5'-O-MMTr-3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxy-2'-dehydro-(E)-(N-methyloximino)-5-methyluridine | 156386-22-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-MMTr-3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxy-2'-dehydro-(E)-(N-methyloximino)-5-methyluridine
• CAS: 156386-22-0
• 化学式: C₃₇H₄₅N₃O₇Si
• 分子量: 671.866
• InChiKey: CDKCSCVBBUOYND-KYLXMECVSA-N

物化性质

• 密度：
  1.22±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.73
• 重原子数：
  48.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  117.85
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-MMTr-3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxy-2'-dehydro-(E)-(N-methyloximino)-5-methyluridine 在 氟化铵 、 potassium fluoride 、 双氧水 、 potassium hydrogencarbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 甲醇 、 水 、 溶剂黄146 为溶剂， 生成 2'-deoxy-2'-dehydro-spiro<2'(S),11-(7(S)-hydroxy-10-N-(R)-methyl-9,10-isoxazolidine)>thymidine
  参考文献：
  名称：

  2'-和3'-超修饰的三环核苷的合成和构象及其在合成新型2'-或3'-异构体4（7）-取代的异恶唑烷-核苷中的用途

  摘要：

  分子内的一些的1,3-偶极cycloadditon反应核苷衍生物的链烯基硝酮7，9，19和28，得到2'-和3'- hypermodified三环核苷衍生物10（56％），11（43％），20 （91％）和29（75％）。这些三环核苷衍生物的溶液结构已通过MacroModel的AMBER力场使用3 J HH（在500 MHz下为1 H）和NMR衍生的扭转角限制了能量的最小化进行了研究。超修饰核苷衍生物的随后Tamao氧化20和29分别给出了螺-4（7）-取代的异恶唑烷-核苷衍生物21和30。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)85027-4
• 作为产物：
  描述：

  1-(5'-O-(monomethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl)thymine 在 吡啶 、 咪唑 、 chromium(VI) oxide 、 乙酸酐 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 51.0h， 生成 5'-O-MMTr-3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxy-2'-dehydro-(E)-(N-methyloximino)-5-methyluridine
  参考文献：
  名称：

  2'-和3'-超修饰的三环核苷的合成和构象及其在合成新型2'-或3'-异构体4（7）-取代的异恶唑烷-核苷中的用途

  摘要：

  分子内的一些的1,3-偶极cycloadditon反应核苷衍生物的链烯基硝酮7，9，19和28，得到2'-和3'- hypermodified三环核苷衍生物10（56％），11（43％），20 （91％）和29（75％）。这些三环核苷衍生物的溶液结构已通过MacroModel的AMBER力场使用3 J HH（在500 MHz下为1 H）和NMR衍生的扭转角限制了能量的最小化进行了研究。超修饰核苷衍生物的随后Tamao氧化20和29分别给出了螺-4（7）-取代的异恶唑烷-核苷衍生物21和30。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)85027-4