5′-(3-aminopropyl)thio-5′-deoxy-2′,3′-O-(1-methylethylidene)adenosine | 53186-61-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: 5′-(3-aminopropyl)thio-5′-deoxy-2′,3′-O-(1-methylethylidene)adenosine
• 英文别名: 2'.3'-O,O-Isopropyliden-5'-desoxy-5'-<3-amino-propylmercapto>-adenosin；S-(3-amino-propyl)-O^2'_,O3'-isopropylidene-5'-thio-adenosine；9-((3aR,4R,6S,6aS)-6-(((3-aminopropyl)thio)methyl)-2,2-dimethyItetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)-9H-purin-6-amine；9-((3aR,4R,6S,6aS)-6-(((3-aminopropyl)thio)methyl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)-9H-purin-6-amine；9-[(3aR,4R,6S,6aS)-6-(3-aminopropylsulfanylmethyl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]purin-6-amine
• CAS: 53186-61-1
• 化学式: C₁₆H₂₄N₆O₃S
• 分子量: 380.471
• InChiKey: BBDRGKQECWZRRA-SDBHATRESA-N

物化性质

• 沸点：
  617.1±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.63±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.1
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  149
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5′-(3-aminopropyl)thio-5′-deoxy-2′,3′-O-(1-methylethylidene)adenosine 在 硫酸 作用下， 反应 36.0h， 以93%的产率得到3-(S-adenosylthio)-1-propylamine sulfate
  参考文献：
  名称：

  手性氘化（S-腺苷-S-甲基磺基）丙胺和亚精胺的合成。阐明腐胺氨基丙基转移酶（亚精胺合酶）的立体化学过程

  摘要：

  已经研究了酶催化氨基丙基转移的立体化学过程。手性氘化 (S-腺苷-S-甲基磺基) 丙胺和几种手性氘化亚精胺 (-)-樟脑酰胺衍生物的立体特异性合成允许使用 /sup 1/H NMR 技术阐明氨基丙基转移酶立体化学。从大肠杆菌中分离的腐胺氨基丙基转移酶（亚精胺合酶）催化从 1,4-二氨基丁烷（腐胺）和手性氘化（S-腺苷-S-甲基磺基）丙胺合成手性氘化亚精胺。生物合成亚精胺的衍生化为 1，8-双 (Boc) 亚精胺 (-)-camphanamides 和它们的 sup 1/H NMR 光谱与合成标准的比较允许确定生物合成产品的绝对构型。结果表明，由大肠杆菌亚精胺合酶催化的反应在亚甲基碳处发生构型反转，并受到腐胺的亲核攻击。这些数据支持通过酶和两种底物的三元复合物进行的单置换机制。42 个参考文献，5 个数字。

  DOI：

  10.1021/ja00225a034
• 作为产物：
  描述：

  5'-acetylthio-5'-deoxy-2',3'-O-isopropylideneadenosine 在 sodium methylate 、 肼 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成 5′-(3-aminopropyl)thio-5′-deoxy-2′,3′-O-(1-methylethylidene)adenosine
  参考文献：
  名称：

  蛋白质精氨酸甲基转移酶家族的泛抑制剂

  摘要：

  蛋白质精氨酸甲基转移酶 (PRMT) 在转录、剪接、DNA 损伤修复、RNA 生物学和细胞代谢中发挥着重要作用。因此，PRMT 已成为多种疾病的有吸引力的靶点。在这项研究中，我们报道了一种有效的 PRMT 泛抑制剂的设计和合成，该抑制剂通过丙基连接体连接硫腺苷和各种取代的胍基。对于八个测试的 PRMT，化合物 II757 表现出 5 至 555 nM 的半最大抑制浓度 (IC 50 ) 值，其中对 PRMT4 的抑制最高 (IC 50 = 5 nM)。动力学研究表明 II757 竞争性结合 PRMT1 的 SAM 结合位点。值得注意的是，II757 对 PRMT 的选择性优于一组其他甲基转移酶，它可以作为 PRMT 的通用探针，并为进一步优化以提高单个 PRMT 的选择性提供线索。

  DOI：

  10.3390/biom11060854

文献信息

• Structure-Based Drug Design of Bisubstrate Inhibitors of Phenylethanolamine <i>N</i>-Methyltransferase Possessing Low Nanomolar Affinity at Both Substrate Binding Domains¹
  作者：Jian Lu、Aaron G. Bart、Qian Wu、Kevin R. Criscione、Michael J. McLeish、Emily E. Scott、Gary L. Grunewald

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.0c01475

  日期：2020.11.25

  pharmacology. A bisubstrate analogue approach offers the potential for development of highly selective inhibitors of PNMT. This paper documents the design, synthesis, and evaluation of such analogues, several of which were found to possess human PNMT (hPNMT) inhibitory potency <5 nM versus AdoMet. Site-directed mutagenesis studies were consistent with bisubstrate binding. Two of these compounds (19

  苯乙醇胺N-甲基转移酶 (PNMT, EC 2.1.1.28) 催化肾上腺素生物合成的最后一步，是一种潜在的药物靶点，主要用于控制高血压。不幸的是，许多有效的 PNMT 抑制剂也对2 -肾上腺素受体具有显着的亲和力，这使对其药理学的解释复杂化。双底物类似物方法为开发高选择性 PNMT 抑制剂提供了潜力。本文记录了此类类似物的设计、合成和评估，其中一些被发现具有与 AdoMet 相比 <5 nM 的人类 PNMT (hPNMT) 抑制效力。定点诱变研究与双底物结合一致。其中两种化合物（19和29 ) 与 hPNMT 共结晶，所得结构显示两种化合物如预测的那样结合，同时占据两个底物结合结构域。这种双底物抑制剂方法已经产生了迄今为止报道的最有效（20）和选择性（相对于α 2-肾上腺素受体）的 hPNMT 抑制剂之一。
• Modulators of Histone Methyltransferase, and Methods of Use Thereof
  申请人：Epizyme, Inc.

  公开号：US20160068559A1

  公开（公告）日：2016-03-10

  Disclosed are compounds, pharmaceutical compositions containing the compounds, and the uses of the compounds and compositions as modulators of histone methyltransferases, and for treating diseases influenced by modulation of histone methyltransferase activity.

  本发明涉及一种化合物、含有该化合物的药物组合物，以及将该化合物和组合物用作组蛋白甲基转移酶调节剂，以及治疗受组蛋白甲基转移酶活性调节影响的疾病的用途。
• [EN] MODULATORS OF HISTONE METHYLTRANSFERASE, AND METHODS OF USE THEREOF<br/>[FR] MODULATEURS D'HISTONE MÉTHYLTRANSFÉRASE ET LEURS PROCÉDÉS D'UTILISATION
  申请人：EPIZYME INC

  公开号：WO2012082436A3

  公开（公告）日：2012-09-20
• MODULATORS OF HISTONE METHYLTRANSFERASE, AND METHODS OF USE THEREOF
  申请人：Epizyme, Inc.

  公开号：EP2646455A2

  公开（公告）日：2013-10-09
• US9029343B2
  申请人：——

  公开号：US9029343B2

  公开（公告）日：2015-05-12