1-((1R,3R,4R,7S)-7-(benzyloxy)-1-((benzyloxy)methyl)-6-oxo-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-3-yl)-3-((benzyloxy)methyl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione | 1300590-73-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1-((1R,3R,4R,7S)-7-(benzyloxy)-1-((benzyloxy)methyl)-6-oxo-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-3-yl)-3-((benzyloxy)methyl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• CAS: 1300590-73-1
• 化学式: C₃₃H₃₃N₃O₇
• 分子量: 583.641
• InChiKey: NSZABIWITSBVAC-OFAGRQRFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.06
• 重原子数：
  43.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  110.02
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-((1R,3R,4R,7S)-7-(benzyloxy)-1-((benzyloxy)methyl)-6-oxo-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-3-yl)-3-((benzyloxy)methyl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 在 吡啶 、 palladium on carbon 、 二异丙基铵盐四氮唑 、 氢气 、 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 、 mineral oil 为溶剂， 反应 16.5h， 生成 N2'-methyl-2'-amino-3'-O-[2-cyanoethoxy(diisopropylamino)phosphino]-5'-O-dimethoxytrityl-2'-N,4'-C-oxomethylene thymidine
  参考文献：
  名称：

  Amido-bridged nucleic acids with small hydrophobic residues enhance hepatic tropism of antisense oligonucleotides in vivo

  摘要：

  描述了一种新颖的双环核苷酸构建模块——酰胺桥接核酸（AmNA）具有高可扩展性，用于丰富治疗反义寡核苷酸的药代动力学特性。

  DOI：

  10.1039/c5ob00242g
• 作为产物：
  描述：

  (3R,4S,5S)-4-(Benzyloxy)-5-((benzyloxy)methyl)-5-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2,3-diyl diacetate 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 重铬酸吡啶 、 sodium azide 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 三丁基膦 、 三氟甲烷磺酰氯 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 四丁基氟化铵 、 水 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 甲胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 96.75h， 生成 1-((1R,3R,4R,7S)-7-(benzyloxy)-1-((benzyloxy)methyl)-6-oxo-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-3-yl)-3-((benzyloxy)methyl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  BRIDGED ARTIFICIAL NUCLEOSIDE AND NUCLEOTIDE

  摘要：

  本发明的目的是提供一种新型分子用于反义疗法，该分子在体内不易受核酸酶降解，并且对目标mRNA具有高结合亲和力和特异性，能够有效调节特定基因的表达。本发明的新型人工核苷酸在2′,4′-BNA/LNA的桥接结构中引入了酰胺键。含有2′,4′-桥接人工核苷酸的寡核苷酸与已知的2′,4′-BNA/LNA具有相当的单链RNA结合亲和力，并且比LNA具有更高的核酸酶抗性。特别地，由于其比S-oligo对单链RNA的结合亲和力更强，预计将被应用于核酸药物。

  公开号：

  US20120208991A1

文献信息

• NUCLEOSIDE AND NUCLEOTIDE, HAVING NITROGEN-CONTAINING HETERCYCLE STRUCTURE
  申请人：Shionogi & Co., Ltd.

  公开号：EP2957567B1

  公开（公告）日：2019-06-05