<1',2',3',4',5'-13C5>-2',3',5'-tri-O-(4-toluoyl)-N4-benzoylcytidine | 238096-58-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: <1',2',3',4',5'-13C5>-2',3',5'-tri-O-(4-toluoyl)-N4-benzoylcytidine
• 英文别名: <1',2',3',4',5'-13C5>-2',3',5'-tri-O-(4-toluoyl)-N⁴-benzoylcytidine
• CAS: 238096-58-7
• 化学式: C₄₀H₃₅N₃O₉
• 分子量: 706.678
• InChiKey: ZVCXVFVWEXSNKJ-AXHJFFELSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.63
• 重原子数：
  52.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  152.12
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  <1',2',3',4',5'-13C5>-2',3',5'-tri-O-(4-toluoyl)-N4-benzoylcytidine 在 吡啶 、 sodium hydroxide 、 silver nitrate 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 乙醇 为溶剂， 反应 0.1h， 生成 (13C5-ribo)-N4-benzoyl-5'-O-dimethoxytrityl-2'-O-(t-butyl-dimethyl-silyl)-cytidine
  参考文献：
  名称：

  序列特异性非均匀13 C 5标记RNA的第一个例子：具有13 C弛豫窗的29mer HIV-1 TAR RNA的合成

  摘要：

  完整的合成方案以及有关单体结构单元的1 H和13 C-NMR数据，这些单体用于固相合成13 C标记（99％原子的13 C）茎（27 A和43 G），凸起（24 C）和环（31 29聚体HIV-1 RNA TAR发夹U）区域从起始13 ç 6 - -葡萄糖被呈现。的复杂的NMR谱13 C标记的单体结构单元，由于各种的相互作用13 C和1已指定H个旋转。异核2D NMR已证明，通过化学合成在此处实现的HIV-1 TAR 29mer RNA的非均一标记提供了最佳的机会，可以进行完整的T 1和T 2弛豫测量（“ NMR弛豫窗口”）与统一标记的寡核苷酸RNA相比，由于13 C共振的最小重叠，所有四种策略性地将13 C标记的残基的糖碳的每种类型均以独特且前所未有的方式进行。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(99)00294-x
• 作为产物：
  描述：

  N4-苯甲酰基胞嘧啶 、 <1,2,3,4,5-13C5>-1-O-acetyl-2,3,5-tri-O-(4-toluoyl)-α/β-D-ribofuranoside 在 三甲基氯硅烷 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 六甲基二硅氮烷 作用下， 生成 <1',2',3',4',5'-13C5>-2',3',5'-tri-O-(4-toluoyl)-N4-benzoylcytidine
  参考文献：
  名称：

  序列特异性非均匀13 C 5标记RNA的第一个例子：具有13 C弛豫窗的29mer HIV-1 TAR RNA的合成

  摘要：

  完整的合成方案以及有关单体结构单元的1 H和13 C-NMR数据，这些单体用于固相合成13 C标记（99％原子的13 C）茎（27 A和43 G），凸起（24 C）和环（31 29聚体HIV-1 RNA TAR发夹U）区域从起始13 ç 6 - -葡萄糖被呈现。的复杂的NMR谱13 C标记的单体结构单元，由于各种的相互作用13 C和1已指定H个旋转。异核2D NMR已证明，通过化学合成在此处实现的HIV-1 TAR 29mer RNA的非均一标记提供了最佳的机会，可以进行完整的T 1和T 2弛豫测量（“ NMR弛豫窗口”）与统一标记的寡核苷酸RNA相比，由于13 C共振的最小重叠，所有四种策略性地将13 C标记的残基的糖碳的每种类型均以独特且前所未有的方式进行。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(99)00294-x