2'-deoxy-2'-difluoromethylene-3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)uridine | 170112-34-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 2'-deoxy-2'-difluoromethylene-3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)uridine
• 英文别名: 1-[(6aR,8R,9aS)-9-(difluoromethylidene)-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,9a-dihydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 170112-34-2
• 化学式: C₂₂H₃₆F₂N₂O₆Si₂
• 分子量: 518.705
• InChiKey: PXFZAUXIUKHXND-OZOXKJRCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.54
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  86.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-deoxy-2'-difluoromethylene-3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)uridine 在 吡啶 、 氟化铵 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 22.92h， 生成 2'-deoxy-2'-difluoromethylene-5'-dimethoxytrityluridine
  参考文献：
  名称：

  制备2'-和3'-二氟亚甲基尿苷的3'-和2'-亚磷酰胺的新方法

  摘要：

  尿苷2a，2b，7a和7b的2'-和3'-酮衍生物与溴代二氟甲基[三（二甲基氨基）] phosph溴化物（13）和锌的一步反应，得到相应的2'-和3'-二氟亚甲基核苷图3a，3b，8a和8b具有良好的产率。除去甲硅烷基基团得到二氟亚甲基化的尿苷4a，4b，9a和9b。4a和9a的磷酸化提供了用于寡核苷酸合成的目标2'-和3'-亚磷酰胺5和10。

  DOI：

  10.1016/0040-4020(96)00364-x
• 作为产物：
  描述：

  3',5'-O-(1,1,3,3-四异丙基-1,3-二硅氧烷)尿苷 在 戴斯-马丁氧化剂 、 锌 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 18.42h， 生成 2'-deoxy-2'-difluoromethylene-3',5'-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)uridine
  参考文献：
  名称：

  制备2'-和3'-二氟亚甲基尿苷的3'-和2'-亚磷酰胺的新方法

  摘要：

  尿苷2a，2b，7a和7b的2'-和3'-酮衍生物与溴代二氟甲基[三（二甲基氨基）] phosph溴化物（13）和锌的一步反应，得到相应的2'-和3'-二氟亚甲基核苷图3a，3b，8a和8b具有良好的产率。除去甲硅烷基基团得到二氟亚甲基化的尿苷4a，4b，9a和9b。4a和9a的磷酸化提供了用于寡核苷酸合成的目标2'-和3'-亚磷酰胺5和10。

  DOI：

  10.1016/0040-4020(96)00364-x

文献信息

• Synthesis of 3′-Deoxy-3′-difluoromethyluridine and 2′-Deoxy-2′-difluoromethyluridine
  作者：Stéphane Marcotte、Baudoin Gérard、Xavier Pannecoucke、Christian Feasson、Jean-Charles Quirion

  DOI：10.1055/s-2001-13419

  日期：——

  The synthesis of 3’-deoxy-3’-difluoromethyluridine (9) and 2’-deoxy-2’-difluoromethyluridine (7β) by hydrogenation of the corresponding difluoromethylene derivatives is described. A second synthesis of the latter has been performed. Starting from thymidine, a two-step procedure affords the benzylated furanoid glycal 12. Addition of dibromodifluoromethane gives the α-2’-deoxy-2’-bromodifluoromethylarabinose (13). This compound allowed an access to α- or β -2’-deoxy-2’-difluoromethyluridine via a SN2 type reaction on a α-halodeoxyarabinose species.

  介绍了通过氢化相应的二氟亚甲基衍生物合成 3'-deoxy-3'-difluoromethyluridine (9) 和 2'-deoxy-2'-difluoromethyluridine (7δ²)。对后者进行了第二次合成。从胸腺嘧啶开始，通过两步程序得到了苄基呋喃糖醛 12。加入二溴二氟甲烷可得到δ-2'-脱氧-2'-溴二氟甲基阿拉伯糖（13）。这种化合物可以通过 δ-卤代脱氧阿拉伯糖的 SN2 型反应获得 δ- 或 δ² -2'-脱氧-2'-二氟甲基尿苷。
• NEW METHOD FOR THE PREPARATION OF 3′- AND 2′-<i>O</i>-PHOSPHORAMIDITES OF 2′- AND 3′-DIFLUOROMETHYLURIDINE DERIVATIVES
  作者：Pawel J. Serafinowski、Catherine A. Brown

  DOI：10.1081/ncn-120006526

  日期：2002.4.15

  methylene-5'-O-dimethoxytrityluridine (7), gave the corresponding 2'- and 3'-difluoromethyluridine derivatives 2a and 8a. Detritylation of compounds 2a, 2b and 8a, 8b resulted in the formation of 1-(2-deoxy-2-C-difluoromethyl-beta-D-arabino-pentofuranosyl)uracil (3a) and 1-(3-deoxy-3-C-difluoromethyl-beta-D-xylo-pento furanosyl)- uracil (9a) as well as corresponding minor isomers 3b and 9b. Compounds

  2'-脱氧-2'-二氟亚甲基-5'-O-二甲氧基三苯甲基吡啶（1）和3'-脱氧-3'-二氟亚甲基-5'-O-二甲氧基三苯甲基吡啶（7）的氢化得到相应的2'-和3 '-二氟甲基尿苷衍生物2a和8a。化合物2a，2b和8a，8b的去三苯甲基化导致形成1-（2-deoxy-2-C-difluoromethyl-beta-D-arabino-pentofuranosyl）尿嘧啶（3a）和1-（3-deoxy-3- C-二氟甲基-β-D-二甲苯基呋喃糖基）-尿嘧啶（9a）以及相应的次要异构体3b和9b。化合物3a和3b也由2′-脱氧-2′-二氟亚甲基-3′，5′-O-（四异丙基二硅氧烷-1，3-二基）尿苷（4）获得。最后，2a和8a的磷酸化提供了标题2'-和3'-O-磷酰胺6和10。
• Synthesis and NMR Spectra of Some New Carbohydrate Modified Uridine Phosphoramidites
  作者：Pawel J. Serafinowski、Colin L. Barnes

  DOI：10.1080/07328319708006222

  日期：1997.7

  The one step reaction of 2'- and 3'-keto derivatives of uridine with bromodifluoromethyl[tris(dimethylamino)]phosphonium bromide and zinc gives the corresponding 2'- and 3'-difluoromethylene nucleosides in good yield. Desilylation and phosphitylation of the resultant 2'- or 3'-hydroxyls provides the target 2'- and 3'-phosphoramidites 7 and 8 for use in oligonucleotide synthesis(1).