5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-(pyren-1-ylmethyl)pentanamide | 1360429-31-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 生物素及其衍生物
• 英文名称: 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-(pyren-1-ylmethyl)pentanamide
• CAS: 1360429-31-7
• 化学式: C₂₇H₂₇N₃O₂S
• 分子量: 457.596
• InChiKey: BEWSVGUUJOOKAD-MCEYFSPLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.7
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  95.5
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-芘甲胺 盐酸盐 、 D-生物素 在 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 生成 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-(pyren-1-ylmethyl)pentanamide
  参考文献：
  名称：

  通过新的enyl探针对抗生物素蛋白进行光裂解。

  摘要：

  在这项研究中，设计了一种新的基于小分子的试剂来识别并结合蛋白质中的特定位点。通过将d-生物素与1（1-pyrene）甲胺盐酸盐偶联，设计并合成了一种新的pyr探针d-生物素-1（1-py）甲基酰胺（Py-生物素）。证明了Py-生物素的结合研究和抗生物素蛋白的位点特异性光裂解。使用吸收和荧光光谱技术研究了Py-生物素与抗生物素蛋白的结合。与抗生物素蛋白结合后，观察到the基发色团的吸收峰位置发生红移，然后出现增色现象。当在342nm处照射蛋白质，Py-生物素和电子受体三氯化钴（III）六胺合钴（CoHA）的混合物时，抗生物素蛋白就会发生光裂解。在没有探针，CoHA或光的情况下，没有反应发生。

  DOI：

  10.1016/j.jphotobiol.2011.04.003

文献信息

• Photocleavage of avidin by a new pyrenyl probe
  作者：Pinpinat Malaikaew、Jisnuson Svasti、Challa V. Kumar、Apinya Buranaprapuk

  DOI：10.1016/j.jphotobiol.2011.04.003

  日期：2011.6

  avidin. The photocleavage of avidin was achieved when a mixture of the protein, Py-biotin, and an electron acceptor, cobalt(III) hexammine trichloride (CoHA), was irradiated at 342nm. No reaction occurred in the absence of the probe, CoHA, or light. N-terminal sequencing of the peptide fragments indicated a cleavage site of avidin between Thr 77 and Val 78. The high specificity of photocleavage may be valuable

  在这项研究中，设计了一种新的基于小分子的试剂来识别并结合蛋白质中的特定位点。通过将d-生物素与1（1-pyrene）甲胺盐酸盐偶联，设计并合成了一种新的pyr探针d-生物素-1（1-py）甲基酰胺（Py-生物素）。证明了Py-生物素的结合研究和抗生物素蛋白的位点特异性光裂解。使用吸收和荧光光谱技术研究了Py-生物素与抗生物素蛋白的结合。与抗生物素蛋白结合后，观察到the基发色团的吸收峰位置发生红移，然后出现增色现象。当在342nm处照射蛋白质，Py-生物素和电子受体三氯化钴（III）六胺合钴（CoHA）的混合物时，抗生物素蛋白就会发生光裂解。在没有探针，CoHA或光的情况下，没有反应发生。