腺苷-2'-13C | 714950-52-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 中文名称: 腺苷-2'-13C
• 中文别名: 腺苷2′-13C
• 英文名称: [2-13C]adenosine
• 英文别名: adenosine-2'-13C；(2R,3R,4S,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-(hydroxymethyl)(313C)oxolane-3,4-diol
• CAS: 714950-52-4
• 化学式: C₁₀H₁₃N₅O₄
• 分子量: 268.233
• InChiKey: OIRDTQYFTABQOQ-NBMYLFBZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.1
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  140
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  L-高半胱氨酸 、 腺苷-2'-13C 在 S-adenosylhomocysteine hydrolase from Bacillus subtilis 作用下， 以 phosphate buffer 为溶剂， 生成 [2-13C]-S-adenosylhomocysteine
  参考文献：
  名称：

  S-核糖高半胱氨酸酶 (LuxS) 的催化机理：通过 13C NMR 光谱法直接观察酮中间体

  摘要：

  S-核糖同型半胱氨酸酶 (LuxS) 催化 S-核糖同型半胱氨酸 (SRH) 的硫醚键断裂，产生 l-同型半胱氨酸和 4,5-二羟基-2,3-戊二酮 (DHPD)。这是革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌中 II 型自诱导剂 (AI-2) 生物合成途径的关键步骤。先前的研究表明，LuxS 含有催化必需的 Fe2+ 离子。使用 2-和 3-13C-标记的 SRH 作为底物和 13C NMR 光谱研究了 LuxS 的催化机制。这些研究揭示了催化途径中存在 2- 和 3- 酮中间体。化学合成了 2-酮中间体，并证明了其化学和动力学能力。结果支持金属离子催化内部氧化还原反应的催化机制，将羰基从 C-1 位置移动到 C-3 位置。随后在 C-4 和 C-5 位置进行 β-消除将高半胱氨酸作为游离硫醇释放。结果还表明，Cys-84 和 Glu-57 是催化过程中质子转移的可能的通用酸/碱，并且酮中间体在重新结合和反应完成之前从酶活性位点释放。

  DOI：

  10.1021/ja0369663
• 作为产物：
  描述：

  N6-苯甲酰基腺嘌呤 在 吡啶 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 氨 、 六甲基二硅氮烷 作用下， 反应 33.0h， 生成 腺苷-2'-13C
  参考文献：
  名称：

  13C-Enriched ribonucleosides：合成和应用 13C-1H 和 13C-13C 自旋耦合常数来评估呋喃糖和 N-糖苷键构象

  摘要：

  腺苷 (1)、胞苷 (2)、鸟苷 (3) 和尿苷 (4) 已通过化学方法制备，在核糖环的 C1{prime} 和 C2{prime} 处 {sup 13}C 富集（99 原子%） . 已开发出可靠的合成方案，以允许获得稳定同位素标记寡核苷酸的结构研究和体内代谢研究所需的毫摩尔数量的标记核糖核苷。获得了富集核糖核苷的高分辨率{sup 1}H和{sup 13}C NMR谱，{sup 13}C-{sup 13}C和{sup 13}C-{sup 1}H自旋-已经测量了{β}-D-呋喃核糖环内和穿过N-糖苷键的途径的偶联常数。在甲基 {α}- 和 {β}-D-核硼苷 (5,6) 以及两种构象受限的核苷 2 中确定了相关偶联，2{prime}-anhydro-(1-{beta}-D-arabinofuranosyl)uracil (7) 和 2{prime},3{prime}-O-isopropylidene-2

  DOI：

  10.1021/ja00176a043