2,4-dioxo-1-(O⁵-phosphono-β-D-erythro-2-deoxy-pentofuranosyl)-1,2,3,4-tetrahydro-pyrimidine-5-carbonitrile | 71186-86-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: 2,4-dioxo-1-(O⁵-phosphono-β-D-erythro-2-deoxy-pentofuranosyl)-1,2,3,4-tetrahydro-pyrimidine-5-carbonitrile
• 英文别名: 5-cyano-2'-deoxy-[5']uridylic acid；[(2R,3S,5R)-5-(5-cyano-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate
• CAS: 71186-86-2
• 化学式: C₁₀H₁₂N₃O₈P
• 分子量: 333.194
• InChiKey: MAHMBNBBSHVKPJ-XLPZGREQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.3
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  169
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-((2R,4S,5R)-4-Hydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-pyrimidine-5-carbaldehyde oxime 在 吡啶 、 水 、 三氯氧磷 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 2,4-dioxo-1-(O⁵-phosphono-β-D-erythro-2-deoxy-pentofuranosyl)-1,2,3,4-tetrahydro-pyrimidine-5-carbonitrile
  参考文献：
  名称：

  5-甲酰基-2'-脱氧尿苷的肟和二硫杂环戊烷衍生物及其5'-磷酸盐：抗病毒作用和胸苷酸合成酶抑制作用。

  摘要：

  5-甲酰基-2'-脱氧尿苷（2a）是1型或2型单纯疱疹病毒（HSV-1，HSV-2）和牛痘病毒的有效抑制剂，已转化为肟（3a）和二硫杂环戊烷（4a）衍生物。肟（3a）与针对HSV-1的甲酰基化合物一样有效，但针对HSV-2的活性却是其五分之一，对牛痘的抵抗力低100倍，对宿主细胞的毒性则低25倍。另外，化合物3a在体内抑制胸苷酸合成酶的活性比2a低约10倍（如通过对dThd和dUrd掺入宿主细胞DNA的不同抑制所反映）。二硫杂环戊烷（4a）对病毒繁殖或dThd或dUrd掺入均没有产生明显的作用，也没有细胞毒性。所有这些化合物均为5' 磷酸衍生物是胸苷酸合成酶（干酪乳杆菌）的有效体外抑制剂。抑制作用与底物竞争，Ki / Km比对于甲酰基2b为0.05，对于肟3b为0.5，对于二硫杂环戊酸酯4b为0.2。因此，作为胸苷酸合成酶的体外抑制剂，3b的活性比2b低10倍，这似乎证实了体内发现。

  DOI：

  10.1021/jm00180a016