deoxythymidine 5'-phosphate pyridinium salt | 64108-84-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: deoxythymidine 5'-phosphate pyridinium salt
• 英文别名: Pyridine ((2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl phosphate；[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate;pyridine
• CAS: 64108-84-5
• 化学式: C₅H₅N*C₁₀H₁₅N₂O₈P
• 分子量: 401.313
• InChiKey: HQCVUBJLOIARIY-HNPMAXIBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.32
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  159
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  deoxythymidine 5'-phosphate pyridinium salt 在 吡啶 、 sodium hydroxide 作用下， 以 吡啶 、 水 为溶剂， 反应 48.08h， 生成 deoxythymidylyl-(5'-->Nα)-lysine
  参考文献：
  名称：

  寡核苷酸和核苷酸肽。四十二。核苷酸基-(P → N)-氨基酸（肽）中氨基酸的羧基的分子内影响作为其位置的函数的功效

  摘要：

  已经确定核苷酸基-(5' → N)-β-丙氨酸和-丙氨酸丙氨酸中的远程羧基不影响磷酰胺中心裂解的机制。核苷酸-(5′ → Nɛ)-赖氨酸的情况有所不同。已经表明，在 dTMP 的 3'-苯丙氨酸衍生物中，氨基酸的 α-羧基的影响仅为 5'-类似物的一半。寡核苷酸基-(Pin → N)-氨基酸中氨基酸的α-羧基也削弱了磷酰胺中心裂解的机制。

  DOI：

  10.1007/bf00579428

文献信息

• Konstantinov, V. V.; Misharin, A. Yu., Journal of Organic Chemistry USSR (English Translation), 1986, vol. 22, # 12, p. 2300 - 2306
  作者：Konstantinov, V. V.、Misharin, A. Yu.

  DOI：——

  日期：——
• Oligonucleotides and nucleotidopeptides. XLII. Efficacy of the intramolecular influence of the carboxy groups of amino acids in nucleotidyl-(P → N)-amino acids (peptides) as a function of their positions
  作者：B. A. Yuodka、L. E. Lioranchaite、V. R. Baltenas

  DOI：10.1007/bf00579428

  日期：1982.11

  has been established that remote carboxy groups in nucleotidyl-(5′ → N)-β-alanine and -alanylalanine do not affect the mechanism of the cleavage of the phosphoramide center. The situation is different in the case of nucleotidyl-(5′ → Nɛ)-lysine. It has been shown that in the 3′-phenylalanine derivative of dTMP, the influence of the α-carboxy group of the amino acid is only half as great as in the 5′-analog

  已经确定核苷酸基-(5' → N)-β-丙氨酸和-丙氨酸丙氨酸中的远程羧基不影响磷酰胺中心裂解的机制。核苷酸-(5′ → Nɛ)-赖氨酸的情况有所不同。已经表明，在 dTMP 的 3'-苯丙氨酸衍生物中，氨基酸的 α-羧基的影响仅为 5'-类似物的一半。寡核苷酸基-(Pin → N)-氨基酸中氨基酸的α-羧基也削弱了磷酰胺中心裂解的机制。