Nα-Fmoc-Ne-(thymin-1-ylacetyl)-L-2,6-hexanoic acid | 1456970-69-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: Nα-Fmoc-Ne-(thymin-1-ylacetyl)-L-2,6-hexanoic acid
• CAS: 1456970-69-6
• 化学式: C₂₈H₃₀N₄O₇
• 分子量: 534.569
• InChiKey: RPOPLEKLVPXZCX-QHCPKHFHSA-N

物化性质

• 密度：
  1.319±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.12
• 重原子数：
  39.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  159.59
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Nα-Fmoc-Ne-(thymin-1-ylacetyl)-L-2,6-hexanoic acid 、 Fmoc-Pbf-L-精氨酸 在 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 哌啶 作用下， 以 N-甲基吡咯烷酮 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.58h， 以55%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  含精氨酸的核苷酸肽的固相合成和RNA结合活性。

  摘要：

  在这里，我们报告的固相合成和表征（LC-ESIMS，CD）的阳离子核碱基的α肽，由L-精氨酸残基和L-赖氨酸为基础的核苷酸顺序出现在结构中组成。通过CD光谱法研究了这种新型基本核苷酸肽对核酸的结合特性，揭示了含胸腺嘧啶的低聚物结合含腺嘌呤的DNA（dA 12）和RNA（poly rA）分子的能力，从而在核酸中诱导高构象变异。核酸结构。此外，人工寡核苷酸抑制了HIV逆转录酶的酶活性，从而为利用受该分子工具启发的新型抗病毒策略打开了大门。

  DOI：

  10.1039/c5ra25809j
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-Lys-OH*TFA 、 胸腺嘧啶-1-乙酸 在 2,4,6-三甲基吡啶 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 N-甲基吡咯烷酮 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.5h， 生成 Nα-Fmoc-Ne-(thymin-1-ylacetyl)-L-2,6-hexanoic acid
  参考文献：
  名称：

  包含所有四个核碱基的核肽的合成方法，以及混合序列核寡聚赖氨酸的核酸结合研究。

  摘要：

  在本文中，我们描述了两种固相合成路线，以获得包含所有四个天然核碱基的核寡聚赖氨酸α-肽。第一个是基于含核碱基的单体的低聚，如本文所述易于合成。第二种策略的优点是避免了单体结构单元的溶液合成，通过将适当保护的核碱基与仍锚定在树脂上的生长的肽链上的游离氨基直接固相偶联而产生最终的核肽。两种策略都是通用的，并且可用于合成具有主链的核苷酸肽，所述主链由装饰有四个核碱基的任何其他二氨基酸部分形成。我们还报告了CD和UV研究获得的核苷酸肽的杂交特性，包含序列中交替赖氨酸上朝向互补的DNA和RNA链的所有四个核碱基。具有混合碱基序列的核寡聚赖氨酸不能证明与互补DNA结合，但是能够识别互补RNA，形成的复合物的融解温度要高于相应的RNA / RNA天然双链体的融解温度，并且与可比的RNA / RNA天然双链体具有可比性。类似的PNA / RNA系统。

  DOI：

  10.1039/c6ra08765e

文献信息

• Synthesis of a thymine-functionalized nucleoamino acid for the solid phase assembly of cationic nucleopeptides
  作者：Giovanni N. Roviello、Domenica Musumeci、Cristian D’Alessandro、Carlo Pedone

  DOI：10.1007/s00726-013-1520-2

  日期：2013.10

  the oligomer was purified by HPLC and characterized by LC-ESIMS (positive ions) which confirmed the identity of the thymine-based nucleopeptide. The cationic nucleobase-containing peptide, well soluble in water, was studied by CD spectroscopy which allowed us to exclude any helical pre-organization of the nucleopeptide in the experimental conditions used. Furthermore, CD behavior of the oligomer at

  在这项工作中，我们报告了适用于核苷酸多肽固相合成的胸腺嘧啶功能化核苷酸的合成。该单体是从市售化合物开始在溶液中获得的，经过NMR（1 H和13 C）和ESIMS（正离子）表征后，将其用于组装阳离子核苷酸肽，方法是依次引入未衍生的I-赖氨酸单元和核氨基酸单体。从树脂上分离后，在酸性条件下进行，通过HPLC纯化该低聚物，并通过LC-ESIMS（正离子）对其进行表征，该LC-ESIMS证实了基于胸腺嘧啶核苷的身份。通过CD光谱研究了水溶性良好的含阳离子核碱基的肽，这使我们能够在所使用的实验条件下排除核苷酸的任何螺旋形预组织。此外，如本文所述，还研究了低聚物在不同温度下的CD行为。