3'-{[(tert-butoxy)carbonyl]amino}-3'-deoxythymidine 5'-(hydrogen butanedioate) | 654678-74-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3'-{[(tert-butoxy)carbonyl]amino}-3'-deoxythymidine 5'-(hydrogen butanedioate)
• 英文别名: 4-[[(2S,3S,5R)-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]oxolan-2-yl]methoxy]-4-oxobutanoic acid
• CAS: 654678-74-7
• 化学式: C₁₉H₂₇N₃O₉
• 分子量: 441.438
• InChiKey: QRSNNDYHWNNMCQ-YNEHKIRRSA-N

物化性质

• 密度：
  1.37±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.43
• 重原子数：
  31.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.63
• 拓扑面积：
  166.02
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-{[(tert-butoxy)carbonyl]amino}-3'-deoxythymidine 5'-(hydrogen butanedioate) 在 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 吡啶 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 L-alanyl-N¹-[(2S,3S,5R)-tetrahydro-2-(hydroxymethyl)-5-(1,2,3,4-tetrahydro-5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)furan-3-yl]-L-leucinamide
  参考文献：
  名称：

  二肽缀合核苷的固相合成及其与RNA的相互作用

  摘要：

  二肽缀合的核苷有效地从的中间体合成3'-氨基-3'-脱氧核苷通过使用固相合成策略用HOBt / HBTU（1-羟基-1- ħ苯并三唑/ 2-（1 ħ -苯并三唑-1-基）-1,1,3,3-四甲基尿鎓六氟硼酸酯）作为偶联剂（方案1-3）。CD光谱和热熔研究表明，合成的疏水性二肽胸苷和尿苷衍生物8a - 8d，13a - d和18与polyA·polyU双链体具有适度的亲和力，并且可以诱导RNA构象的改变。该结果还暗示缀合物与RNA的相互作用可能与核苷的糖折叠构象有关。

  DOI：

  10.1002/hlca.200390295
• 作为产物：
  描述：

  3'-氨基-2',3'-双脱氧胸苷 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 31.0h， 生成 3'-{[(tert-butoxy)carbonyl]amino}-3'-deoxythymidine 5'-(hydrogen butanedioate)
  参考文献：
  名称：

  二肽缀合核苷的固相合成及其与RNA的相互作用

  摘要：

  二肽缀合的核苷有效地从的中间体合成3'-氨基-3'-脱氧核苷通过使用固相合成策略用HOBt / HBTU（1-羟基-1- ħ苯并三唑/ 2-（1 ħ -苯并三唑-1-基）-1,1,3,3-四甲基尿鎓六氟硼酸酯）作为偶联剂（方案1-3）。CD光谱和热熔研究表明，合成的疏水性二肽胸苷和尿苷衍生物8a - 8d，13a - d和18与polyA·polyU双链体具有适度的亲和力，并且可以诱导RNA构象的改变。该结果还暗示缀合物与RNA的相互作用可能与核苷的糖折叠构象有关。

  DOI：

  10.1002/hlca.200390295