| 1418275-25-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 二苯乙烯类
• CAS: 1418275-25-8
• 化学式: C₂H₃O₂*C₃₅H₄₃N₄O₂Si
• 分子量: 638.882
• InChiKey: QIZFTPOCHXJPNP-UHFFFAOYSA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.1
• 重原子数：
  46.0
• 可旋转键数：
  4.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  89.56
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  在 盐酸 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 2-(7-(dimethylamino)-3-(dimethyliminio)-5,5-dimethyl-3,5-dihydrodibenzo[b,e]silin-10-yl)-4-(((2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)carbonyl)benzoate
  参考文献：
  名称：

  用于免疫受体-适配器分子动力学多色单分子成像的细胞内蛋白质标记探针

  摘要：

  单分子成像 (SMI) 已被广泛用于研究活细胞中的生物分子动力学和蛋白质 - 蛋白质相互作用。然而，由于高背景信号和当前荧光标记方法的其他限制，细胞内蛋白质的多色 SMI 具有挑战性。为了实现可重复的细胞内 SMI，确保有效的膜通透性和与细胞成分的非特异性结合最小的标记探针是必不可少的。我们开发了用于蛋白质标记的近红外荧光探针，该探针与突变的 β-内酰胺酶标签特异性结合。通过细胞通透性的结构微调和最小化非特异性结合，SiRcB4 与基于 HaloTag 的红色荧光探针结合实现了多色 SMI。在加入亚纳摩尔浓度的两种化学探针后，单分子成像揭示了 TLR4 及其衔接蛋白 TIRAP 的动态，它们参与了先天免疫系统。对动力学中的定量特性和时间推移变化的统计分析揭示了响应配体刺激的蛋白质-蛋白质相互作用。

  DOI：

  10.1021/jacs.7b08262
• 作为产物：
  描述：

  2-bromo-N¹,N⁴-bis(1-hydroxy-2-methylpropan-2-yl)terephthalamide 在 氯化亚砜 、 叔丁基锂 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 14.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  用于免疫受体-适配器分子动力学多色单分子成像的细胞内蛋白质标记探针

  摘要：

  单分子成像 (SMI) 已被广泛用于研究活细胞中的生物分子动力学和蛋白质 - 蛋白质相互作用。然而，由于高背景信号和当前荧光标记方法的其他限制，细胞内蛋白质的多色 SMI 具有挑战性。为了实现可重复的细胞内 SMI，确保有效的膜通透性和与细胞成分的非特异性结合最小的标记探针是必不可少的。我们开发了用于蛋白质标记的近红外荧光探针，该探针与突变的 β-内酰胺酶标签特异性结合。通过细胞通透性的结构微调和最小化非特异性结合，SiRcB4 与基于 HaloTag 的红色荧光探针结合实现了多色 SMI。在加入亚纳摩尔浓度的两种化学探针后，单分子成像揭示了 TLR4 及其衔接蛋白 TIRAP 的动态，它们参与了先天免疫系统。对动力学中的定量特性和时间推移变化的统计分析揭示了响应配体刺激的蛋白质-蛋白质相互作用。

  DOI：

  10.1021/jacs.7b08262

文献信息

• [EN] CELL PERMEABLE, FLUORESCENT DYE<br/>[FR] COLORANT FLUORESCENT CAPABLE DE PÉNÉTRER DANS LES CELLULES
  申请人：ECOLE POLYTECH

  公开号：WO2013029650A1

  公开（公告）日：2013-03-07

  The invention pertains to a near-infrared fluorescent dye that is cell permeable and can be attached to selected proteins in living cells. The dye has the general formula (I) or its or its corresponding spirolactone (II) wherein Y is chosen from the group consisting of Si, Ge and Sn; R0 is -COO- or COOH; R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R9, R10, R11, R12, R13, R14, R15 and R16 are substituents, including hydrogen, independently from each other. The dye (i) absorbs and emits light at wavelengths above 600 nm; (ii) possesses high photostability; (iii) has high extinction coefficients and high quantum yields; (iv) can be derivatized with different molecules; and (v) is membrane-permeable and shows mini¬ mal background binding to biomolecules and biomolecular structures.

  该发明涉及一种近红外荧光染料，可以穿透细胞并附着于活细胞中的特定蛋白质。该染料具有一般式(I)或其相应的螺内酯(II)，其中Y选择自Si、Ge和Sn组成的群；R0为-COO-或COOH；R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15和R16为取代基，包括独立于彼此的氢。该染料(i)在600纳米以上的波长吸收和发射光；(ii)具有高光稳定性；(iii)具有高消光系数和高量子产率；(iv)可以与不同分子衍生化；(v)具有膜通透性，并显示对生物分子和生物分子结构的最小背景结合。
• Cell Permeable, Fluorescent Dye
  申请人：Ecole Polytechnique Federale de Lausanne (EPFL)

  公开号：US20140349282A1

  公开（公告）日：2014-11-27

  The invention pertains to a near-infrared fluorescent dye that is cell permeable and can be attached to selected proteins in living cells. The dye has the general formula or its corresponding spirolactone wherein Y is chosen from the group consisting of Si, Ge and Sn; R 0 is —COO − or COOH; R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 , R 6 , R 7 , R 8 , R 9 , R 10 , R 11 , R 12 , R 13 , R 14 , R 15 and R 16 are substituents, including hydrogen, independently from each other. The dye (i) absorbs and emits light at wavelengths above 600 nm; (ii) possesses high photostability; (iii) has high extinction coefficients and high quantum yields; (iv) can be derivatized with different molecules; and (v) is membrane-permeable and shows minimal background binding to biomolecules and biomolecular structures.

  该发明涉及一种近红外荧光染料，该染料可穿透细胞，并可连接到活细胞中的特定蛋白质。 该染料具有一般化学式，或其相应的螺内酯化合物，其中Y选择自Si、Ge和Sn组成的组; R0为—COO−或COOH; R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15和R16为取代基，包括氢，彼此独立。 该染料(i)在600纳米以上吸收和发射光线; (ii)具有高光稳定性; (iii)具有高消光系数和高量子产率; (iv)可与不同分子衍生化; (v)具有膜渗透性，并对生物分子和生物分子结构显示最小的背景结合。