生物素-PEG12-琥珀酰亚胺酯 | 1262633-93-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 生物素及其衍生物
• 中文名称: 生物素-PEG12-琥珀酰亚胺酯
• 英文名称: NHS-PEG₁₂-biotin
• 英文别名: Biotin-PEG12-NHS ester；(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]propanoate；Biotin-PEG12-NHS Ester
• CAS: 1262633-93-1；1934296-88-4
• 化学式: C₄₁H₇₂N₄O₁₈S
• 分子量: 941.105
• InChiKey: WOLXSUFTTIRQOU-BVCQTOFBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.7
• 重原子数：
  64
• 可旋转键数：
  46
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.88
• 拓扑面积：
  270
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  19

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  生物素-PEG12-琥珀酰亚胺酯 、 benzyl (-)-(6S,7S)-7-amino-3-methyl-8-oxo-5-thia-1-azabicyclo[4.2.0]oct-2-ene-2-carboxylate 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 24.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  [EN] PEPTIDE ANTIBIOTICS AND METHODS OF USE THEREOF
  [FR] ANTIBIOTIQUES PEPTIDIQUES ET LEURS MÉTHODES D'UTILISATION

  摘要：

  公开号：

  WO2020232407A9

文献信息

• Specific enrichment of nonribosomal peptide synthetase module by an affinity probe for adenylation domains
  作者：Fumihiro Ishikawa、Hideaki Kakeya

  DOI：10.1016/j.bmcl.2013.12.082

  日期：2014.2

  (NRPS)-polyketide synthase (PKS) hybrids and NRPSs. A 5′-O-sulfamoyladenosine (AMS) non-hydrolyzable analogue of adenosine monophosphate (AMP) has been reported as a scaffold for the design of inhibitors exhibiting tight binding of adenylation enzymes. Here we describe the application of an affinity probe for A domains. Our synthetic probe, a biotinylated l-Phe-AMS (l-Phe-AMS-biotin) specifically targets the

  我们针对腺苷酸化（A）域的亲和力探针的开发目标，该亲和力探针可促进非核糖体肽合成酶（NRPS）-聚酮化合物合酶（PKS）杂种和NRPSs中含有A域的模块的富集，鉴定和定量。已经报道了单磷酸腺苷（AMP）的5'- O-氨磺酰腺苷（AMS）不可水解类似物作为支架的支架，用于设计表现出腺苷酸化酶紧密结合的抑制剂。在这里，我们描述了针对A域的亲和探针的应用。我们的合成探针，一种生物素化的I -Phe-AMS（I -Phe-AMS-生物素）专门针对NRPS模块中的A结构域，从而激活I -Phe-AMS。-在重组NRPS酶系统和整个蛋白质组中均转化为氨基酰基腺苷酸中间体。
• [EN] COMPOUNDS AND THERAPEUTIC USES THEREOF<br/>[FR] COMPOSÉS ET LEURS UTILISATIONS THÉRAPEUTIQUES
  申请人：CENTAURI THERAPEUTICS LTD

  公开号：WO2017060729A1

  公开（公告）日：2017-04-13

  The invention relates to novel compounds with the ability to link an immune response to a defined therapeutic target, to the use of said compounds in treating cancer and a disease or disorder mediated and/or caused by an infective agent, to compositions containing said compounds, processes for their preparation and to novel intermediates used in said process.

  该发明涉及具有将免疫反应与特定治疗靶标联系起来的新化合物，以及将该类化合物用于治疗癌症、由感染性因子介导和/或引起的疾病或紊乱，包含该类化合物的组合物，其制备过程以及用于该过程的新中间体。
• [EN] ANTIBODIES AGAINST SEROTONIN, TRYPTOPHAN AND KYNURENINE METABOLITES AND USES THEREOF<br/>[FR] ANTICORPS DIRIGÉS CONTRE DES MÉTABOLITES DE SÉROTONINE, DE TRYPTOPHANE ET DE KYNURÉNINE ET LEURS UTILISATIONS
  申请人：NESTEC SA

  公开号：WO2016079708A1

  公开（公告）日：2016-05-26

  The present invention provides antibodies and methods for preparing antibodies to metabolites in the serotonin, tryptophan and kynurenine pathways, such as 5- hydroxyindole-3-acetic acid (5-HIAA), melatonin (MT) and kynurenic acid (KYNA). The specific metabolite antibodies have low cross-reactivity to structurally related metabolites, and are useful reagents for specific and sensitive immunoassays. The present invention also provides methods for using such antibodies to measure the levels of 5-HIAA, melatonin, or kynurenic acid in biological samples from human patients.

  本发明提供了抗体和制备抗体的方法，用于代谢物在血清素、色氨酸和酮喹酮途径中，如5-羟基吲哚-3-乙酸（5-HIAA）、褪黑激素（MT）和喹酮酸（KYNA）。特定的代谢物抗体对结构相关的代谢物具有低的交叉反应性，并且是用于特定和敏感免疫测定的有用试剂。本发明还提供了使用这些抗体来测量人类患者生物样本中5-HIAA、褪黑激素或喹酮酸水平的方法。
• Selective Targeting of the KRAS Codon 12 Mutation Sequence by Pyrrole-Imidazole Polyamide<i>seco</i>-CBI Conjugates
  作者：Rhys D. Taylor、Anandhakumar Chandran、Gengo Kashiwazaki、Kaori Hashiya、Toshikazu Bando、Hiroki Nagase、Hiroshi Sugiyama

  DOI：10.1002/chem.201501870

  日期：2015.10.12

  2‐e]indol‐4‐one conjugate (conjugate 4) designed to target the KRAS codon 12 mutation sequence. Herein, we have compared the alkylating activity of 4 against three other conjugates that were also designed to target the KRAS codon 12 mutation sequence. Conjugate 4 displayed greater affinity for the G12D mutation sequence than for the G12V sequence. A computer‐minimized model suggested that conjugate 4 could

  KRAS突变是许多癌症中的关键步骤。突变最常发生在第12位密码子上，但众所周知，靶向KRAS非常困难。最近，我们通过使用烷基化发夹证明在肿瘤携带KRAS密码子在小鼠模型12突变的体积选择性还原Ñ -methylpyrrole- Ñ甲基咪唑聚酰胺开环-1,2,9,9a-四氢[1,2 Ç设计用于靶向KRAS密码子12突变序列的] benz [1,2 - e ]吲哚-4-酮缀合物（缀合物4）。在本文中，我们比较了4的烷基化活性与其他三种针对KRAS密码子12突变序列的偶联物。共轭图4显示出对G12D突变序列的亲和力大于对G12V序列的亲和力。一个计算机最小化的模型表明，缀合物4与G12D匹配序列的结合比与单碱基对错配序列的结合更有效。共轭物4被修改用于下一代测序。Bind-n-Seq分析支持的证据表明，缀合物4可以以比野生型序列更高的亲和力靶向G12D突变序列，而以更高的亲和力靶向G12V突变序列。
• Direct Evidence for CH···π Interaction Mediated Stabilization of Pro-<i>cis</i>Pro Bond in Peptides with Pro-Pro-Aromatic motifs
  作者：Himal K. Ganguly、Barun Majumder、Sarbani Chattopadhyay、Pinak Chakrabarti、Gautam Basu

  DOI：10.1021/ja209334v

  日期：2012.3.14

  weak interactions play subtle but important roles in dictating protein structures, their experimental detection is nontrivial. From NOE experiments we provide direct evidence for the presence of CH···π interaction, operational between the C(α)-H of the first Pro and the aromatic (Aro) side chain of Xaa, in a peptide series with the general sequence Ac-Pro-Pro-Xaa-NH(2). Indirect evidence of CH···π interaction

  尽管弱相互作用在决定蛋白质结构方面起着微妙但重要的作用，但它们的实验检测并不简单。从 NOE 实验中，我们为 CH…π 相互作用的存在提供了直接证据，在具有一般序列的肽系列中，第一个 Pro 的 C(α)-H 和 Xaa 的芳族 (Aro) 侧链之间可操作Ac-Pro-Pro-Xaa-NH(2)。CH…π相互作用的间接证据来自Pro(1) C(α)-H化学位移的环电流诱导的高场位移和Xaa侧链(χ1)旋转的限制。这种相互作用的结果是当 Xaa 是芳香族时，Ac-Pro-Pro-Xaa-NH(2) 中 Pro-cisPro 构象异构体的稳定性增强。当 Xaa 为 Tyr、Trp、Phe 时，与 Pro-Pro 部分的反式到顺式转化相关的自由能分别为 0.35、0.59、0.64 和 0.82 kcal/mol，和 His（pH 值为 8.4），分别。相比之下，当 Xaa 为非芳香族时，相应的自由能约为