uridine 5'-diphospho-6''-O-methyl-α-D-galactofuranose | 1375486-62-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: uridine 5'-diphospho-6''-O-methyl-α-D-galactofuranose
• 英文别名: [(2R,3R,4R,5S)-3,4-dihydroxy-5-[(1R)-1-hydroxy-2-methoxyethyl]oxolan-2-yl] [[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] hydrogen phosphate
• CAS: 1375486-62-6
• 化学式: C₁₆H₂₆N₂O₁₇P₂
• 分子量: 580.333
• InChiKey: YBLRJSDKORNXMT-VJRCMIBPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6.1
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  281
• 氢给体数：
  8
• 氢受体数：
  17

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  alkaline earth salt of/the/ methylsulfuric acid 在 无机焦磷酸酶 、 UDP-glucose pyrophosphorylase 、 potassium chloride 、 magnesium chloride 作用下， 生成 uridine 5'-diphospho-6''-O-methyl-α-D-galactofuranose
  参考文献：
  名称：

  Synthetic UDP-galactofuranose analogs reveal critical enzyme–substrate interactions in GlfT2-catalyzed mycobacterial galactan assembly

  摘要：

  分枝分散分得细胞壁的半乳糖聚合物由交替的β-(1→5)和β-(1→6)半乳糖呋喃糖残基组成，由两种双功能半乳糖呋喃糖转移酶GlfT1和GlfT2的作用组装而成，后者以UDP-半乳糖呋喃糖（UDP-Galf）作为供体底物。对合成的UDP-Galf类似物进行动力学分析确定了GlfT2（一个过程性聚合的糖苷转移酶）在识别供体底物时涉及的关键相互作用。对甲基化UDP-Galf类似物的测试表明，供体底物结合口袋在空间上显得拥挤。对脱氧UDP-Galf类似物的评估显示，C-6羟基并不是底物活性的必需部分，与UDP-Galf C-3羟基的相互作用可以使底物定向以便于转化，但似乎对底物识别没有作用，这使得3-脱氧类似物成为该酶的中等竞争抑制剂。此外，在生长的半乳糖链上添加在C-5或C-6去氧的Galf残基，或L-阿拉伯呋喃糖残基，都会导致“死锁”反应产物，这些产物不再作为酶的受体。该发现表明，GlfT2的活性需要同时识别受体底物的末端C-5和C-6羟基，这与最近基于该酶的晶体结构开发的模型一致。这些观察提供了对GlfT2活性位点中特异性蛋白质-碳水化合物相互作用的深入了解，并可能促进未来抑制剂的设计。

  DOI：

  10.1039/c2ob25159k