已合成
普鲁卡因酰胺衍
生物,以研究侧链在调节癌细胞中DNA甲基化
水平中的作用,并深入了解其作用机理。合成的衍
生物包括柔性的(二甲基),受约束的(
吡咯烷,
哌啶,吗啉)和平面芳香族(
吡啶,苯基)侧链基序。
普鲁卡因酰胺及其衍
生物对中性形式的脱氧
鸟苷(dG)碱的亲和力已通过在生理条件下进行差动脉冲伏安法(DPV)进行了评估。此外,分子与从活性mDN
MT-1-DNA(PDB ID-4
DA4)晶体结构获得的富含半甲基化CpG的DNA分子对接,揭示了它们在小沟的插层腔中与dG核碱基的优先非共价相互作用。在亚致死浓度下,衍
生物对dG碱基的中性和结合形式(DNA)的差异亲和力与其DNA甲基化调节特性有关。在所有衍
生物中,具有芳族苯基侧链的化合物(1)对中性形式的dG核碱基以及部分变性的富含CpG的DNA表现出最高的结合亲和力,这归因于N–H⋯O氢与
嘧啶环的氢键结合,还形成了π⋯π堆积相互作用。 dG基础。与其