Diisopropyl-phosphoramidous acid (2R,3S,5R)-2-(tert-butyl-dimethyl-silanyloxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-tetrahydro-furan-3-yl ester methyl ester | 236754-85-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: Diisopropyl-phosphoramidous acid (2R,3S,5R)-2-(tert-butyl-dimethyl-silanyloxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-tetrahydro-furan-3-yl ester methyl ester
• CAS: 236754-85-1
• 化学式: C₂₃H₄₄N₃O₆PSi
• 分子量: 517.678
• InChiKey: YFJAGZTVWOSYLC-LAHROCKRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.53
• 重原子数：
  34.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.83
• 拓扑面积：
  95.02
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Diisopropyl-phosphoramidous acid (2R,3S,5R)-2-(tert-butyl-dimethyl-silanyloxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-tetrahydro-furan-3-yl ester methyl ester 在 四氮唑 、 叔丁基过氧化氢 作用下， 以 癸烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 N-[4-[[(2R,4S,5R)-4-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-5-[[[(2R,3S,5R)-2-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-methoxy-oxidophosphaniumyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]amino]-5-nitro-6-oxo-1H-pyrimidin-2-yl]-2-phenoxyacetamide
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Oligonucleotides Containing Fapy·dG (N6- (2-Deoxy-α,β-d-erythro-pentofuranosyl)-2,6- diamino-4-hydroxy-5-formamidopyrimidine)

  摘要：

  DOI：

  10.1021/ja0160952
• 作为产物：
  描述：

  氯(二异丙基氨基)甲氧基膦 、 5’-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)胸苷 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 以59%的产率得到Diisopropyl-phosphoramidous acid (2R,3S,5R)-2-(tert-butyl-dimethyl-silanyloxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-tetrahydro-furan-3-yl ester methyl ester
  参考文献：
  名称：

  含有甲脒嘧啶损伤和不可水解类似物的寡聚脱氧核苷酸的合成和表征

  摘要：

  通过固相合成和在某些情况下酶促连接制备在特定位点含有甲酰氨基嘧啶损伤和 C-核苷类似物的寡聚脱氧核苷酸。甲酰胺嘧啶损伤作为二核苷酸引入，以防止重排为其吡喃糖异构体。通过使用各自的亚磷酰胺引入包含 Fapy.dA 的 C-核苷类似物的单一非对映异构体的寡脱氧核苷酸。当与核苷酸正确的碱基配对伙伴相对时，甲酰胺嘧啶病变会降低十二聚体相对于其未修饰核苷酸对应物的 T(M)。然而，含有 Fapy.dG-dA 错误配对的双链体比由 dG-dA 组成的双链体熔解度显着更高。含有 Fapy.dA-dX 或其 C-核苷类似物的所有双链体的熔解低于含有 dA-dX 的相应复合物。

  DOI：

  10.1021/ja012135q

文献信息

• A Novel Palladium-Catalysed Coupling Strategy for the Rapid Synthesis of Nucleic Acid Analogues Bearing Modified Backbones
  作者：Sahar Abbas、Christopher J. Hayes

  DOI：10.1055/s-1999-2767

  日期：1999.7