3'-O-(Fmoc)amino-thymidine | 1159990-35-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3'-O-(Fmoc)amino-thymidine
• 英文别名: 9H-fluoren-9-ylmethyl N-[(2R,3S,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxycarbamate
• CAS: 1159990-35-8
• 化学式: C₂₅H₂₅N₃O₇
• 分子量: 479.489
• InChiKey: UWKJVCAWXGMAMV-BHDDXSALSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.3
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  126
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-O-(Fmoc)amino-thymidine 在 吡啶 、 2-氯-1,3,2-苯并二氧磷杂环己烷-4-酮 、 三正丁胺 、 三丁基焦磷酸铵 、 水 、 碘 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.59h， 生成 3'-O-(Fmoc)amino-thymidine-5'-triphosphate
  参考文献：
  名称：

  Method for sequencing DNA and RNA by synthesis

  摘要：

  这项发明涉及核酸化学领域，更具体地涉及核酸类似物的组合物和过程领域。更具体地说，这项发明涉及一种允许通过合成测序寡核苷酸的组合物，以及利用这些组合物进行合成测序的过程。最具体地，本发明揭示了一种物质组合物，其中为核糖核苷酸和2'-脱氧核糖核苷酸的5'-三磷酸，其中3'-OH基团被3'-ONHR基团取代，且R为H或CH3基团。还公开了这些三磷酸，其中核碱基通过连接物携带报告基团，例如可用于单拷贝或多拷贝DNA测序的荧光物种，或者可通过超微显微镜可视化的标签。还公开了利用这些组合物进行合成测序的过程。

  公开号：

  US07544794B1
• 作为产物：
  描述：

  3'-O-amino-thymidine 、 9-芴甲基-N-琥珀酰亚胺基碳酸酯 在 sodium carbonate 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 反应 3.0h， 以52%的产率得到3'-O-(Fmoc)amino-thymidine
  参考文献：
  名称：

  Method for sequencing DNA and RNA by synthesis

  摘要：

  这项发明涉及核酸化学领域，更具体地涉及核酸类似物的组合物和过程领域。更具体地说，这项发明涉及一种允许通过合成测序寡核苷酸的组合物，以及利用这些组合物进行合成测序的过程。最具体地，本发明揭示了一种物质组合物，其中为核糖核苷酸和2'-脱氧核糖核苷酸的5'-三磷酸，其中3'-OH基团被3'-ONHR基团取代，且R为H或CH3基团。还公开了这些三磷酸，其中核碱基通过连接物携带报告基团，例如可用于单拷贝或多拷贝DNA测序的荧光物种，或者可通过超微显微镜可视化的标签。还公开了利用这些组合物进行合成测序的过程。

  公开号：

  US07544794B1

文献信息

• US7544794B1
  申请人：——

  公开号：US7544794B1

  公开（公告）日：2009-06-09