1-((1'R,3'S,4'R)-3'-benzyloxy-4'-benzyloxymethylcyclopentyl)-3,4-dihydro-1H-1,3-diazepin-2(7H)-one | 1177260-62-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 1-((1'R,3'S,4'R)-3'-benzyloxy-4'-benzyloxymethylcyclopentyl)-3,4-dihydro-1H-1,3-diazepin-2(7H)-one
• 英文别名: 3-[(1R,3S,4R)-3-phenylmethoxy-4-(phenylmethoxymethyl)cyclopentyl]-4,7-dihydro-1H-1,3-diazepin-2-one
• CAS: 1177260-62-6
• 化学式: C₂₅H₃₀N₂O₃
• 分子量: 406.525
• InChiKey: SYSMTYJTBVICGD-SMIHKQSGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  50.8
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-((1'R,3'S,4'R)-3'-benzyloxy-4'-benzyloxymethylcyclopentyl)-3,4-dihydro-1H-1,3-diazepin-2(7H)-one 在 三氯化硼 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 以69%的产率得到1-((1'R,3'S,4'R)-3'-hydroxy-4'-hydroxymethylcyclopentyl)-3,4-dihydro-1H-1,3-diazepin-2(7H)-one
  参考文献：
  名称：

  1,3-二氮杂酮核苷（一种高亲和力胞苷脱氨酶抑制剂）的锁定碳环类似物的合成和构象分析

  摘要：

  胞苷脱氨酶 (CDA) 通过由锌结合水在活性位点的亲核攻击产生的水合过渡态中间体催化胞苷脱氨。离开的NH 3基团被质子取代并防止过渡态转化为产物的核苷类似物是非常有效的酶抑制剂。然而，这些类似物的稳定碳环形式不太有效，因为核糖在促进水合物种形成方面的作用被取消。发现 1,3-二氮杂酮核苷 ( 4) 作为 CDA 的紧密结合抑制剂，独立于水合作用，为研究构建为构象锁定的碳环 1,3-二氮杂酮核苷的新型抑制剂提供了机会，以确定酶对特定形式的糖褶的构象偏好。这项工作描述了两个目标双环 [3.1.0] 己烷核苷的合成，锁定为北 ( 5 ) 和南 ( 6 ) 构象异构体，以及一个灵活的类似物 ( 7) 由环戊烷环构成。所有三个目标中的七元 1,3-二氮杂环酮环是通过闭环复分解由相应的苯甲酰基保护的碳环双烯丙基脲构建的。结果表明 CDA 对南糖褶皱的结合偏好与结合在活性位点的其他 CDA 抑制剂的高分辨率晶体结构一致。

  DOI：

  10.1021/jo901127a
• 作为产物：
  描述：

  1-benzoyl-3-((1'R,3'S,4'R)-3'-benzyloxy-4'-benzyloxymethylcyclopentyl)-3,4-dihydro-1H-1,3-diazepin-2(7H)-one 在 sodium hydroxide 、 盐酸 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 1.17h， 以74%的产率得到1-((1'R,3'S,4'R)-3'-benzyloxy-4'-benzyloxymethylcyclopentyl)-3,4-dihydro-1H-1,3-diazepin-2(7H)-one
  参考文献：
  名称：

  1,3-二氮杂酮核苷（一种高亲和力胞苷脱氨酶抑制剂）的锁定碳环类似物的合成和构象分析

  摘要：

  胞苷脱氨酶 (CDA) 通过由锌结合水在活性位点的亲核攻击产生的水合过渡态中间体催化胞苷脱氨。离开的NH 3基团被质子取代并防止过渡态转化为产物的核苷类似物是非常有效的酶抑制剂。然而，这些类似物的稳定碳环形式不太有效，因为核糖在促进水合物种形成方面的作用被取消。发现 1,3-二氮杂酮核苷 ( 4) 作为 CDA 的紧密结合抑制剂，独立于水合作用，为研究构建为构象锁定的碳环 1,3-二氮杂酮核苷的新型抑制剂提供了机会，以确定酶对特定形式的糖褶的构象偏好。这项工作描述了两个目标双环 [3.1.0] 己烷核苷的合成，锁定为北 ( 5 ) 和南 ( 6 ) 构象异构体，以及一个灵活的类似物 ( 7) 由环戊烷环构成。所有三个目标中的七元 1,3-二氮杂环酮环是通过闭环复分解由相应的苯甲酰基保护的碳环双烯丙基脲构建的。结果表明 CDA 对南糖褶皱的结合偏好与结合在活性位点的其他 CDA 抑制剂的高分辨率晶体结构一致。

  DOI：

  10.1021/jo901127a

文献信息

• Synthesis and Conformational Analysis of Locked Carbocyclic Analogues of 1,3-Diazepinone Riboside, a High-Affinity Cytidine Deaminase Inhibitor
  作者：Olaf R. Ludek、Gottfried K. Schroeder、Chenzhong Liao、Pamela L. Russ、Richard Wolfenden、Victor E. Marquez

  DOI：10.1021/jo901127a

  日期：2009.8.21

  site. Nucleoside analogues where the leaving NH3 group is replaced by a proton and prevent conversion of the transition state to product are very potent inhibitors of the enzyme. However, stable carbocyclic versions of these analogues are less effective as the role of the ribose in facilitating formation of hydrated species is abolished. The discovery that a 1,3-diazepinone riboside (4) operated as a

  胞苷脱氨酶 (CDA) 通过由锌结合水在活性位点的亲核攻击产生的水合过渡态中间体催化胞苷脱氨。离开的NH 3基团被质子取代并防止过渡态转化为产物的核苷类似物是非常有效的酶抑制剂。然而，这些类似物的稳定碳环形式不太有效，因为核糖在促进水合物种形成方面的作用被取消。发现 1,3-二氮杂酮核苷 ( 4) 作为 CDA 的紧密结合抑制剂，独立于水合作用，为研究构建为构象锁定的碳环 1,3-二氮杂酮核苷的新型抑制剂提供了机会，以确定酶对特定形式的糖褶的构象偏好。这项工作描述了两个目标双环 [3.1.0] 己烷核苷的合成，锁定为北 ( 5 ) 和南 ( 6 ) 构象异构体，以及一个灵活的类似物 ( 7) 由环戊烷环构成。所有三个目标中的七元 1,3-二氮杂环酮环是通过闭环复分解由相应的苯甲酰基保护的碳环双烯丙基脲构建的。结果表明 CDA 对南糖褶皱的结合偏好与结合在活性位点的其他 CDA 抑制剂的高分辨率晶体结构一致。