一种有效的霍乱弧菌
神经氨酸酶(
VCNA)
抑制剂是通过采用新型的两步策略,使用基于机理的标记信息进行靶
氨基酸验证以及使用聚焦库进行的有效
抑制剂搜索而开发的。标记信息暗示了
VCNA环状结构的隐藏动力学,该结构可能是新型
抑制剂的潜在靶标。用2,3-
脱氢-
N-乙酰神经氨酸的9-
叠氮化物衍
生物(
DANA)制备了由187种化合物组成的聚焦文库,以中断标记残基环的功能。
抑制剂3c显示出有效的抑制特性,并且是
FANA(一种N
DANA的三
氟乙酰基衍
生物。用去污剂和Lineweaver-Burk图对
抑制剂进行的验证研究表明,9位取代基会与目标环部分发生疏
水性相互作用,从而在
DANA骨架上增加了非竞争性的抑制特性。该信息使我们能够设计具有3c和
FANA组合结构的化合物4。在测试的病毒,细菌和哺乳动物
神经氨酸酶中,化合物4显示出对
VCNA的最强抑制作用(K i = 73 n M,混合抑制)。