dBET6 | 1950634-92-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 异吲哚及其衍生物
• 英文名称: dBET6
• 英文别名: 2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.02,6]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]-N-[8-[[2-[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]oxyacetyl]amino]octyl]acetamide
• CAS: 1950634-92-0
• 化学式: C₄₂H₄₅ClN₈O₇S
• 分子量: 841.388
• InChiKey: JGQPZPLJOBHHBK-UFXYQILXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5
• 重原子数：
  59
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  222
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  11

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (S)-(+)-2-(4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩并[3,2-F][1,2,4]三唑并[4,3-A][1,4]二氮杂卓-6-基)乙酸叔丁酯 在 甲酸 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 97.0h， 生成 dBET6
  参考文献：
  名称：

  METHODS TO INDUCE TARGETED PROTEIN DEGRADATION THROUGH BIFUNCTIONAL MOLECULES

  摘要：

  本申请提供了作为蛋白质降解诱导基团的双功能化合物。本申请还涉及通过使用将结合脑白质蛋白的基团与能够结合到靶向蛋白的配体相连的双功能化合物来实现内源蛋白的靶向降解的方法，该方法可用于治疗增殖性疾病。本申请还提供了制备本申请化合物及其中间体的方法。

  公开号：

  US20160176916A1

文献信息

• [EN] REGULATING CHIMERIC ANTIGEN RECEPTORS<br/>[FR] RÉGULATION DE RÉCEPTEURS D'ANTIGÈNES CHIMÉRIQUES
  申请人：DANA FARBER CANCER INST INC

  公开号：WO2018148440A1

  公开（公告）日：2018-08-16

  This invention is in the area of compositions and methods for regulating chimeric antigen receptor immune effector cell, for example T-cell (CAR-T), therapy to modulate associated adverse inflammatory responses, for example, cytokine release syndrome and tumor lysis syndrome, using targeted protein degradation.

  这项发明涉及用于调节嵌合抗原受体免疫效应细胞（例如T细胞（CAR-T））治疗以调节相关的不良炎症反应的组合物和方法，例如细胞因子释放综合征和肿瘤溶解综合征，通过靶向蛋白质降解。
• [EN] TUNABLE ENDOGENOUS PROTEIN DEGRADATION WITH HETEROBIFUNCTIONAL COMPOUNDS<br/>[FR] DÉGRADATION MODULABLE DE PROTÉINE ENDOGÈNE AVEC DES COMPOSÉS HÉTÉROBIFONCTIONNELS
  申请人：DANA FARBER CANCER INST INC

  公开号：WO2018148443A1

  公开（公告）日：2018-08-16

  The present invention provides a means to modulate gene expression in vivo in a manner that avoids problems associated with CRISPR endogenous protein knock-out or knock-in strategies and strategies that provide for correction, or alteration, of single nucleotides. The invention includes inserting into the genome a nucleotide encoding a heterobifunctional compound targeting protein (dTAG) in-frame with the nucleotide sequence of a gene encoding an endogenously expressed protein of interest which, upon expression, produces an endogenous protein-dTAG hybrid protein. This allows for targeted protein degradation of the dTAG and the fused endogenous protein using a heterobifunctional compound.

  本发明提供了一种在体内调节基因表达的方法，避免了与CRISPR内源蛋白敲除或敲入策略以及提供单个核苷酸修正或改变的策略相关的问题。该发明包括将编码靶向蛋白（dTAG）的异双功能化合物的核苷酸插入基因组中，与编码感兴趣的内源表达蛋白的基因的核苷酸序列同框，表达后产生内源蛋白-dTAG杂交蛋白。这允许使用异双功能化合物对dTAG和融合的内源蛋白进行靶向蛋白降解。
• [EN] HETEROBIFUNCTIONAL COMPOUNDS WITH IMPROVED SPECIFICITYFOR THE BROMODOMAIN OF BRD4<br/>[FR] COMPOSÉS HÉTÉROBIFONCTIONNELS PRÉSENTANT UNE SPÉCIFICITÉ AMÉLIORÉE POUR LE BROMODOMAINE DE BRD4
  申请人：DANA FARBER CANCER INST INC

  公开号：WO2019079701A1

  公开（公告）日：2019-04-25

  Disclosed are heterobifunctional compounds that effectuate selective degradation of a target protein, and which include a targeting ligand that binds a target protein and at least one other protein, a ligand that binds an E3 ubiquitin ligase or a component of E3 ubiquitin ligase, and a specificity modulating linker that links the first ligand and the second ligand. Pharmaceutical compositions containing the compounds, and methods of using and making the compounds are also disclosed.

  本文披露了一种异源双功能化合物，可以实现对目标蛋白的选择性降解。该化合物包括一个结合目标蛋白和至少另一种蛋白的靶向配体，一个结合E3泛素连接酶或E3泛素连接酶组分的配体，以及一个调节特异性的连接子，连接第一配体和第二配体。此外，还披露了含有这些化合物的药物组合物，以及使用和制备这些化合物的方法。
• [EN] PROTEIN TAG TO INDUCE LIGAND DEPENDENT DEGRADATION OF PROTEIN/PROTEIN-FUSIONS<br/>[FR] ÉTIQUETTE PROTÉIQUE POUR INDUIRE UNE DÉGRADATION DÉPENDANTE D'UN LIGAND DE FUSIONS PROTÉINE/PROTÉINE
  申请人：DANA FARBER CANCER INST INC

  公开号：WO2021262591A1

  公开（公告）日：2021-12-30

  Disclosed is a dTAG system comprising small molecule degraders of mutant BET family protein-tagged proteins via recruitment of an E3 ubiquitin ligase and uses thereof.

  本文披露了一种dTAG系统，通过招募E3泛素连接酶，利用小分子降解剂对突变的BET家族蛋白标记蛋白进行处理，并其应用。
• Direct-to-Biology Accelerates PROTAC Synthesis and the Evaluation of Linker Effects on Permeability and Degradation
  作者：Charles E. Hendrick、Jeff R. Jorgensen、Charu Chaudhry、Iulia I. Strambeanu、Jean-Francois Brazeau、Jamie Schiffer、Zhicai Shi、Jennifer D. Venable、Scott E. Wolkenberg

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.2c00124

  日期：2022.7.14

  A platform to accelerate optimization of proteolysis targeting chimeras (PROTACs) has been developed using a direct-to-biology (D2B) approach with a focus on linker effects. A large number of linker analogs─with varying length, polarity, and rigidity─were rapidly prepared and characterized in four cell-based assays by streamlining time-consuming steps in synthesis and purification. The expansive dataset

  使用直接生物学（D2B）方法开发了一个加速优化蛋白水解靶向嵌合体（PROTAC）的平台，重点关注链接效应。通过简化耗时的合成和纯化步骤，在四种基于细胞的测定中快速制备并表征了大量具有不同长度、极性和刚性的接头类似物。广泛的数据集提供了有关细胞内 E3 连接酶靶标参与、降解、渗透性和细胞毒性的接头结构-活性关系 (SAR) 的信息。发现了链接器 SAR 的意外方面，与“链接器学”的文献报道一致，并且该方法极大地加速了经验优化。物理化学性质趋势出现，该平台有潜力快速扩展更复杂预测模型的训练集。我们进行了深入的验证研究，并确认 D2B 平台是加速 PROTAC 设计-制造-测试周期的宝贵工具。