2'-O-(2-azidoethoxymethyl)-N(4)-benzoylcytidine | 1309370-94-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2'-O-(2-azidoethoxymethyl)-N(4)-benzoylcytidine
• CAS: 1309370-94-2
• 化学式: C₁₉H₂₂N₆O₇
• 分子量: 446.42
• InChiKey: AIZHPHVFKSXQDG-GFOCRRMGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.42
• 重原子数：
  32.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  180.9
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-O-(2-azidoethoxymethyl)-N(4)-benzoylcytidine 在 吡啶 、 水 作用下， 反应 17.0h， 生成 2'-O-(2-azidoethoxymethyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N(4)-benzoylcytidine 3'-(H-phosphonate) triethylammonium salt
  参考文献：
  名称：

  固相支持的叠氮和点击反应寡核苷酸的2'- O-糖共轭。

  摘要：

  2'- ø - [（2-溴乙氧基）甲基]胞苷和2'- ö - [（2-叠氮基乙氧基）甲基]胞苷已经制备和引入适当保护的3'-亚磷酰胺（1）和3' - （ħ（-膦酸酯）（2）构件分别形成2'- O-甲基寡核糖核苷酸。使结合了载体的寡核苷酸与炔基官能化的单糖连续两次结合。该第一糖通过用铜（I）促进的点击反应引入2和第二由2-溴乙氧基基团的叠氮化1接着点击反应。2'-糖缀合物对与DNA和2'-杂交的影响研究了O-甲基RNA靶。15-mer寡核苷酸中的两个糖单元对双链体稳定性几乎没有影响，而引入第三个糖单元则适度降低了解链温度。

  DOI：

  10.1021/bc200097g
• 作为产物：
  描述：

  1-{2-O-[(2-azidoethoxy)methyl]-3,5-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-β-D-ribofuranosyl}-N4-benzoylcytosine 在 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 0.33h， 以94%的产率得到2'-O-(2-azidoethoxymethyl)-N(4)-benzoylcytidine
  参考文献：
  名称：

  固相支持的叠氮和点击反应寡核苷酸的2'- O-糖共轭。

  摘要：

  2'- ø - [（2-溴乙氧基）甲基]胞苷和2'- ö - [（2-叠氮基乙氧基）甲基]胞苷已经制备和引入适当保护的3'-亚磷酰胺（1）和3' - （ħ（-膦酸酯）（2）构件分别形成2'- O-甲基寡核糖核苷酸。使结合了载体的寡核苷酸与炔基官能化的单糖连续两次结合。该第一糖通过用铜（I）促进的点击反应引入2和第二由2-溴乙氧基基团的叠氮化1接着点击反应。2'-糖缀合物对与DNA和2'-杂交的影响研究了O-甲基RNA靶。15-mer寡核苷酸中的两个糖单元对双链体稳定性几乎没有影响，而引入第三个糖单元则适度降低了解链温度。

  DOI：

  10.1021/bc200097g