5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(2-N,N-dimethylaminooxyethyl)-5-methyluridine | 212061-29-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(2-N,N-dimethylaminooxyethyl)-5-methyluridine
• 英文别名: 5'-O-DMT-2'-O-(dimethylaminooxyethyl)-5-methyluridine；5'-O-dimethoxytrityl-2'-O-(dimethylaminooxyethyl)-5-methyluridine；1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[2-(dimethylaminooxy)ethoxy]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 212061-29-5
• 化学式: C₃₅H₄₁N₃O₉
• 分子量: 647.725
• InChiKey: MWGRMBHCTKNNQP-WTGZKXAYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.3
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  128
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦 、 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(2-N,N-dimethylaminooxyethyl)-5-methyluridine 生成 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O-[2(2-N,N-dimethylaminoethoxy)ethyl]-5-methyl Uridine-3-O-(cyanoethyl-N,N-diisopropyl)phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  Antisense modulation of DRAK1 expression

  摘要：

  提供了用于调节DRAK1表达的反义化合物、组合物和方法。这些组合物包括针对编码DRAK1的核酸的反义化合物，特别是反义寡核苷酸。提供了使用这些化合物调节DRAK1表达和治疗与DRAK1表达相关疾病的方法。

  公开号：

  US20030232773A1
• 作为产物：
  描述：

  L-胸苷 在 吡啶 、 碳酸二苯酯 、 4-二甲氨基吡啶 、 硼烷四氢呋喃络合物 、 4-甲基苯磺酸吡啶 、 sodium cyanoborohydride 、 碳酸氢钠 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 三乙胺 、 三苯基膦 、 甲基肼 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 67.51h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(2-N,N-dimethylaminooxyethyl)-5-methyluridine
  参考文献：
  名称：

  EFFECTS OF APOLIPOPROTEIN B INHIBITION ON GENE EXPRESSION PROFILES IN ANIMALS

  摘要：

  提供了用于调节载脂蛋白B表达的反义物质、组合物和方法。这些组合物包括针对编码载脂蛋白B的核酸的反义物质，特别是反义寡核苷酸。提供了使用这些化合物调节载脂蛋白B表达并治疗与载脂蛋白B表达相关疾病的方法。提供了用于调节涉及脂质代谢的基因表达的方法，可用于治疗与心血管风险相关的疾病。针对载脂蛋白B的反义寡核苷酸降低了载脂蛋白B mRNA水平，降低了血清胆固醇水平，并将肝脏基因表达谱从肥胖动物的表达谱转变为瘦小动物的表达谱。此外，还提供了通过反义抑制载脂蛋白B来改善受试者心血管风险的方法。还提供了使用针对载脂蛋白B的反义寡核苷酸调节细胞通路或代谢过程的方法。

  公开号：

  US20150232838A1

文献信息

• Antisense modulation of CDC14A expression
  申请人：Isis Pharmaceuticals Inc.

  公开号：US20040077085A1

  公开（公告）日：2004-04-22

  Antisense compounds, compositions and methods are provided for modulating the expression of CDC14A. The compositions comprise antisense compounds, particularly antisense oligonucleotides, targeted to nucleic acids encoding CDC14A. Methods of using these compounds for modulation of CDC14A expression and for treatment of diseases associated with expression of CDC14A are provided.

  提供了用于调节CDC14A表达的反义物化合物、组合物和方法。这些组合物包括针对编码CDC14A的核酸的反义物化合物，特别是反义寡核苷酸。提供了使用这些化合物调节CDC14A表达以及治疗与CDC14A表达相关的疾病的方法。
• 2‘-<i>O</i>-{2-[<i>N</i>,<i>N</i>-(Dialkyl)aminooxy]ethyl}- Modified Antisense Oligonucleotides
  作者：Thazha P. Prakash、Muthiah Manoharan、Andrew M. Kawasaki、Elena A. Lesnik、Stephen R. Owens、Guillermo Vasquez

  DOI：10.1021/ol006555g

  日期：2000.12.1

  [structure] Oligonucleotides with two novel modifications, 2'-O-¿2-[N, N-(dimethyl)aminooxy]ethyl¿ (2'-O-DMAOE) and 2'-O-¿2-[N, N-(diethyl)aminooxy]ethyl¿ (2'-O-DEAOE), have been synthesized. These modifications exhibit high binding affinity to target RNA (and not to DNA) and enhance the nuclease stability of oligonucleotides considerably with t(1/2) > 24 h as a phosphodiester.

  [结构]具有两个新颖修饰的寡核苷酸，2'-O-¿2-[N，N-（二甲基）氨基氧基]乙基（2'-O-DMAOE）和2'-O-¿2-[N，N -（二乙基）氨基氧基]乙基（2'-O-DEAOE）已经合成。这些修饰表现出对靶RNA（而不是DNA）的高结合亲和力，并以t（1/2）> 24 h作为磷酸二酯显着增强了寡核苷酸的核酸酶稳定性。
• Antisense modulation of cyclin-dependent kinase 6 expression
  申请人：Isis Pharmaceuticals Inc.

  公开号：US20040087523A1

  公开（公告）日：2004-05-06

  Antisense compounds, compositions and methods are provided for modulating the expression of cyclin-dependent kinase 6. The compositions comprise antisense compounds, particularly antisense oligonucleotides, targeted to nucleic acids encoding cyclin-dependent kinase 6. Methods of using these compounds for modulation of cyclin-dependent kinase 6 expression and for treatment of diseases associated with expression of cyclin-dependent kinase 6 are provided.

  提供了用于调节细胞周期依赖性激酶6表达的反义化合物、组合物和方法。这些组合物包括针对编码细胞周期依赖性激酶6的核酸的反义化合物，特别是反义寡核苷酸。提供了利用这些化合物调节细胞周期依赖性激酶6表达以及治疗与细胞周期依赖性激酶6表达相关的疾病的方法。
• Antisense modulation of PTPN12 expression
  申请人：Isis Pharmaceuticals Inc.

  公开号：US20030232434A1

  公开（公告）日：2003-12-18

  Antisense compounds, compositions and methods are provided for modulating the expression of PTPN12. The compositions comprise antisense compounds, particularly antisense oligonucleotides, targeted to nucleic acids encoding PTPN12. Methods of using these compounds for modulation of PTPN12 expression and for treatment of diseases associated with expression of PTPN12 are provided.

  提供了用于调节PTPN12表达的反义化合物、组合物和方法。这些组合物包括针对编码PTPN12的核酸的反义化合物，特别是反义寡核苷酸。提供了使用这些化合物调节PTPN12表达和治疗与PTPN12表达相关疾病的方法。
• Antisense modulation of histone deacetylase 2 expression
  申请人：Isis Pharmaceuticals Inc.

  公开号：US20030236204A1

  公开（公告）日：2003-12-25

  Antisense compounds, compositions and methods are provided for modulating the expression of histone deacetylase 2. The compositions comprise antisense compounds, particularly antisense oligonucleotides, targeted to nucleic acids encoding histone deacetylase 2. Methods of using these compounds for modulation of histone deacetylase 2 expression and for treatment of diseases associated with expression of histone deacetylase 2 are provided.

  提供了用于调节组蛋白去乙酰化酶2表达的反义物化合物、组合物和方法。这些组合物包括特别针对编码组蛋白去乙酰化酶2的核酸的反义物化合物，特别是反义寡核苷酸。提供了利用这些化合物调节组蛋白去乙酰化酶2表达并治疗与组蛋白去乙酰化酶2表达相关疾病的方法。