N4-benzoyl-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-(4-monomethoxytritylamino)-5'-deoxycytidine | 1384260-63-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N4-benzoyl-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-(4-monomethoxytritylamino)-5'-deoxycytidine
• CAS: 1384260-63-2
• 化学式: C₄₂H₄₈N₄O₆Si
• 分子量: 732.952
• InChiKey: HGQAEIKJYZCWJC-CBOKRJPRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.73
• 重原子数：
  53.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  123.94
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  丁二酸酐 、 N4-benzoyl-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-(4-monomethoxytritylamino)-5'-deoxycytidine 在 三乙胺 、 柠檬酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 20.0h， 以76%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  RNG寡核苷酸固相合成的胞苷基3'-末端单体的便捷合成

  摘要：

  已经显示，用带正电荷的胍鎓键取代RNA的磷酸二酯主链可以使RNA低聚物克服静电排斥并以高亲和力结合三链体中的双链DNA。已经合成了具有形成胍键的能力的核糖核苷酸单体，用于通过固相合成产生具有胍键（RNG）的核糖寡核苷酸。我们在此报告了一种合成N 4-苯甲酰基-2' - O-（叔丁基二甲基甲硅烷基）-5' - N-（4-单甲氧基三苯甲基氨基）-3'- O-琥珀酰基-5'-脱氧胞苷的有效方法。胞基RNG寡核苷酸固相合成所需的新单体。

  DOI：

  10.1016/j.tetlet.2012.05.055
• 作为产物：
  描述：

  胞苷 在 吡啶 、 三甲基氯硅烷 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 对甲苯磺酸 、 silver nitrate 、 乙二胺 、 三乙胺 、 三苯基膦 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 为溶剂， 反应 65.17h， 生成 N4-benzoyl-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-(4-monomethoxytritylamino)-5'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  RNG寡核苷酸固相合成的胞苷基3'-末端单体的便捷合成

  摘要：

  已经显示，用带正电荷的胍鎓键取代RNA的磷酸二酯主链可以使RNA低聚物克服静电排斥并以高亲和力结合三链体中的双链DNA。已经合成了具有形成胍键的能力的核糖核苷酸单体，用于通过固相合成产生具有胍键（RNG）的核糖寡核苷酸。我们在此报告了一种合成N 4-苯甲酰基-2' - O-（叔丁基二甲基甲硅烷基）-5' - N-（4-单甲氧基三苯甲基氨基）-3'- O-琥珀酰基-5'-脱氧胞苷的有效方法。胞基RNG寡核苷酸固相合成所需的新单体。

  DOI：

  10.1016/j.tetlet.2012.05.055