N-Fmoc-[N-(Alloc)6-aminohexyl]glycine | 854144-37-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: N-Fmoc-[N-(Alloc)6-aminohexyl]glycine
• CAS: 854144-37-9
• 化学式: C₂₇H₃₂N₂O₆
• 分子量: 480.561
• InChiKey: DKXDINHQSVJCPC-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  677.0±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.211±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.79
• 重原子数：
  35.0
• 可旋转键数：
  13.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  105.17
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Fmoc-[δ-N(alloc)-butyl]Gly-OH 、 N-Fmoc-[N-(Alloc)6-aminohexyl]glycine 、 Fmoc-L-丙氨酸 、 Fmoc-AA-OH 、 Fmoc-L-色氨酸 、 FMOC-L-精氨酸 在 哌啶 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 (S)-2-(2-((10S,13S,16S)-20-(L-tryptophyl)-16-(3-amino-3-oxopropyl)-13-(4-aminobutyl)-10-(3-guanidinopropyl)-2,9,12,15,18-pentaoxo-1,3,8,11,14,17,20-heptaazacyclohexacosan-8-yl)acetamido)propanamide
  参考文献：
  名称：

  开发具有共享表位序列的强效骨架环肽作为类风湿性关节炎药物先导

  摘要：

  类风湿性关节炎（RA）是一种常见的人类白细胞抗原相关疾病。大多数 RA 患者在 HLA-DRB1 蛋白的 DRβ 链中有一个称为共享表位 (SE) 的五个残基序列基序。发现 SE 可激活一氧化氮 (NO) 的产生，这表明 RA 发展的可能机制。SE 的天然构象被假定为 α-螺旋，因此使用环肽来稳定这种构象可能会产生一种有效的 SE 模拟物，它具有类似药物的特性。我们提出了一种骨架环状 SE 模拟物的开发，它可以在低 nM 范围内激活 NO 产生。圆二色性分析揭示了从亲本线性肽到环状类似物的构象变化。最活跃的环状类似物对胰蛋白酶/胰凝乳蛋白酶的降解完全稳定，而线性 15 聚体类似物在 30 分钟内完全降解。这项研究的结果是一种具有类药物特性的强效环肽，可用作药物开发的模板。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2011.10.098
• 作为产物：
  描述：

  、 9-芴甲基-N-琥珀酰亚胺基碳酸酯 在 三乙胺 、 盐酸 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 N-Fmoc-[N-(Alloc)6-aminohexyl]glycine
  参考文献：
  名称：

  使用新的Alloc保护的甘氨酸构建单元合成尿素主链环状肽的新方法。

  摘要：

  利用用作天然药效基团的官能团对生物活性肽的环化通常伴随着活性的丧失。开发了骨架环化方法以克服该限制并增强药理特性。骨干环肽是通过掺入能够形成酰胺，二硫键和配位键的特殊结构单元来制备的。尿素桥通常用于通过连接两个胺官能化的侧链来制备环肽。在这里，我们介绍了尿素骨架环化作为制备骨架环肽文库的另一种方法。用于结晶的Fmoc-合成的直接方法Ñ α介绍了[ω-氨基（Alloc）-烷基]甘氨酸构建单元。制备了一组尿素主链环状糖原合酶激酶3类似物，并评估了其作为抗癌药对蛋白激酶B的抑制作用。版权所有©2010欧洲肽协会和John Wiley＆Sons，Ltd.。

  DOI：

  10.1002/psc.1218

文献信息

• Cyclic peptide inhibitors of HIV-1 integrase derived from the LEDGF/p75 protein
  作者：Zvi Hayouka、Mattan Hurevich、Aviad Levin、Hadar Benyamini、Anat Iosub、Michal Maes、Deborah E. Shalev、Abraham Loyter、Chaim Gilon、Assaf Friedler

  DOI：10.1016/j.bmc.2010.09.046

  日期：2010.12

  Restricting linear peptides to their bioactive conformation is an attractive way of improving their stability and activity. We used a cyclic peptide library with conformational diversity for selecting an active and stable peptide that mimics the structure and activity of the HIV-1 integrase (IN) binding loop from its cellular cofactor LEDGF/p75 (residues 361-370). All peptides in the library had the same primary sequence, and differed only in their conformation. Library screening revealed that the ring size and linker structure had a huge effect on the conformation, binding and activity of the peptides. One of the cyclic peptides, c(MZ 4-1), was a potent and stable inhibitor of IN activity in vitro and in cells even after 8 days. The NMR structure of c(MZ 4-1) showed that it obtains a bioactive conformation that is similar to the parent site in LEDGF/p75. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.