5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3'-O-acetyl-4-N-allyloxycarbonyl-2'-deoxycytidine | 444343-83-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3'-O-acetyl-4-N-allyloxycarbonyl-2'-deoxycytidine
• 英文别名: [(2R,3S,5R)-2-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-5-[2-oxo-4-(prop-2-enoxycarbonylamino)pyrimidin-1-yl]oxolan-3-yl] acetate
• CAS: 444343-83-3
• 化学式: C₂₁H₃₃N₃O₇Si
• 分子量: 467.594
• InChiKey: YZQQDCYWYRIDLY-LZLYRXPVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.22
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  116
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3'-O-acetyl-4-N-allyloxycarbonyl-2'-deoxycytidine 在 terazole 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 27.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  通过使用酶不稳定的氨基甲酸酯保护基合成核苷酸肽。

  摘要：

  核蛋白是天然存在的生物聚合物，其中丝氨酸，苏氨酸或酪氨酸部分的羟基通过磷酸二酯基连接到核酸的3'-或5'-末端。为了研究其中涉及核蛋白的生物学现象，例如病毒复制，体现肽链和寡核苷酸之间的特征性连接的核苷酸肽可以用作强大的工具。然而，由于核苷酸的多功能性和明显的酸和碱不稳定性，它们的合成需要应用各种正交稳定的保护基团，这些保护基团可以在最温和的条件下除去。我们开发了一种新的温和酶解保护方法，即 青霉素G酰基转移酶催化的N-苯基乙酰氧基苄氧基羰基（PhAcOZ）基团的水解，用于合成核苷酸肽。我们通过将N-末端去保护的核苷酸肽31 ac与PhAcOZ保护的氨基酸偶联，然后从青霉素G酰基转移酶完全保护的核苷酸四肽32 a，b中除去N-PhAcOZ基团，证明了该方法的广泛适用性。反应条件非常温和（pH 6.8），因此未观察到不希望的副反应，例如核苷酸键的断裂或核苷酸的β-消除。我们通过将N-末端去保护的核苷酸肽31

  DOI：

  10.1002/1521-3765(20020415)8:8<1879::aid-chem1879>3.0.co;2-5
• 作为产物：
  描述：

  乙酸酐 、 {1-[(2R,4S,5R)-5-(tert-Butyl-dimethyl-silanyloxymethyl)-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl]-2-oxo-1,2-dihydro-pyrimidin-4-yl}-carbamic acid allyl ester 在 吡啶 作用下， 反应 3.0h， 以99%的产率得到5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3'-O-acetyl-4-N-allyloxycarbonyl-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  通过使用酶不稳定的氨基甲酸酯保护基合成核苷酸肽。

  摘要：

  核蛋白是天然存在的生物聚合物，其中丝氨酸，苏氨酸或酪氨酸部分的羟基通过磷酸二酯基连接到核酸的3'-或5'-末端。为了研究其中涉及核蛋白的生物学现象，例如病毒复制，体现肽链和寡核苷酸之间的特征性连接的核苷酸肽可以用作强大的工具。然而，由于核苷酸的多功能性和明显的酸和碱不稳定性，它们的合成需要应用各种正交稳定的保护基团，这些保护基团可以在最温和的条件下除去。我们开发了一种新的温和酶解保护方法，即 青霉素G酰基转移酶催化的N-苯基乙酰氧基苄氧基羰基（PhAcOZ）基团的水解，用于合成核苷酸肽。我们通过将N-末端去保护的核苷酸肽31 ac与PhAcOZ保护的氨基酸偶联，然后从青霉素G酰基转移酶完全保护的核苷酸四肽32 a，b中除去N-PhAcOZ基团，证明了该方法的广泛适用性。反应条件非常温和（pH 6.8），因此未观察到不希望的副反应，例如核苷酸键的断裂或核苷酸的β-消除。我们通过将N-末端去保护的核苷酸肽31

  DOI：

  10.1002/1521-3765(20020415)8:8<1879::aid-chem1879>3.0.co;2-5