5'-(32)P-pCp | 74110-60-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: 5'-(32)P-pCp
• 英文别名: 5'-(32)P-cytidine 3',5'-biphosphate；O^5'-[³²P]phosphono-[3']cytidylic acid；Cytidin-3',5'-<5'-32P>biphosphat
• CAS: 74110-60-4
• 化学式: C₉H₁₅N₃O₁₁P₂
• 分子量: 404.205
• InChiKey: MVGIITUCOOTSAP-SIIOWVFQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.33
• 重原子数：
  25.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  223.89
• 氢给体数：
  6.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  胞啶3'-单磷酸 在 亚精胺 、 乙二胺四乙酸 、 T₄ PNK 、 magnesium chloride 、 1,4-二巯基-2,3-丁二醇 作用下， 反应 2.0h， 生成 5'-(32)P-pCp
  参考文献：
  名称：

  DNA 催化共价修饰束缚和游离肽底物中的氨基酸侧链

  摘要：

  本研究侧重于开发修饰肽底物侧链的 DNA 催化剂（脱氧核酶），其长期目标是实现 DNA 催化的共价蛋白质修饰。我们最近描述了几种脱氧核酶，它们通过催化与 5'-三磷酸化 RNA 的反应形成核肽键来修饰酪氨酸 (Tyr) 或丝氨酸 (Ser) 侧链。在之前的每个案例中，侧链都以高度预先组织的三维结构呈现，因此产生的脱氧核酶本质上不能与不保持预先组织的游离肽或蛋白质一起发挥作用。在这里，我们描述了催化系链和游离肽底物的 Tyr 侧链修饰的脱氧核酶的体外选择，该方法可能适用于涉及大蛋白质的催化。鉴定了几种用于 Tyr 修饰的新脱氧核酶（以及一些用于 Ser 修饰的脱氧核酶）；随着选择设计的战略性改变，观察到逐渐改善的催化活性。最好的新型脱氧核酶 15MZ36 催化游离三肽底物的共价 Tyr 修饰k obs为 0.50 h –1 ( t 1/2 of 83 min)，产率高达 65%。这些发现首次证明了涉及游离肽底物的

  DOI：

  10.1021/bi200585n