5-propargyloxymethyl-2'-deoxyuridine | 1028057-95-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-propargyloxymethyl-2'-deoxyuridine
• CAS: 1028057-95-5
• 化学式: C₁₃H₁₆N₂O₆
• 分子量: 296.28
• InChiKey: BCKPTXCUDZJBNB-HBNTYKKESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.67
• 重原子数：
  21.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  113.78
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-propargyloxymethyl-2'-deoxyuridine 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 二异丙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  新型核苷5'-三磷酸和含炔或氨基的亚磷酰胺的合成，用于核酸的后合成功能

  摘要：

  设计并合成了一系列新的含有炔或氨基的核苷5'-三磷酸和亚磷酰胺，用于核酸的后合成功能。为此，使用了新的3-氨基丙氧基丙炔基连接基团。它包含两种替代功能：用于氨基-炔基修饰的寡核苷酸与相应的活化酯反应的氨基和用于铜（I）催化的叠氮化物-炔烃环加成（CuAAC）反应的炔基。结果表明，可以使用多种连接新接头的方法来合成各种修饰的嘧啶核苷。

  DOI：

  10.1080/15257770.2011.595379
• 作为产物：
  描述：

  3',5'-O-diacetyl-5-propargyloxymethyl-2'-deoxyuridine 在 氨 、 水 作用下， 反应 16.0h， 以60%的产率得到5-propargyloxymethyl-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  新型核苷5'-三磷酸和含炔或氨基的亚磷酰胺的合成，用于核酸的后合成功能

  摘要：

  设计并合成了一系列新的含有炔或氨基的核苷5'-三磷酸和亚磷酰胺，用于核酸的后合成功能。为此，使用了新的3-氨基丙氧基丙炔基连接基团。它包含两种替代功能：用于氨基-炔基修饰的寡核苷酸与相应的活化酯反应的氨基和用于铜（I）催化的叠氮化物-炔烃环加成（CuAAC）反应的炔基。结果表明，可以使用多种连接新接头的方法来合成各种修饰的嘧啶核苷。

  DOI：

  10.1080/15257770.2011.595379

文献信息

• Fast Access to 5-Hydroxymethyl Derivatives of 2′-Deoxyuridine Promoted by Acidic Amberlyst 15 Resin
  作者：D. Guianvarc’h、G. Doisneau、D. Liu、O. Monfret、Y. Bourdreux、D. Urban

  DOI：10.1055/a-1961-7251

  日期：2023.1

  5-hydroxymethylated derivatives of pyrimidine nucleosides are an important class of biologically relevant compounds. In addition, such derivatives and related compounds can be functionalized for various applications. To enable fast, economical and efficient access to 5-hydroxymethylated derivatives of 2’-deoxyuridine, we report a method of O-5 chemoselective transformation of unprotected 5-hydroxy

  嘧啶核苷的 5-羟甲基化衍生物是一类重要的生物学相关化合物。此外，这些衍生物和相关化合物可以被功能化以用于各种应用。为了能够快速、经济和有效地获得 2'-脱氧尿苷的 5-羟甲基化衍生物，我们报告了一种 O-5 化学选择性转化未受保护的 5-羟甲基-2'-脱氧尿苷 (5hmdU) 的方法，该方法依赖于在存在的情况下的选择性醚化酒精在室温下由酸性 Amberlyst 15 树脂促进。与先前描述的严酷条件相比，这些温和条件构成了显着改善。适用于各种伯醇或仲醇，反应底物范围广，合成了5hmdU的24 C-5修饰衍生物，分离收率高。
• Novel Fluorescent Pyrimidine Nucleosides Containing 2,1,3-Benzoxadiazole and Naphtho-[1,2,3-CD] Indole-6 (2H)-One Fragments
  作者：Svetlana V. Vasilyeva、Anastasya S. Kuznetsova、Juliya G. Khalyavina、Valeria A. Glazunova、Alexander A. Shtil、Leonid M. Gornostaev、Vladimir N. Silnikov

  DOI：10.1080/15257770.2014.913064

  日期：2014.9.2

  A series of novel fluorescent pyrimidine nucleosides containing 2,1,3-benzoxadiazole or naphtho[1,2,3-cd]indole-6 (2h)-one fragments was designed and synthesized. Introduction of fluorescent fragments into the position 5 of the uridine or cytidine heterocycle was carried out in two ways: by Sonogashira Coupling Reaction and CuI-catalyzed cycloaddition ("click" reaction). The obtained nucleoside derivatives became fluorescent due to the inserted fragments. The excitation wavelength (440-450 nm) was outside the absorption band of many biomolecules and significantly differed from the emission wavelength (560-600 nm). In addition, the intended nucleoside analogs were shown to kill cultured human tumor cells at submicromolar concentrations.