5-[3-(cyclopropylsulfonylamino)prop-1-yn-1-yl]-2'-deoxycytidine | 1392268-05-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-[3-(cyclopropylsulfonylamino)prop-1-yn-1-yl]-2'-deoxycytidine
• 英文别名: N-[3-[4-amino-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-5-yl]prop-2-ynyl]cyclopropanesulfonamide
• CAS: 1392268-05-1
• 化学式: C₁₅H₂₀N₄O₆S
• 分子量: 384.413
• InChiKey: FQJJHEHQSXVZAB-YNEHKIRRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.9
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  163
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧胞嘧啶核苷 在 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 N-碘代丁二酰亚胺 、 copper(l) iodide 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 5-[3-(cyclopropylsulfonylamino)prop-1-yn-1-yl]-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  探索大肠杆菌 IspE 中底物结合位点的核糖子袋：胞嘧啶和胞嘧啶类似物的基于结构的设计、合成和生物学评价

  摘要：

  用于类异戊二烯生物合成的非甲羟戊酸途径的酶是开发用于治疗重要传染病的选择性药物的有希望的目标。该途径被植物、许多真细菌和顶复门原生动物使用，包括主要的人类病原体，如恶性疟原虫和结核分枝杆菌，但不用于使用甲羟戊酸途径的人类。在这项工作中，我们报告了大肠杆菌酶 IspE 新配体的设计、合成和生物学评估。该研究的重点在于对 CDP-ME 结合位点的核糖子袋的分析。因此，我们合成了基于胞嘧啶和 2-氨基吡啶的抑制剂，具有各种取代基，靶向酶活性位点的这个子口袋。由于胞嘧啶在水溶液中表现出出乎意料的低溶解度，在保持早期研究中测量的良好结合亲和力的同时，特别努力增加了一些化合物的水溶性。体外研究表明，对大肠杆菌 IspE 的 IC50 值在低微摩尔至亚微摩尔范围内。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201200296