4-Methyl-benzoic acid (2S,3R,4R,5R)-4-acetoxy-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-tetrahydro-furan-2-ylmethyl ester | 120042-40-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 4-Methyl-benzoic acid (2S,3R,4R,5R)-4-acetoxy-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-tetrahydro-furan-2-ylmethyl ester
• 英文别名: [(2S,3R,4R,5R)-4-acetyloxy-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl 4-methylbenzoate
• CAS: 120042-40-2
• 化学式: C₂₀H₂₁N₅O₇
• 分子量: 443.416
• InChiKey: MXBYYMOSCKIJPK-YFHUEUNASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.2
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  126
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-Methyl-benzoic acid (2S,3R,4R,5R)-4-acetoxy-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-tetrahydro-furan-2-ylmethyl ester 在 4-二甲氨基吡啶 、 sodium hydroxide 、 三氟甲烷磺酰氯 、 sodium methylate 、 溶剂黄146 、 三苯基膦 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 63.92h， 生成 1-(3-amino-3-deoxy-β-D-arabinofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  结核分枝杆菌胸苷单磷酸激酶抑制剂：2'-和3'-修饰胸苷类似物的生物学评价和构象分析

  摘要：

  结核分枝杆菌胸苷单磷酸激酶 (TMPKmt) 最近被引入作为抗结核药物基于结构设计的潜在目标。基于 TMPKmt X 射线结构和先前的 SAR 研究，我们合成了核苷类似物 3a-b、6a-b、7a-b 和 8a-b，在呋喃核糖环部分的 2'-和 3'-位置进行了修饰. 令我们惊讶的是，这些类似物仅表现出中等的结合亲和力（即 Ki 介于 118 和 1260 μM 之间）。这促使我们研究这些核苷的构象特征。我们得出结论，该系列的化合物，尤其是 8a-b，强烈偏向于“北方”呋喃糖环构象，而 X 射线晶体学显示 TMPKmt 偏爱相反的“南方”构象异构体。本文涵盖了合成，2'-和3'-修饰的dT类似物的生物学评价和构象特征（即优选的环褶皱）。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2003)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200300177
• 作为产物：
  描述：

  1,2-di-O-acetyl-3-azido-3-deoxy-5-p-toluoyl-β-D-ribofuranose 、 胸腺嘧啶 在 吡啶 、 三甲基氯硅烷 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 作用下， 以 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 4-Methyl-benzoic acid (2S,3R,4R,5R)-4-acetoxy-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-tetrahydro-furan-2-ylmethyl ester
  参考文献：
  名称：

  结核分枝杆菌胸苷单磷酸激酶抑制剂：2'-和3'-修饰胸苷类似物的生物学评价和构象分析

  摘要：

  结核分枝杆菌胸苷单磷酸激酶 (TMPKmt) 最近被引入作为抗结核药物基于结构设计的潜在目标。基于 TMPKmt X 射线结构和先前的 SAR 研究，我们合成了核苷类似物 3a-b、6a-b、7a-b 和 8a-b，在呋喃核糖环部分的 2'-和 3'-位置进行了修饰. 令我们惊讶的是，这些类似物仅表现出中等的结合亲和力（即 Ki 介于 118 和 1260 μM 之间）。这促使我们研究这些核苷的构象特征。我们得出结论，该系列的化合物，尤其是 8a-b，强烈偏向于“北方”呋喃糖环构象，而 X 射线晶体学显示 TMPKmt 偏爱相反的“南方”构象异构体。本文涵盖了合成，2'-和3'-修饰的dT类似物的生物学评价和构象特征（即优选的环褶皱）。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2003)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200300177

文献信息

• [EN] MODIFIED OLIGONUCLEOTIDES AND METHODS OF USE<br/>[FR] OLIGONUCLÉOTIDES MODIFIÉS ET MÉTHODES D'UTILISATION
  申请人：ALIOS BIOPHARMA INC

  公开号：WO2018053185A1

  公开（公告）日：2018-03-22

  Modified oligonucleotides comprising modifications at the 2' and/or 3' positions(s) along with methods of making and use, e.g., against HBV are disclosed.

  修改的寡核苷酸包括在2'和/或3'位置进行修饰的方法以及制备和使用方法，例如用于对抗HBV的方法。
• [EN] MODIFIED NUCLEOSIDE PHOSPHORAMIDITES<br/>[FR] PHOSPHORAMIDITES DE NUCLÉOSIDES MODIFIÉS
  申请人：ALIOS BIOPHARMA INC

  公开号：WO2019053659A1

  公开（公告）日：2019-03-21

  The present disclosure relates to compounds and compositions containing 5'-phosphoramidite nucleoside monomers of formulae (I) and (II), and methods of making and use, wherein the substituents are as defined in the appended claims.

  本发明公开涉及包含式(I)和式(II)的5'-磷酰胺基核苷单体的化合物和组合物，以及它们的制备和使用方法，其中取代基如所附权利要求中所定义。
• WO2019175260A5
  申请人：——

  公开号：WO2019175260A5

  公开（公告）日：2022-03-14
• MODIFIED OLIGONUCLEOTIDES AND METHODS OF USE
  申请人：Alios Biopharma, Inc.

  公开号：US20180135054A1

  公开（公告）日：2018-05-17

  Modified oligonucleotides comprising modifications at the 2′ and/or 3′ positions(s) along with methods of making and use, e.g., against HBV are disclosed.