cyclic Ala-Thr-Dab-Dab-Dab-D-Phe-Leu-Dab-Dab-Thr, containing amide bond between γ-NH2 of Dab⁴ and α-COOH of Thr¹⁰ | 873440-53-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机聚合物 - 多肽
• 英文名称: cyclic Ala-Thr-Dab-Dab-Dab-D-Phe-Leu-Dab-Dab-Thr, containing amide bond between γ-NH2 of Dab⁴ and α-COOH of Thr¹⁰
• 英文别名: H-Ala-Thr-Dab-Dab(1)-Dab-D-Phe-Leu-Dab-Dab-Thr-(1)；(2S,3R)-N-[(2S)-4-amino-1-oxo-1-[[(3S,6S,9S,12S,15R,18S,21S)-6,9,18-tris(2-aminoethyl)-15-benzyl-3-[(1R)-1-hydroxyethyl]-12-(2-methylpropyl)-2,5,8,11,14,17,20-heptaoxo-1,4,7,10,13,16,19-heptazacyclotricos-21-yl]amino]butan-2-yl]-2-[[(2S)-2-aminopropanoyl]amino]-3-hydroxybutanamide
• CAS: 873440-53-0
• 化学式: C₄₆H₇₉N₁₅O₁₂
• 分子量: 1034.23
• InChiKey: SSVSMOGRWNJYRB-KAVZBENNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.1
• 重原子数：
  73
• 可旋转键数：
  20
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.65
• 拓扑面积：
  462
• 氢给体数：
  17
• 氢受体数：
  17

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  cyclic Ala-Thr-Dab-Dab-Dab-D-Phe-Leu-Dab-Dab-Thr, containing amide bond between γ-NH2 of Dab⁴ and α-COOH of Thr¹⁰ 在 盐酸 作用下， 以 水 、 乙腈 为溶剂， 生成 cyclic Ala-Thr-Dab-Dab-Dab-D-Phe-Leu-Dab-Dab-Thr hydrochloride, containing amide bond between γ-NH2 of Dab⁴ and α-COOH of Thr¹⁰
  参考文献：
  名称：

  Development of Des-Fatty Acyl-Polymyxin B Decapeptide Analogs with Pseudomonas aeruginosa-Specific Antimicrobial Activity

  摘要：

  合成了 12 个去脂肪酰基多粘菌素 B（Des-FA-[X1]-PMB，X=各种氨基酸或肽）的 N 端类似物，并考察了它们对大肠杆菌（E. coli）、鼠伤寒沙门氏菌（S. Typhimurium）和铜绿假单胞菌（P. aeruginosa）的抗菌活性。研究发现，Des-FA-[Dap1]-、Des-FA-[Ser1]-、Des-FA-[Dab-Dab-Dab1]-和 Des-FA-[Arg-Arg-Arg1]-PMB仅对铜绿假单胞菌具有强效活性，其 MIC 值为 0.5-1 nmol/ml。与先导化合物 Des-FA-[Dab1]-PMB 和多粘菌素 B (PMB) 相比，X 为 Lys、Arg、Leu 或 Ala 的类似物对三种受试细菌的抗菌活性并没有提高。Des-FA-[Trp1]-PMB 和 Des-FA-[Phe1]-PMB 对铜绿假单胞菌的活性降低。结果表明，N-末端的紧密亲水氨基酸（C3）或碱性三肽为铜绿假单胞菌的杀菌活性提供了特异性。在 LPS 结合活性方面，Des-FA-[Dab-Dab-Dab1]-PMB 和 Des-FA-[Arg-Arg-Arg1]-PMB 的活性与 PMB 相当，而 Des-FA-[Ala-Ala-Ala1]-PMB 的活性则非常低。小鼠尾部静脉注射试验表明，Des-FA-[Dap1]-PMB 和 Des-FA-[Trp1]-PMB 的急性毒性较低，半数致死剂量分别为 23.5 和 19.0 μmol/kg，而 PMB 的半数致死剂量为 4.8 μmol/kg。

  DOI：

  10.1248/cpb.57.332
• 作为产物：
  描述：

  cyclic Fmoc-Ala-Thr(Bzl)-Dab(2-CIZ)-Dab-Dab(2-CIZ)-D-Phe-Leu-Dab(2-CIZ)-Dab(2-CIZ)-Thr(Bzl), containing amide bond between γ-NH2 of Dab⁴ and α-COOH of Thr¹⁰ 在 哌啶 、 氢氟酸 、 苯甲醚 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.25h， 生成 cyclic Ala-Thr-Dab-Dab-Dab-D-Phe-Leu-Dab-Dab-Thr, containing amide bond between γ-NH2 of Dab⁴ and α-COOH of Thr¹⁰
  参考文献：
  名称：

  Development of Des-Fatty Acyl-Polymyxin B Decapeptide Analogs with Pseudomonas aeruginosa-Specific Antimicrobial Activity

  摘要：

  合成了 12 个去脂肪酰基多粘菌素 B（Des-FA-[X1]-PMB，X=各种氨基酸或肽）的 N 端类似物，并考察了它们对大肠杆菌（E. coli）、鼠伤寒沙门氏菌（S. Typhimurium）和铜绿假单胞菌（P. aeruginosa）的抗菌活性。研究发现，Des-FA-[Dap1]-、Des-FA-[Ser1]-、Des-FA-[Dab-Dab-Dab1]-和 Des-FA-[Arg-Arg-Arg1]-PMB仅对铜绿假单胞菌具有强效活性，其 MIC 值为 0.5-1 nmol/ml。与先导化合物 Des-FA-[Dab1]-PMB 和多粘菌素 B (PMB) 相比，X 为 Lys、Arg、Leu 或 Ala 的类似物对三种受试细菌的抗菌活性并没有提高。Des-FA-[Trp1]-PMB 和 Des-FA-[Phe1]-PMB 对铜绿假单胞菌的活性降低。结果表明，N-末端的紧密亲水氨基酸（C3）或碱性三肽为铜绿假单胞菌的杀菌活性提供了特异性。在 LPS 结合活性方面，Des-FA-[Dab-Dab-Dab1]-PMB 和 Des-FA-[Arg-Arg-Arg1]-PMB 的活性与 PMB 相当，而 Des-FA-[Ala-Ala-Ala1]-PMB 的活性则非常低。小鼠尾部静脉注射试验表明，Des-FA-[Dap1]-PMB 和 Des-FA-[Trp1]-PMB 的急性毒性较低，半数致死剂量分别为 23.5 和 19.0 μmol/kg，而 PMB 的半数致死剂量为 4.8 μmol/kg。

  DOI：

  10.1248/cpb.57.332