cytidylyldiphosphate-6-deoxy-α-D-glucose | 120449-29-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: cytidylyldiphosphate-6-deoxy-α-D-glucose
• CAS: 120449-29-8
• 化学式: C₁₅H₂₅N₃O₁₅P₂
• 分子量: 549.322
• InChiKey: RBSGALFMWNEUMX-JZMIEXBBSA-N

物化性质

• 沸点：
  855.6±75.0 °C(Predicted)
• 密度：
  2.23±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.48
• 重原子数：
  35.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  282.81
• 氢给体数：
  8.0
• 氢受体数：
  16.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  cytidylyldiphosphate-6-deoxy-α-D-glucose 在 CDP-D-tyvelose 2-epimerase 作用下， 以 phosphate buffer 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 cytidylyldiphosphate-6-deoxy-α-D-mannose
  参考文献：
  名称：

  对 CDP-d-Tyvelose 2-差向异构酶机制的新见解：未活化立体中心的酶催化差向异构化

  摘要：

  Tyvelose 是一种 3,6-二脱氧己糖，存在于 Yersinia pseudotuberculosis IVA 的 O-抗原中，并且是此类糖中唯一一种直接由另一种 3,6-双脱氧己糖，paratose 产生的糖。这种转化所需的 C-2 差向异构化已被提议由 CDP-d-泰维糖 2-差向异构酶催化。这种酶很有趣，因为它属于一组差向异构酶，包括经过充分研究的 UDP-d-半乳糖 4-差向异构酶，可以反转未激活的立体中心。为了研究这种酶的作用机制，我们克隆并表达了编码 CDP-d-tyvelose 2-epimerase 的 tyv 基因。纯化的四聚体蛋白含有大约一当量的结合 NAD+ 每个单体和一小部分 NADH。对于这种酶，可以提出四种涉及 NAD+ 的可能机制；两个涉及底物 C-2 处的氧化，而另外两个需要在 C-4 处氧化。在之前的一篇文章中，我们提供了支持由 C-4 发起的复古醇醛型机制的初步数据

  DOI：

  10.1021/ja0022021
• 作为产物：
  描述：

  [5-(4-氨基-2-氧代-1(2H)-嘧啶基)-3,4-二羟基四氢-2-呋喃基]甲基3,4,5-三羟基-6-(羟基甲基)四氢-2H-吡喃-2-基二氢二磷酸酯 在 CDP-D-glucose 4,6-dehydratase 、 CDP-D-paratose synthase 、 还原型辅酶II(NADPH)四钠盐 作用下， 以 phosphate buffer 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 cytidylyldiphosphate-6-deoxy-α-D-glucose
  参考文献：
  名称：

  对 CDP-d-Tyvelose 2-差向异构酶机制的新见解：未活化立体中心的酶催化差向异构化

  摘要：

  Tyvelose 是一种 3,6-二脱氧己糖，存在于 Yersinia pseudotuberculosis IVA 的 O-抗原中，并且是此类糖中唯一一种直接由另一种 3,6-双脱氧己糖，paratose 产生的糖。这种转化所需的 C-2 差向异构化已被提议由 CDP-d-泰维糖 2-差向异构酶催化。这种酶很有趣，因为它属于一组差向异构酶，包括经过充分研究的 UDP-d-半乳糖 4-差向异构酶，可以反转未激活的立体中心。为了研究这种酶的作用机制，我们克隆并表达了编码 CDP-d-tyvelose 2-epimerase 的 tyv 基因。纯化的四聚体蛋白含有大约一当量的结合 NAD+ 每个单体和一小部分 NADH。对于这种酶，可以提出四种涉及 NAD+ 的可能机制；两个涉及底物 C-2 处的氧化，而另外两个需要在 C-4 处氧化。在之前的一篇文章中，我们提供了支持由 C-4 发起的复古醇醛型机制的初步数据

  DOI：

  10.1021/ja0022021