z)-(R)-19-methoxy-2,11-dioxo-13-oxa-3,10-diaza-tricyclo[15.3.1.0*4,9*]henicosa-1(21),4,6,8,15,17,19-heptaen-12-yl)-hexanoic acid methyl ester | 1257657-61-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 大环内酰胺类
• 英文名称: 6-((Z)-(R)-19-methoxy-2,11-dioxo-13-oxa-3,10-diaza-tricyclo[15.3.1.0*4,9*]henicosa-1(21),4,6,8,15,17,19-heptaen-12-yl)-hexanoic acid methyl ester
• 英文别名: methyl 6-[(12R,15Z)-19-methoxy-2,11-dioxo-13-oxa-3,10-diazatricyclo[15.3.1.04,9]henicosa-1(20),4,6,8,15,17(21),18-heptaen-12-yl]hexanoate
• CAS: 1257657-61-6
• 化学式: C₂₆H₃₀N₂O₆
• 分子量: 466.534
• InChiKey: URIMITLGEGVWBQ-UFTUAFODSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.6
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  103
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-((Z)-(R)-19-methoxy-2,11-dioxo-13-oxa-3,10-diaza-tricyclo[15.3.1.0*4,9*]henicosa-1(21),4,6,8,15,17,19-heptaen-12-yl)-hexanoic acid methyl ester 在 羟胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 为溶剂， 生成 6-((Z)-(R)-19-methoxy-2,11-dioxo-13-oxa-3,10-diaza-tricyclo[15.3.1.0*4,9*]henicosa-1(21),4,6,8,15,17,19-heptaen-12-yl)-hexanoic hydroxamic acid
  参考文献：
  名称：

  组蛋白脱乙酰基酶的非天然大环抑制剂：设计，合成和活性。

  摘要：

  非肽手性大环化合物是基于辛二酰苯胺异羟肟酸（2）（SAHA，vorinostat）的类似物设计的，并针对11种组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）同工型进行了评估。HDACs帽区域中高度保守的关键氨基酸残基的鉴定指导了基于亚油酰基的大环的设计，预计这些大环具有靶向整个HDAC面板所需的最大通用亚结构。观察到了几种化合物的纳摩尔HDAC抑制谱，即使不是更好，也可与2种相比。。发现针对肺癌和结肠癌细胞系的选定大环化合物有希望的细胞毒性活性。进一步精制选定的候选物，使得化合物对HDAC6的选择性优于其他同工酶。使用配对拟合分析将最佳候选之一与天然四肽阿匹西丁进行比较，以定义一种通用药效团，该药效团可能在设计肽类大环化合物的替代物时作为有效的和同工型选择性抑制剂。

  DOI：

  10.1021/jm101092u
• 作为产物：
  描述：

  (R)-methyl 3-(2-(3-methoxy-5-vinylbenzamido)phenylcarbamoyl)-3-(allyloxy)propanoate 在 RuCl2(1,3-dimesityl-imidazolidin-2-yl)(PCy3)(=CHPh) 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 48.0h， 以26%的产率得到6-((Z)-(R)-19-methoxy-2,11-dioxo-13-oxa-3,10-diaza-tricyclo[15.3.1.0*4,9*]henicosa-1(21),4,6,8,15,17,19-heptaen-12-yl)-hexanoic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  组蛋白脱乙酰基酶的非天然大环抑制剂：设计，合成和活性。

  摘要：

  非肽手性大环化合物是基于辛二酰苯胺异羟肟酸（2）（SAHA，vorinostat）的类似物设计的，并针对11种组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）同工型进行了评估。HDACs帽区域中高度保守的关键氨基酸残基的鉴定指导了基于亚油酰基的大环的设计，预计这些大环具有靶向整个HDAC面板所需的最大通用亚结构。观察到了几种化合物的纳摩尔HDAC抑制谱，即使不是更好，也可与2种相比。。发现针对肺癌和结肠癌细胞系的选定大环化合物有希望的细胞毒性活性。进一步精制选定的候选物，使得化合物对HDAC6的选择性优于其他同工酶。使用配对拟合分析将最佳候选之一与天然四肽阿匹西丁进行比较，以定义一种通用药效团，该药效团可能在设计肽类大环化合物的替代物时作为有效的和同工型选择性抑制剂。

  DOI：

  10.1021/jm101092u

文献信息

• Non-Natural Macrocyclic Inhibitors of Histone Deacetylases: Design, Synthesis, and Activity
  作者：Luciana Auzzas、Andreas Larsson、Riccardo Matera、Annamaria Baraldi、Benoît Deschênes-Simard、Giuseppe Giannini、Walter Cabri、Gianfranco Battistuzzi、Grazia Gallo、Andrea Ciacci、Loredana Vesci、Claudio Pisano、Stephen Hanessian

  DOI：10.1021/jm101092u

  日期：2010.12.9

  inhibitory profile was observed for several compounds, which was comparable, if not superior, to that of 2. A promising cytotoxic activity was found for selected macrocycles against lung and colon cancer cell lines. Further elaboration of selected candidates led to compounds with an improved selectivity against HDAC6 over the other isozymes. Pair-fitting analysis was used to compare one of the best

  非肽手性大环化合物是基于辛二酰苯胺异羟肟酸（2）（SAHA，vorinostat）的类似物设计的，并针对11种组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）同工型进行了评估。HDACs帽区域中高度保守的关键氨基酸残基的鉴定指导了基于亚油酰基的大环的设计，预计这些大环具有靶向整个HDAC面板所需的最大通用亚结构。观察到了几种化合物的纳摩尔HDAC抑制谱，即使不是更好，也可与2种相比。。发现针对肺癌和结肠癌细胞系的选定大环化合物有希望的细胞毒性活性。进一步精制选定的候选物，使得化合物对HDAC6的选择性优于其他同工酶。使用配对拟合分析将最佳候选之一与天然四肽阿匹西丁进行比较，以定义一种通用药效团，该药效团可能在设计肽类大环化合物的替代物时作为有效的和同工型选择性抑制剂。