摘要:
作为蛋白质调节剂的硫酸化小非糖分子的设计仍处于起步阶段,因为标准药物发现工具(例如各种硫酸化分子库和计算机对接和评分协议)尚未牢固建立。数据库,例如 ZINC,包含太少的含硫酸盐非糖分子,这严重限制了新命中的识别。缺乏普遍适用的支架跳跃协议限制了硫酸化小分子作为高度硫酸化糖胺聚糖的合成模拟物的发展。我们探索了基于序列配体 (LBVS) 和基于结构的虚拟筛选 (SBVS) 方法,从我们最初发现单硫酸化苯并呋喃开始,发现替代支架作为凝血酶的变构调节剂,凝血酶是一种关键的凝血酶。使用从母体硫酸化苯并呋喃开发的药效团筛选包含近 100 万个非硫酸化小分子的 ZINC 数据库,然后基于遗传算法的双过滤器对接和评分筛选确定了一组 10 个有希望的命中,其中三个得分最高的命中是合成的。发现每一种都选择性地抑制人 α-凝血酶,这表明这种方法用于支架跳跃的可能性。Michaelis-Menten 动力学表明